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J-GLOBAL ID：202102235711432937   整理番号：21A2844389

中東呼吸器症候群コロナウイルス(MERS-CoV)のスパイク遺伝子におけるN末端ドメインの分子進化と構造マッピング【JST・京大機械翻訳】

Molecular Evolution and Structural Mapping of N-Terminal Domain in Spike Gene of Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV)

著者 (8件)： Naeem Asif (Department of Research Laboratories, Research Center, King Fahad Medical City, Riyadh 59046, Saudi Arabia) ,  Hamed Maaweya E. (Department of Microbiology, College of Science, King Saud University, Riyadh 11451, Saudi Arabia) ,  Alghoribi Majed F. (Infectious Diseases Research Department, King Abdullah International Medical Research Center, Riyadh 11481, Saudi Arabia) ,  Aljabr Waleed (Department of Research Laboratories, Research Center, King Fahad Medical City, Riyadh 59046, Saudi Arabia) ,  Alsaran Hadel (Department of Research Laboratories, Research Center, King Fahad Medical City, Riyadh 59046, Saudi Arabia) ,  Enani Mushira A. (Medical Specialties Department, King Fahad Medical City, Riyadh 59046, Saudi Arabia) ,  Alosaimi Bandar (Department of Research Laboratories, Research Center, King Fahad Medical City, Riyadh 59046, Saudi Arabia) ,  Alosaimi Bandar (Department of Basic Medical Sciences, College of Medicine, King Fahad Medical City, Riyadh 59046, Saudi Arabia)
資料名： Viruses (Web)  (Viruses (Web))
巻： 12  号： 5  ページ： 502  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7293A  ISSN： 1999-4915  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 中東呼吸器症候群コロナウイルス(MERS-CoV)は,2012年以降アラビア半島で循環する致死的な人畜共通病原体である。MERSに対するワクチンはなく,抗ウイルス治療は一般的に適用できない。2015~2017年のサウジアラビアにおける患者から,MERS-CoVスパイク遺伝子配列の進化およびウイルス負荷の変化を検討した。すべてのMERS-CoV株は系統5に属し,2017株に高い配列相同性(99.9%)を示した。再結合分析はサウジアラビアの患者の研究株における潜在的組換え事象を示した。スパイク遺伝子は,特にA1とB5系統の間で8つのアミノ酸置換を示し,陽性選択コドン1020を含んでいた。著者らはまた,ウイルス負荷が致死症例で有意に(p<0.001)高く,ウイルス排出が21日を超える死亡例において延長されたことを決定した。ウイルス濃度は病気の最初の週にピークに達し,低呼吸標本はMERS-CoV RNAのより高いレベルを有した。精製選択下の残基の構造的マッピングによる多様化選択とトポロジーの存在は,コドン1020が,異なる系統の分岐の間のスパイク遺伝子の進化に役割を持つかもしれないことを示唆した。本研究は,MERS-CoVの進化の理解を改善し,また,ヒトおよびドロームにおける監視強化の必要性を強調する。N末端ドメインでのアミノ酸変化の存在とヘプタド反復1での陽性選択下の残基の構造マッピングは,スパイク遺伝子の適応進化へのより良い洞察を提供し,ウイルス-宿主指向性と病因において潜在的役割を持つかもしれない。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 位相幾何学 ,  再結合 ,  アミノ酸 ,  RNA【核酸】 ,  *遺伝子 ,  コドン ,  死 ,  ヒト ,  ワクチン ,  *分子進化 ,  病原体 ,  病因
準シソーラス用語： アミノ酸置換 ,  遺伝子配列 ,  残基 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 中東呼吸器症候群コロナウイルス ,  進化 ,  ウイルス負荷 ,  スパイク遺伝子

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  呼吸器の疾患  (GI03000Z)

引用文献 (60件)：

• Zaki, A.M.; van Boheemen, S.; Bestebroer, T.M.; Osterhaus, A.D.; Fouchier, R.A. Isolation of a novel coronavirus from a man with pneumonia in Saudi Arabia. N. Engl. J. Med. 2012, 367, 1814-1820.
• De Groot, R.J.; Baker, S.C.; Baric, R.S.; Brown, C.S.; Drosten, C.; Enjuanes, L.; Fouchier, R.A.M.; Galiano, M.; Gorbalenya, A.E.; Memish, Z.A.; et al. Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV): Announcement of the Coronavirus Study Group. J. Virol. 2013, 87, 7790-7792.
• Al-Abdallat, M.M.; Payne, D.C.; Alqasrawi, S.; Rha, B.; Tohme, R.A.; Abedi, G.R.; Nsour, M.A.; Iblan, I.; Jarour, N.; Farag, N.H.; et al. Hospital-associated outbreak of middle East respiratory syndrome coronavirus: A serologic, epidemiologic, and clinical description. Clin. Infect. Dis. 2014, 59, 1225-1233.
• World Health Organization. Update and Clarification on Recent MERS Cases Reported by the Kingdom of Saudi Arabia. 2019. Available online: http://who.int/emergencies/mers-cov/saudi-arabia-update/en/ (accessed on 24 December 2019).
• Alosaimi, B.; Hamed, M.; Naeem, A. Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV): Transmission Dynamics and Prospects for Vaccine Development. EC Microbiol. J. 2019, 15, 109-119.

タイトルに関連する用語 (8件)： 中東呼吸器症候群コロナウイルス ,  MERS ,  スパイク ,  遺伝子 ,  N末端 ,  ドメイン ,  分子進化 ,  マッピング