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J-GLOBAL ID：202102239971816359   整理番号：21A2842105

Micromonas pusillaに感染するウイルスの遺伝的レパートリーの変化は水平遺伝子導入を反映し,それらの環境分布に関連する【JST・京大機械翻訳】

Variation in the Genetic Repertoire of Viruses Infecting Micromonas pusilla Reflects Horizontal Gene Transfer and Links to Their Environmental Distribution

著者 (10件)： Finke Jan F. (Department of Earth, Ocean and Atmospheric Sciences and Biodiversity Research Centre, The University of British Columbia, Vancouver, BC V6T 1Z4, Canada) ,  Finke Jan F. (Institute for the Oceans and Fisheries, The University of British Columbia, Vancouver, BC V6T 1Z4, Canada) ,  Winget Danielle M. (Department of Earth, Ocean and Atmospheric Sciences and Biodiversity Research Centre, The University of British Columbia, Vancouver, BC V6T 1Z4, Canada) ,  Chan Amy M. (Department of Earth, Ocean and Atmospheric Sciences and Biodiversity Research Centre, The University of British Columbia, Vancouver, BC V6T 1Z4, Canada) ,  Chan Amy M. (Institute for the Oceans and Fisheries, The University of British Columbia, Vancouver, BC V6T 1Z4, Canada) ,  Suttle Curtis A. (Department of Earth, Ocean and Atmospheric Sciences and Biodiversity Research Centre, The University of British Columbia, Vancouver, BC V6T 1Z4, Canada) ,  Suttle Curtis A. (Institute for the Oceans and Fisheries, The University of British Columbia, Vancouver, BC V6T 1Z4, Canada) ,  Suttle Curtis A. (Department of Microbiology and Immunology, The University of British Columbia, Vancouver, BC V6T 1Z3, Canada) ,  Suttle Curtis A. (Department of Botany, The University of British Columbia, Vancouver, BC V6T 1Z4, Canada) ,  Suttle Curtis A. (Integrated Program in Microbial Biodiversity, Canadian Institute for Advanced Research, Toronto, ON M5G 1Z8, Canada)
資料名： Viruses (Web)  (Viruses (Web))
巻： 9  号： 5  ページ： 116  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7293A  ISSN： 1999-4915  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 真核生物植物プランクトンのグループであるPrasinoophytesは,グローバルな分布を持ち,Phycodnaviridae科における大きな二本鎖DNAウイルス(プラシノウイルス)によって感染する。本研究では,Micromonas pusilla,他のprasinoophytes及びクロロ植物に感染するフィコナウイルスの遺伝的レパートリー,系統発生及び環境分布を調べた。M.pusillaと他のフィコナウイルスに感染するウイルスのゲノムとM.pusillaの宿主分離株由来のゲノム間の比較に基づいて,M.pusilla(MpVs)に感染するウイルスは限られたコア遺伝子集合を共有したが,アミノ酸合成と糖操作に関連するそれらのような多数の代謝遺伝子を含むそれらの柔軟なパンゲノムにおいて強く変化した。驚くべきことに,これらのおそらく宿主由来遺伝子はM.pusillaと共有されているが,むしろ細菌や他の真核生物においてそれらの最も近い非ウイルス相同体を持ち,水平遺伝子導入を示す。プラシノウイルスからの完全長DNAポリメラーゼ(DNApol)遺伝子の全体的な遺伝子含有量との比較分析は,DNApol遺伝子断片の系統発生がウイルスの遺伝子含有量を反映することを示した。したがって,プラシノウイルスからの環境DNApol遺伝子配列は,それらの全体的遺伝的レパートリーを推論するために使用することができる。したがって,DNApol配列に基づく環境試料を通したウイルス生態型の分布は,局所環境条件を反映する遺伝子含有量における実質的な根本的な違いを意味する。さらに,プラシノウイルスの遺伝的レパートリーにおいて観測された高多様性は,それらの進化史を通して水平遺伝子移動によって駆動され,広範囲の機能的能力およびプラシノウイルス生態型の高い多様性をもたらした。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 細菌 ,  アミノ酸 ,  DNAポリメラーゼ ,  *遺伝 ,  *遺伝子 ,  系統発生 ,  ゲノム ,  植物プランクトン ,  真核生物 ,  環境試料
準シソーラス用語： *遺伝子水平移動 ,  ウイルスゲノム ,  環境条件 ,  二本鎖DNA ,  分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： アブラナ科植物 ,  Phycodnaviridae科 ,  コアゲノム ,  パンゲノム ,  水平遺伝子導入

分類 (1件)： ウイルス学一般  (EG04010J)

引用文献 (66件)：

• Leliaert, F.; Smith, D.R.; Herron, M.D.; Verbruggen, H.; Delwiche, C.F.; De Clerck, O. Phylogeny and molecular evolution of the green algae. CRC Crit. Rev. Plant Sci. 2012, 31, 1-46.
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• Worden, A.Z.; Nolan, J.K.; Palenik, B. Assessing the dynamics and ecology of marine picophytoplankton: The importance of the eukaryotic component. Limnol. Oceanogr. 2004, 49, 168-179.
• Van Etten, J.L.; Graves, M.V.; Boland, W.; Delaroque, N. Phycodnaviridae-Large DNA algal viruses. Arch. Virol. 2002, 147, 1479-1516.
• King, A.M.Q.; Adams, M.J.; Carstens, E.B.; Lefkowitz, E.J. Virus Taxonomy, Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses; Elsevier: Amsterdam, The Netherlands, 2012.

タイトルに関連する用語 (6件)： 感染 ,  ウイルス ,  遺伝 ,  水平遺伝子導入 ,  環境 ,  分布