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J-GLOBAL ID：202102236680819178   整理番号：21A0572647

ヤギにおける褐色から白色脂肪組織への移行の参照遺伝子を同定するためのRNA-Seqの利用【JST・京大機械翻訳】

Using RNA-Seq to Identify Reference Genes of the Transition from Brown to White Adipose Tissue in Goats

著者 (11件)： Wang Linjie (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China) ,  Chen Xingyue (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China) ,  Song Tianzeng (Institute of Animal Science, Tibet Academy of Agricultural and Animal Husbandry Science, Lhasa 850009, Tibet, China) ,  Zhang Xujia (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China) ,  Zhan Siyuan (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China) ,  Cao Jiaxue (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China) ,  Zhong Tao (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China) ,  Guo Jiazhong (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China) ,  Li Li (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China) ,  Zhang Hongping (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China) ,  Wang Yan (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China)
資料名： Animals (Web)  (Animals (Web))
巻： 10  号： 9  ページ： 1626  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7131A  ISSN： 2076-2615  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 褐色脂肪組織は,独特の非シベリング熱発生機能を有し,新生児の反芻動物で見出され,その後,成体の白色脂肪組織により徐々に置換される。褐色(BAT)から白色脂肪組織(WAT)への変換過程の基礎となる内因性機構を探索する目的で,遺伝子発現プロファイリングを研究するために定量的PCR(qPCR)を利用する必要がある。本研究では,RNA-seqデータを用いてヤギBATからWATへの変換時に一貫して発現する参照遺伝子を同定した。次に,12の遺伝子を3つのツール(geNorm,Normfinder,およびBestKeeper)を用いてヤギ腎周囲脂肪組織におけるqPCRのための候補参照遺伝子として評価した。さらに,選択した参照遺伝子を用いて,PGC-1およびGPAT4の遺伝子発現を正常化した。GAPDH,RPLP0,HPRT1,およびPPIAのような従来の参照遺伝子は,標的遺伝子正常化に適していないことがわかった。対照的に,RNA配列決定データから選択したCTNNB,PFDN5,およびEIF3Mは,最小の変化を示し,BATからWATへの変換時の最良の参照遺伝子として推奨された。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *RNA【核酸】 ,  *遺伝子 ,  *脂肪組織 ,  新生児 ,  反芻動物 ,  グリセルアルデヒドリン酸デヒドロゲナーゼ ,  成体 ,  発熱 ,  褐色脂肪組織 ,  遺伝子発現 ,  定量的PCR法
準シソーラス用語： 遺伝子発現プロファイリング ,  標的遺伝子 ,  *白色脂肪組織 ,  *参照遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ヤギ ,  褐色脂肪組織 ,  参照遺伝子 ,  ノルムファインダ ,  ベストキーパー ,  geノルム

分類 (1件)： 脂質の代謝と栄養  (EJ02034Q)

引用文献 (35件)：

• Helga, S.; Emoke, B.; Laura, R.; Fabrizio, C. The Adipose Tissue in Farm Animals: A Proteomic Approach. Curr. Protein Pept. Sci. 2014, 15, 146-155.
• Peirce, V.; Carobbio, S.; Vidal-Puig, A. The Different Shades of Fat. Nature 2014, 510, 76-83.
• Wu, J.; Boström, P.; Sparks, L.M.; Ye, L.; Choi, J.H.; Giang, A.-H.; Khandekar, M.; A Virtanen, K.; Nuutila, P.; Schaart, G.; et al. Beige Adipocytes are a Distinct Type of Thermogenic Fat Cell in Mouse and Human. Cell 2012, 150, 366-376.
• Symonds, M.; Pope, M.; Budge, H. The Ontogeny of Brown Adipose Tissue. Annu. Rev. Nutr. 2015, 35, 295-320.
• Louveau, I.; Perruchot, M.-H.; Bonnet, M.; Gondret, F. Invited Review: Pre- and Postnatal Adipose Tissue Development in Farm Animals: From Stem Cells to Adipocyte Physiology. Anim. Int. J. Anim. Biosci. 2016, 10, 1839-1847.

タイトルに関連する用語 (7件)： ヤギ ,  褐色 ,  白色脂肪組織 ,  移行 ,  参照遺伝子 ,  同定 ,  RNA-seq