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J-GLOBAL ID：202102237834997219   整理番号：21A2842907

初代ニワトリB細胞におけるマレック病ウイルスの転写景観は新規スプライス変異体と遺伝子を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

The Transcriptional Landscape of Marek’s Disease Virus in Primary Chicken B Cells Reveals Novel Splice Variants and Genes

著者 (9件)： Bertzbach Luca D. (Institute of Virology, Freie Universitaet Berlin, Robert von Ostertag-Strasse 7-13, 14163 Berlin, Germany) ,  Pfaff Florian (Institute of Diagnostic Virology, Friedrich-Loeffler-Institut, Federal Research Institute for Animal Health, Suedufer 10, 17493 Greifswald-Insel Riems, Germany) ,  Pauker Viktoria I. (Institute of Molecular Virology and Cell Biology, Friedrich-Loeffler-Institut, Federal Research Institute for Animal Health, Suedufer 10, 17493 Greifswald-Insel Riems, Germany) ,  Kheimar Ahmed M. (Institute of Virology, Freie Universitaet Berlin, Robert von Ostertag-Strasse 7-13, 14163 Berlin, Germany) ,  Kheimar Ahmed M. (Department of Poultry Diseases, Faculty of Veterinary Medicine, Sohag University, Sohag 82424, Egypt) ,  Hoper Dirk (Institute of Diagnostic Virology, Friedrich-Loeffler-Institut, Federal Research Institute for Animal Health, Suedufer 10, 17493 Greifswald-Insel Riems, Germany) ,  Haertle Sonja (Department of Veterinary Sciences, Institute for Animal Physiology, Ludwig-Maximilians-Universitaet Muenchen, 80539 Munich, Germany) ,  Karger Axel (Institute of Molecular Virology and Cell Biology, Friedrich-Loeffler-Institut, Federal Research Institute for Animal Health, Suedufer 10, 17493 Greifswald-Insel Riems, Germany) ,  Kaufer Benedikt B. (Institute of Virology, Freie Universitaet Berlin, Robert von Ostertag-Strasse 7-13, 14163 Berlin, Germany)
資料名： Viruses (Web)  (Viruses (Web))
巻： 11  号： 3  ページ： 264  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7293A  ISSN： 1999-4915  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Mareks病ウイルス(MDV)はニワトリに感染し,家禽の健康に深刻な脅威をもたらす発癌性アルファヘルペスウイルスである。感染動物において,MDVは種々のリンパ器官においてB細胞で効率的に複製する。多くの研究にもかかわらず,MDVの一次標的細胞におけるウイルストランスクリプトームは不明のままである。本研究では,高処理RNA配列決定を用いて,初代ニワトリB細胞における非常に毒性のRB1B株および弱毒化CVI988/Rissワクチン株の転写景観を明らかにした。本データは既知遺伝子の発現を確認したが,ゲノムのユニークな短い領域における新規スプライスMDV遺伝子を同定した。さらに,de novoトランスクリプトーム集合は,コードおよび非コードRNA転写物をもたらすウイルス遺伝子の広範なスプライシングを明らかにした。MDV UL15の新規スプライシングイソ型も,質量分析およびRT-PCRにより確認した。さらに,関連する転写モチーフは高度に保存され,宿主転写機構のそれらに密接に似ていることを示した。まとめると,著者らのデータは,MDV複製および腫瘍形成に関するさらなる研究で標的化できる新規遺伝子およびスプライス変異体を有するMDVゲノムの包括的な再注釈を可能にする。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 質量分析 ,  RNA【核酸】 ,  *遺伝子 ,  発癌性 ,  リンパ ,  ゲノム ,  家禽 ,  *Marek病ウイルス ,  ターゲティング ,  ウイルス遺伝子 ,  腫瘤形成 ,  アノテーション ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： 非翻訳RNA ,  *スプライスバリアント , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (9件)： マレック病ウイルス(MDV) ,  RNA-seq ,  トランスクリプトーム ,  スプライシング ,  ポリシストロンウイルス転写物 ,  一次B細胞 ,  RB1B ,  CVI988/リスペン ,  ICP0

分類 (2件)： 鶏  (FD03020F) ,  ウイルスによる動物の伝染病  (FE02024R)

引用文献 (81件)：

• Nair, V. Evolution of Marek’s disease-A paradigm for incessant race between the pathogen and the host. Vet. J. 2005, 170, 175-183.
• Davison, T.F.; Nair, V. Marek’s Disease: An Evolving Problem; Elsevier: Amsterdam, The Netherlands, 2004.
• Davison, F.; Nair, V. Use of Marek’s disease vaccines: Could they be driving the virus to increasing virulence? Expert Rev. Vaccines 2005, 4, 77-88.
• Witter, R.L. Increased virulence of Marek’s disease virus field isolates. Avian Dis. 1997, 41, 149-163.
• Baigent, S.J.; Nair, V.K.; Le Galludec, H. Real-time PCR for differential quantification of CVI988 vaccine virus and virulent strains of Marek’s disease virus. J. Virol. Methods 2016, 233, 23-36.

タイトルに関連する用語 (7件)： ニワトリ ,  B細胞 ,  マレック病ウイルス ,  転写 ,  景観 ,  スプライス変異体 ,  遺伝子