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J-GLOBAL ID：202102233644078389   整理番号：21A2172227

サトウキビ-微生物相互作用における非コード化RNAの役割【JST・京大機械翻訳】

Roles of Non-Coding RNA in Sugarcane-Microbe Interaction

著者 (16件)： Thiebaut Flavia (Laboratorio de Biologia Molecular de Plantas, Instituto de Bioquimica Medica Leopoldo de Meis, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 21941-901, Brazil) ,  Rojas Cristian A. (Universidade Federal da INTEGRACAO Latino-Americana, Foz do Iguacu 85866-000, Brazil) ,  Grativol Clicia (Laboratorio de Quimica e Funcao de Proteinas e Peptideos, Universidade Estadual do Norte Fluminense, Campos dos Goytacazes 28013-602, Brazil) ,  Calixto Edmundo P. da R. (Laboratorio de Biologia Molecular de Plantas, Instituto de Bioquimica Medica Leopoldo de Meis, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 21941-901, Brazil) ,  Motta Mariana R. (Laboratorio de Biologia Molecular de Plantas, Instituto de Bioquimica Medica Leopoldo de Meis, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 21941-901, Brazil) ,  Ballesteros Helkin G. F. (Laboratorio de Biologia Molecular de Plantas, Instituto de Bioquimica Medica Leopoldo de Meis, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 21941-901, Brazil) ,  Peixoto Barbara (Laboratorio de Biologia Molecular de Plantas, Instituto de Bioquimica Medica Leopoldo de Meis, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 21941-901, Brazil) ,  Lima Berenice N. S. De (Laboratorio de Biologia Molecular de Plantas, Instituto de Bioquimica Medica Leopoldo de Meis, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 21941-901, Brazil) ,  Vieira Lucas M. (Departamento de Ciencia da Computacao, Universidade de Brasilia, Brasilia 70910-900, Brazil) ,  Walter Maria Emilia (Departamento de Ciencia da Computacao, Universidade de Brasilia, Brasilia 70910-900, Brazil) ,  Armas Elvismary M. De (Departamento de Informatica, Pontificia Universidade Catolica do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 22451-900, Brazil) ,  Entenza Julio O. P. (Departamento de Informatica, Pontificia Universidade Catolica do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 22451-900, Brazil) ,  Lifschitz Sergio (Departamento de Informatica, Pontificia Universidade Catolica do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 22451-900, Brazil) ,  Farinelli Laurent (Fasteris SA, 1228 Plan-les-Ouates, Switzerland) ,  Hemerly Adriana S. (Laboratorio de Biologia Molecular de Plantas, Instituto de Bioquimica Medica Leopoldo de Meis, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 21941-901, Brazil) ,  Ferreira Paulo C. G. (Laboratorio de Biologia Molecular de Plantas, Instituto de Bioquimica Medica Leopoldo de Meis, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 21941-901, Brazil)
資料名： Non-Coding RNA (Web)  (Non-Coding RNA (Web))
巻： 3  号： 4  ページ： 25  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7254A  ISSN： 2311-553X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 研究は植物-微生物相互作用における非コードRNA調節の重要性を強調した。しかし,疾患応答の調節におけるサトウキビマイクロRNA(miRNAs)の役割は研究されていない。最初に,Acidovorax avenaeに感染したサトウキビのsRNAトランスクリプトームをスクリーニングした。保存および新規miRNAを同定した。さらに,小干渉RNA(siRNA)をサトウキビトランスクリプトームから差次的に発現した配列に配列させた。興味深いことに,多くのsiRNAは,A.avenaeの存在下で発現を誘導した銅輸送体遺伝子をコードする転写物に配列し,一方,siRNAはA.avenaeの存在下で抑制された。さらに,長い遺伝子間非コードRNAをmiR408の潜在的標的またはデコイとして同定した。バイオインフォマティクス分析を拡張するために,6つのmiRNAの独立した接種と発現パターンを,定量的逆転写-PCR(qRT-PCR)によって確証した。これらのmiRNAの中で,miR408-a銅-ミクロRNAは下方制御された。ラッカーゼである推定miR408標的の切断を,修飾5′RACE(cDNA末端の迅速増幅)アッセイにより確認した。MiR408は他の病原体に感染した試料においてダウンレギュレートされたが,それは有益なジアゾ栄養細菌の存在下でアップレギュレートされた。これらの結果から,miR408による調節は,微生物が病原性または有益で,それに応じて特異的miRNA仲介調節機構を誘発するかどうかのサトウキビセンシングに重要であることを示唆した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 細菌 ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  *サトウキビ ,  病原性 ,  病原体 ,  cDNA ,  ダウンレギュレーション ,  トランスクリプトーム ,  siRNA
準シソーラス用語： ラッカーゼ ,  マイクロRNA ,  非翻訳RNA ,  バイオインフォマティクス ,  低分子RNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： マイクロRNA ,  Acidovorax avenae ,  病原体 ,  ジアゾ栄養細菌 ,  siRNA

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (94件)：

• and Note Azevedo, R.A.; Carvalho, R.F.; Cia, M.C.; Gratão, P.L. Sugarcane Under Pressure: An Overview of Biochemical and Physiological Studies of Abiotic Stress. Trop. Plant Biol. 2011, 4, 42-51.
• Grivet, L.; Arruda, P. Sugarcane genomics: depicting the complex genome of an important tropical crop. Curr. Opin. Plant Biol. 2002, 5, 122-127.
• Jannoo, N.; Grivet, L.; Chantret, N.; Garsmeur, O.; Glaszmann, J.; Arruda, P.; D’Hont, A. Orthologous comparison in a gene-rich region among grasses reveals stability in the sugarcane polyploid genome. Plant J. 2007, 50, 574-585.
• Rott, P.; Bailey, A.R.; Comstock, J.C.; Croft, B.J.; Saumtally, A.S. Diseases caused by bacteria. In A Guide to Sugarcane Diseases; Editions Quae: Versailles, France, 2000; pp. 21-67.
• Chartered Management Institute (CMI). Acidovorax avenae subsp. avenae. In Distribution Maps of Plant Diseases; CMI: London, UK, 1995; p. 511.

タイトルに関連する用語 (5件)： サトウキビ ,  微生物相互作用 ,  コード化 ,  RNA ,  役割