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J-GLOBAL ID：202102238691807211   整理番号：21A2350313

Rheum nobileの完全な葉緑体ゲノム【JST・京大機械翻訳】

The complete chloroplast genome of Rheum nobile

著者 (2件)： Chen Qiao (School of Pharmacy, Lanzhou University, Lanzhou, China) ,  Li Ying (State Key Laboratory of Grassland Agro-Ecosystem, College of Life Sciences, Lanzhou University, Lanzhou, China)
資料名： Mitochondrial DNA Part B  (Mitochondrial DNA Part B)
巻： 5  号： 2  ページ： 1519-1520  発行年： 2020年 
JST資料番号： W6006A  ISSN： 2380-2359  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Rheum nobileは,ギルドハウス植物における高山適応を研究するためのモデル種である。本研究では,R.nobileの完全な葉緑体(cp)ゲノムを次世代シークエンシングに基づいて組み立てた。cpゲノムは,161,250bpの長さで,86,290bpの大単一コピー(LSC)領域,12,838bpの小さい単一コピー(SSC)領域,および31,061bpのそれぞれ1対の逆反復(IR)を含む。ゲノムは,82の蛋白質コード遺伝子,35のtRNA遺伝子と8つのリボソームRNA遺伝子を含む127の遺伝子を含んだ。大部分の蛋白質コード遺伝子は単一エキソンを含んでいた;2つのエキソンと4つの遺伝子を含む10の遺伝子だけが3つのエキソン(すなわちycf3)を持っていた。葉緑体ゲノムの全GC含有量は37.29%であったが,LSC,SSCおよびIR領域の対応する値は,それぞれ35.33%,32.39%および41.03%であった。系統発生分析は,R.nobileが研究に含まれる他の3つのRheum種でクラスタ化され,RheumがOxyriaに密接に関連していることを示した。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  *葉緑体 ,  タンパク質 ,  系統発生 ,  クラスタ化 ,  *ゲノム ,  rRNA遺伝子
準シソーラス用語： *Rheum ,  系統解析 ,  *葉緑体ゲノム ,  tRNA遺伝子 ,  次世代シークエンシング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： Rheum nobile ,  葉緑体ゲノム ,  系統発生解析

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (2件)： Rheum ,  葉緑体ゲノム