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J-GLOBAL ID：202102238754923501   整理番号：21A0394607

ERIC-PCR技術とMLST技術による30株のカルバペネム耐性肺炎桿菌に対する遺伝子タイピング結果を観察した。【JST・京大機械翻訳】

Performance comparison of ERIC-PCR and MLST in genotyping of 30 strains of Klebsiella pneumoniae

著者 (4件)： Wang Fang (連云港市第二人民医院,江蘇連云港222000) ,  Wu Xinming (連云港市第二人民医院,江蘇連云港222000) ,  Wang Yan (連云港市第二人民医院,江蘇連云港222000) ,  Liang Wei (連云港市第二人民医院,江蘇連云港222000)
資料名： Shandong Yiyao  (Shandong Yiyao)
巻： 60  号： 30  ページ： 35-39  発行年： 2020年 
JST資料番号： C3661A  ISSN： 1002-266X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:エンテロバクター遺伝子間反復コンセンサス配列PCR(ERIC-PCR)技術と多遺伝子座配列タイピング技術(MLST)技術を用い、カルバペネム耐性肺炎桿菌株の遺伝子タイピングを分析し、臨床薬品使用と院感制御に根拠を提供する。方法:VITEK-2細菌分析計を用いて、30株のカルバペネム耐性肺炎桿菌菌株のアミカシン、アンピシリンなどの16種類の抗菌薬に対する薬剤耐性を測定した。30株のゲノムDNAを抽出し、菌株ゲノムテンプレートを作製し、カルバペネマーゼ遺伝子(KPC-2、NDM-1、IMP、VIM、OXA)を増幅し、増幅陽性産物に対してシークエンシングを行い、得られた配列はNCBIサイトでBlastアラインメントを行った。カルバペネム耐性遺伝子の遺伝子型を決定した。ERIC-PCR遺伝子タイピング法:腸内細菌遺伝子間コンセンサス反復配列ERIC設計プライマーにより、30株の肺炎桿菌に対して遺伝子タイピングを行い、NTSYSソフトウェアを用いてERIC-PCRで得られた電気泳動図に対してクラスター分析を行った。MLST遺伝子タイピング法:肺炎桿菌を増幅する7つのハウスキーピング遺伝子(rpoB、gapA、mdh、pgi、phoE、infBとtonB)の断片を増幅し、増幅断片の塩基配列決定とデータベースデータとの比較により対立遺伝子スペクトルを得て、相応の配列型(ST)を得た。【結果】アンピシリン,アンピシリン/スルバクタム,アズトレオナム,セフタジジム,セファゾリン,セフェピム,イミペネム,およびピペラシリン/タゾバクタムに対するカルバペネム耐性肺炎桿菌の耐性率は,100%であり,アミカシンとネオノキサゾールの耐性率は76であった。6%、その他の薬物の薬剤耐性は両者の間にある。30株はすべて多剤耐性菌であり、16種類の薬物のうち、薬剤耐性率は76.6%100%であった。KPC-2遺伝子の増幅は30株のうち25株で陽性であり,2株ではNDM遺伝子増幅が陽性で,1株ではKPC-2,NDM-1遺伝子,2株ではカルバペネマーゼ遺伝子は検出されなかった。5つのST型(ST11(83.3%,25/30)),ST641(6.6%,2/30),ST76(3.3%,1/30),ST392(3.3%)を含む5つのST型が,30のカルバペネム耐性肺炎桿菌のMLSTに分類された。1/30)とST1322(3.3%,1/30);ERIC-PCRは,A型(83.3%,25/30),B型(6.6%,2/30),C型(3.3%,1/30),D型(3.3%,1/30)およびE型(3.3%,1/30)の5つの型に分類された。【結論】カルバペネム耐性肺炎桿菌の30株は多剤耐性菌であった。ERIC-PCRとMLST分類は肺炎桿菌の遺伝子タイピングにおける分解能は同じである。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  遺伝子型 ,  抗細菌薬 ,  ヌクレオチド配列 ,  薬物耐性 ,  *肺炎桿菌 ,  Enterobacter ,  反復配列 ,  アミノ糖 ,  糖アルコール ,  カルボアミド ,  デオキシ糖 ,  ピラノシド ,  グルコシド ,  三糖類 ,  アミノアルコール ,  アミノカルボン酸 ,  第一アミン ,  ヒドロキシ酸 ,  スルフィド ,  ラクタム ,  第二アルコール ,  アミノ酸 ,  芳香族化合物 ,  硫黄複素環化合物
準シソーラス用語： 多剤耐性菌 ,  *多座位配列タイピング ,  カルバペネマーゼ ,  *カルバペネム耐性 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (5件)： 微生物感染の生理と病原性  (EG03053T) ,  微生物学(ウイルス以外)一般  (EG03010C) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  酵素一般  (EB09010D) ,  病原体に作用する抗生物質の基礎研究  (GX05020C)

物質索引 (3件)： アミカシン ,  イミペネム ,  アンピシリン

タイトルに関連する用語 (5件)： MLST ,  カルバペネム耐性 ,  肺炎桿菌 ,  遺伝子タイピング ,  観察