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J-GLOBAL ID：202102233786253420   整理番号：21A1150592

真核生物遺伝子は,原核生物遺伝子よりは複合体に類似している【JST・京大機械翻訳】

Eukaryote Genes Are More Likely than Prokaryote Genes to Be Composites

著者 (3件)： Ou Yaqing (Division of Evolution and Genomic Sciences, School of Biological Sciences, Faculty of Biology, Medicine and Health, The University of Manchester, Manchester M13 9PL, UK) ,  McInerney James O. (Division of Evolution and Genomic Sciences, School of Biological Sciences, Faculty of Biology, Medicine and Health, The University of Manchester, Manchester M13 9PL, UK) ,  McInerney James O. (School of Life Sciences, University of Nottingham, Nottingham NG7 2UH, UK)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 10  号： 9  ページ： 648  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 既存の遺伝子の部分を結合することによる新しい遺伝子の形成は重要な進化過程である。複合材料と呼ぶリモデリング遺伝子は,多くの種で研究されているが,それらの全寿命にわたる分布はまだ知られていない。細胞及び移動性遺伝要素由来のゲノムが複合遺伝子を含む程度を調べた。少なくとも2つの無関係な成分遺伝子に部分的相同性を示すものとして,複合遺伝子を同定した。複合および成分遺伝子を同定するために,著者らは,ウイルスおよびプラスミドと同様に,生命の全3つのドメインから1百万以上の遺伝子の配列類似性ネットワーク(SSNs)を構築した。このネットワークにおけるノードの非遷移三重項を同定し,中間ノードが実際に複合遺伝子であるかどうかを見るために,これらの三重項における相同性関係を調べた。全体で,著者らは,すべてのゲノムおよび機能的カテゴリーにわたって分布する221,043(18.57%)の複合体遺伝子を同定した。特に,複合遺伝子の存在は原核生物よりも真核生物において統計的に高い。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 複合材料 ,  ネットワーク ,  *遺伝子 ,  ゲノム ,  *複合体 ,  プラスミド ,  *真核生物 ,  *原核生物 ,  類似性 ,  相同性
準シソーラス用語： リモデリング ,  ドメイン構造 ,  移動性 ,  進化過程 ,  中間ノード , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： 複合遺伝子 ,  シーケンス類似性ネットワーク ,  オッズ比試験

分類 (3件)： 微生物の生化学  (EG03020N) ,  進化論一般  (EC03010Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (31件)：

• Nelson-Sathi, S.; Dagan, T.; Landan, G.; Janssen, A.; Steel, M.; McInerney, J.O.; Deppenmeier, U.; Martin, W.F. Acquisition of 1000 eubacterial genes physiologically transformed a methanogen at the origin of Haloarchaea. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2012, 109, 20537-20542.
• Oakley, T.H. Furcation and fusion: The phylogenetics of evolutionary novelty. Dev. Biol. 2017, 431, 69-76.
• Linder, C.R.; Moret, B.M.E.; Nakhleh, L.; Warnow, T. Network (reticulate) evolution: Biology, models, and algorithms. In Proceedings of the Ninth Pacific Symposium on Biocomputing (PSB), Big Island, HI, USA, 6-10 January 2004.
• Corel, E.; Lopez, P.; Méheust, R.; Bapteste, E. Network-Thinking: Graphs to Analyze Microbial Complexity and Evolution. Trends Microbiol. 2016, 24, 224-237.
• Bastian, M.; Heymann, S.; Jacomy, M. Gephi: An Open Source Software for Exploring and Manipulating Networks. In Proceedings of the Third International AAAI Conference on Weblogs and Social Media, San Jose, CA, USA, 17-20 May 2009.

タイトルに関連する用語 (5件)： 真核生物 ,  遺伝子 ,  原核生物 ,  複合体 ,  類似