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J-GLOBAL ID：202102240773584795   整理番号：21A0828992

Nrp1はa1a2ドメインのKonjacセラミド結合誘導構造剛直化により活性化される【JST・京大機械翻訳】

Nrp1 is Activated by Konjac Ceramide Binding-Induced Structural Rigidification of the a1a2 Domain

著者 (15件)： Usuki Seigo (Lipid Biofunction Section, Faculty of Advanced Life Science, Hokkaido University, Sapporo 001-0021, Hokkaido, Japan) ,  Yasutake Yoshiaki (Bioproduction Research Institute, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), Sapporo 062-8517, Hokkaido, Japan) ,  Yasutake Yoshiaki (Computational Bio Big-Data Open Innovation Laboratory (CBBD-OIL), AIST, Tokyo 169-8555, Japan) ,  Tamura Noriko (Bioproduction Research Institute, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), Sapporo 062-8517, Hokkaido, Japan) ,  Tamura Tomohiro (Bioproduction Research Institute, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), Sapporo 062-8517, Hokkaido, Japan) ,  Tamura Tomohiro (Computational Bio Big-Data Open Innovation Laboratory (CBBD-OIL), AIST, Tokyo 169-8555, Japan) ,  Tanji Kunikazu (Department of Neuropathology, Institute of Brain Science, Hirosaki University Graduate School of Medicine, Hirosaki 036-8562, Aomori, Japan) ,  Saitoh Takashi (Department of Medicinal Chemistry, Faculty of Pharmaceutical Sciences, Hokkaido University of Science, Sapporo 006-8585, Hokkaido, Japan) ,  Murai Yuta (Faculty of Advanced Life Science, Hokkaido University, Sapporo 001-0021, Hokkaido, Japan) ,  Mikami Daisuke (Lipid Biofunction Section, Faculty of Advanced Life Science, Hokkaido University, Sapporo 001-0021, Hokkaido, Japan) ,  Yuyama Kohei (Lipid Biofunction Section, Faculty of Advanced Life Science, Hokkaido University, Sapporo 001-0021, Hokkaido, Japan) ,  Monde Kenji (Faculty of Advanced Life Science, Hokkaido University, Sapporo 001-0021, Hokkaido, Japan) ,  Mukai Katsuyuki (Lipid Biofunction Section, Faculty of Advanced Life Science, Hokkaido University, Sapporo 001-0021, Hokkaido, Japan) ,  Mukai Katsuyuki (R&D Headquarters, Daicel Corporation, Tokyo 108-8230, Japan) ,  Igarashi Yasuyuki (Lipid Biofunction Section, Faculty of Advanced Life Science, Hokkaido University, Sapporo 001-0021, Hokkaido, Japan)
資料名： Cells (Web)  (Cells (Web))
巻： 9  号： 2  ページ： 517  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7155A  ISSN： 2073-4409  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Konjacセラミド(kCer)は,種々の長鎖塩基と-ヒドロキシル脂肪酸から成る植物型セラミドである。d4t,8t-スフィンガジエンの存在はセマフォリン3A(Sema3A)様活性に必須である。ここでは,3つのニューロピリン1(Nrp1)ドメイン(a1a2,b1b2またはc)を検討し,a1a2がd4t,8t-kCerに結合し,Sema3A様活性kCerがM解離定数(Kd)の弱い親和性でNrp1に結合することを見出した。ウシ血清アルブミンがリガンド受容体相互作用に影響し,a1a2がkCer(nM範囲でKd)に対する単一高親和性結合部位を有するかどうかを検討した。本研究では,ウシ血清アルブミンの影響を明らかにした。熱変性は,a1a2ドメインが本質的に無秩序領域(IDR)様柔軟性を含むことを示した。a1モジュール上の潜在的相互作用部位を分子ドッキングにより探索し,kCerがa1a2ドメインのSema3A結合領域に近い部位Aに結合する可能性のあるNrp1活性化機構を明らかにした。a1モジュールは,IDR様柔軟性がa1a2のkCer誘導蛋白質剛性により規則的になるので,a2をアクセスする。これは蛋白質二次構造のわずかな変化を通してa1とa2の間の分子内相互作用を誘発する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  フィン ,  剛性 ,  受容体 ,  *セラミド ,  ジエン ,  結合部位 ,  分子内相互作用 ,  親和性 ,  長鎖 ,  熱変性 ,  解離定数
準シソーラス用語： ウシ血清アルブミン ,  *ドメイン構造 ,  分子ドッキング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： セラミド ,  コンニャク ,  セマフォリン3A ,  神経突起伸長 ,  ニューロピリン1 ,  エンドグリコセラミダーゼ ,  スフィンガジエニン

分類 (5件)： 生物学的機能  (EB03040U) ,  神経の基礎医学  (GN01020W) ,  生物学的機能  (EB05020M) ,  野菜とその加工品  (FJ11020O) ,  食用油脂,マーガリン  (FJ09010C)

引用文献 (44件)：

• He, Z.; Tessier-Lavigne, M. Neuropilin is a receptor for the axonal chemorepellent Semaphorin III. Cell 1997, 90, 739-751.
• Goshima, Y.; Yamashita, N.; Nakamura, F.; Sasaki, Y. Regulation of dendritic development by semaphorin 3A through novel intracellular remote signaling. Cell Adh. Migr. 2016, 10, 627-640.
• Tamagnone, L.; Comoglio, P.M. Signalling by semaphorin receptors: Cell guidance and beyond. Trends Cell Biol. 2000, 10, 377-383.
• Martin-Satue, M.; Blanco, J. Identification of semaphorin E gene expression in metastatic human lung adenocarcinoma cells by mRNA differential display. J. Surg. Oncol. 1999, 72, 18-23.
• Tseng, C.H.; Murray, K.D.; Jou, M.F.; Hsu, S.M.; Cheng, H.J.; Huang, P.H. Sema3E/plexin-D1 mediated epithelial-to-mesenchymal transition in ovarian endometrioid cancer. PLoS ONE 2011, 6, e19396.

タイトルに関連する用語 (4件)： ドメイン ,  セラミド ,  誘導 ,  活性化