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J-GLOBAL ID：202102235743443464   整理番号：21A0023816

ヒト歯髄幹細胞の歯原性分化に関与する長鎖非コードRNAとその競合内因性RNAネットワークのゲノムワイド同定【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide identification of long noncoding RNAs and their competing endogenous RNA networks involved in the odontogenic differentiation of human dental pulp stem cells

著者 (11件)： Chen Zhao (Department of Stomatology, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Zhang Kaiying (Department of Stomatology, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Qiu Wei (Department of Stomatology, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Luo Yifei (Department of Stomatology, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Pan Yuhua (Department of Stomatology, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Li Jianjia (Department of Stomatology, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Yang Yeqing (Department of Stomatology, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Wu Buling (Department of Stomatology, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Wu Buling (College of Stomatology, Southern Medical University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Fang Fuchun (Department of Stomatology, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Fang Fuchun (College of Stomatology, Southern Medical University, Guangzhou, People’s Republic of China)
資料名： Stem Cell Research & Therapy (Web)  (Stem Cell Research & Therapy (Web))
巻： 11  号： 1  ページ： 1-15  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7397A  ISSN： 1757-6512  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 長鎖非コードRNA(lncRNA)は間葉系幹細胞(MSC)の多重分化において重要な役割を果たす。しかし,ヒト歯髄幹細胞(hDPSC)の歯原性分化におけるlncRNAの調節機構に焦点を当てた研究はほとんどない。hDPSCをin vitroで象牙芽細胞に分化させ,分化および未分化細胞におけるlncRNA,マイクロRNA(miRNA)およびメッセンジャーRNA(mRNA)の発現プロファイルをマイクロアレイにより得た。遺伝子オントロジー(GO)分析,経路分析,および結合部位予測を含むバイオインフォマティクス解析をlncRNAの機能的アノテーションのために実施した。miRNA/象牙質形成関連遺伝子ネットワークとlncRNA関連ceRNAネットワークを構築した。定量的逆転写ポリメラーゼ鎖反応(qRT-PCR)を用いて,選択した遺伝子の発現を検証した。RNA蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH),qRT-PCR,およびウェスタンブロット分析を用いて,lncRNA-G043225の位置と機能を調査した。二重ルシフェラーゼレポーターアッセイを行い,miR-588とG043225およびフィブリリン1(FBN1)の結合部位を確認した。132のlncRNAs,114のmiRNAsを同定し,172のmRNAは差次的に発現した。GO分析は,神経原性遺伝子座ノッチ相同体(Notch),Wntおよび上皮成長因子受容体(ERBB)シグナリング経路の調節およびマイトジェン活性化蛋白質キナーゼ(MAPK)活性の活性化が,歯原性分化と関係することを示した。経路分析は,最も有意な経路が,歯原性分化と関係するフォークヘッドボックスO(FoxO)シグナリング経路であることを示した。2つの象牙形成関連遺伝子中心lncRNA関連ceRNAネットワークの構築に成功した。qRT-PCR検証結果はマイクロアレイ分析と一致した。主に細胞質に位置するG043225は,miR-588およびFBN1を介してhDPSCの歯原性分化を促進することが証明された。これは,マイクロアレイを用いたhDPSCの歯原性分化中のlncRNA関連ceRNAネットワークを明らかにする最初の研究であり,幹細胞に基づく象牙質再生のための新規治療と同様に,RNA-RNAレベルでの作用機構を探索する手がかりを提供することができた。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ネットワーク ,  *RNA【核酸】 ,  mRNA ,  遺伝子 ,  ヒト ,  *分化 ,  結合部位 ,  in vitro実験 ,  PCR法 ,  MAPキナーゼ ,  ウェスタンブロット法 ,  DNAマイクロアレイ ,  間葉系幹細胞
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  マイクロアレイ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 競合する内因性RNA ,  ヒト歯髄幹細胞 ,  長鎖非コードRNA ,  マイクロRNA ,  歯原性分化

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (54件)：

• Proc Natl Acad Sci U S A; Postnatal human dental pulp stem cells (DPSCs) in vitro and in vivo; S Gronthos, M Mankani, J Brahim, PG Robey, S Shi; 97; 2000; 13625-13630; 10.1073/pnas.240309797; citation_id=CR1
• Oral Dis; Stem cells and the dental pulp: potential roles in dentine regeneration and repair; AJ Sloan, AJ Smith; 13; 2007; 151-157; 10.1111/j.1601-0825.2006.01346.x; citation_id=CR2
• Int J Oral Sci; Mesenchymal stem cells and tooth engineering; L Peng, L Ye, XD Zhou; 1; 2009; 6-12; 10.4248/ijos.08032; citation_id=CR3
• Methods Mol Biol; Dental pulp stem cell (DPSC) isolation, characterization, and differentiation; F Ferro, R Spelat, CS Baheney; 1210; 2014; 91-115; 10.1007/978-1-4939-1435-7_8; citation_id=CR4
• Stem Cells; Concise review: dental pulp stem cells: a novel cell therapy for retinal and central nervous system repair; B Mead, A Logan, M Berry, W Leadbeater, BA Scheven; 35; 2017; 61-67; 10.1002/stem.2398; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (10件)： ヒト ,  歯髄幹細胞 ,  歯 ,  性分化 ,  長鎖非コードRNA ,  競合 ,  内因性 ,  RNA ,  ゲノム ,  同定