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J-GLOBAL ID:202102233655123906   整理番号:21A1152032

ニワトリにおけるヘテロフィル/リンパ球(H/L)比のためのゲノムワイド関連研究と経路解析【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Association Study and Pathway Analysis for Heterophil/Lymphocyte (H/L) Ratio in Chicken
著者 (5件):
資料名:
巻: 11  号:ページ: 1005  発行年: 2020年 
JST資料番号: U7194A  ISSN: 2073-4425  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: スイス (CHE)  言語: 英語 (EN)
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疾病管理と予防は,家禽産業の劇的な成長における重要因子であった。ニワトリの耐病性は,免疫能に対する遺伝的選択により改善できる。血液中の異質性/リンパ球比(H/L)は,ニワトリの免疫系状態を反映する。著者らの目的は,H/L形質に関与する可能な生物学的メカニズムを同定するために,ゲノムワイド関連研究(GWAS)と経路分析を行うことであった。本研究では,H/Lに対するGWASを1317のCobbブロイラーで実施し,H/Lと関連した有意な一塩基多型(SNP)を同定した。8つのSNP(p<1/8068)は有意なレベルの関連に達した。GGA19(ニワトリ染色体19)上の有意なSNPは補体C1q結合蛋白質(C1QBP)の遺伝子であった。野生型と変異個体は,5つの同定されたSNP(p<0.05)でH/Lで有意差を示した。経路分析の結果に従って,9つの関連経路(p<0.05)を同定した。経路分析とGWASを結合することにより,QC後のすべてのSNPはH/Lの表現型変異の12.4%を説明し,H/Lに関連する52のSNPはH/Lの表現型変異の9.7%と説明された。本知見はH/Lの遺伝的調節の理解に寄与し,理論的支持を提供する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (3件):
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分子遺伝学一般  ,  牛  ,  免疫性疾患・アレルギー性疾患一般 
引用文献 (41件):
  • Cheng, H.H.; Kaiser, P.; Lamont, S.J. Integrated genomic approaches to enhance genetic resistance in chickens. Annu. Rev. Anim. Biosci. 2013, 1, 239-260.
  • Redmond, S.B.; Chuammitri, P.; Andreasen, C.B.; Palić, D.; Lamont, S.J. Genetic control of chicken heterophil function in advanced intercross lines: Associations with novel and with known Salmonella resistance loci and a likely mechanism for cell death in extracellular trap production. Immunogenetics 2011, 63, 449-458.
  • Minias, P. Evolution of heterophil/lymphocyte ratios in response to ecological and life-history traits: A comparative analysis across the avian tree of life. J. Anim. Ecol. 2019, 88, 554-565.
  • Al-Murrani, W.K.; Kassab, A.; Al-Sam, H.Z.; Al-Athari, A.M.K. Heterophil/lymphocyte ratio as a selection criterion for heat resistance in domestic fowls. Br. Poult. Sci. 1997, 38, 159-163.
  • McFarlane, J.M.; Curtis, S.E. Multiple concurrent stressors in chicks.3. Effects on plasma corticosterone and the Heterophil: Lymphocyte ratio. Poult. Sci. 1989, 68, 522-527.
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