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J-GLOBAL ID：202102240975138877   整理番号：21A1150422

異質四倍体ワタ(Gossypium hirsutum L.)におけるクラスIIIペルオキシダーゼの全ゲノム同定と解析およびPK欠乏へのそれらの応答【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Identification and Analysis of Class III Peroxidases in Allotetraploid Cotton (Gossypium hirsutum L.) and their Responses to PK Deficiency

著者 (8件)： Duan Pengfei (Henan Collaborative Innovation Center of Modern Biological Breeding and Henan Key Laboratory for Molecular Ecology and Germplasm Innovation of Cotton and Wheat, Henan Institute of Science and Technology, Xinxiang 453003, Henan, China) ,  Duan Pengfei (Henan Collaborative Innovation Center of Water Security for Water Source Region of Mid-line of South-to-North Diversion Project and Henan Key Laboratory of Ecological Security for Water Source Region of Mid-line of South-to-North Diversion Project, Nanyang Normal University, Nanyang 47306...) ,  Wang Guo (Henan Collaborative Innovation Center of Modern Biological Breeding and Henan Key Laboratory for Molecular Ecology and Germplasm Innovation of Cotton and Wheat, Henan Institute of Science and Technology, Xinxiang 453003, Henan, China) ,  Chao Maoni (Henan Collaborative Innovation Center of Modern Biological Breeding and Henan Key Laboratory for Molecular Ecology and Germplasm Innovation of Cotton and Wheat, Henan Institute of Science and Technology, Xinxiang 453003, Henan, China) ,  Zhang Zhiyong (Henan Collaborative Innovation Center of Modern Biological Breeding and Henan Key Laboratory for Molecular Ecology and Germplasm Innovation of Cotton and Wheat, Henan Institute of Science and Technology, Xinxiang 453003, Henan, China) ,  Zhang Zhiyong (Henan Collaborative Innovation Center of Water Security for Water Source Region of Mid-line of South-to-North Diversion Project and Henan Key Laboratory of Ecological Security for Water Source Region of Mid-line of South-to-North Diversion Project, Nanyang Normal University, Nanyang 47306...) ,  Zhang Baohong (Henan Collaborative Innovation Center of Modern Biological Breeding and Henan Key Laboratory for Molecular Ecology and Germplasm Innovation of Cotton and Wheat, Henan Institute of Science and Technology, Xinxiang 453003, Henan, China) ,  Zhang Baohong (Department of Biology, East Carolina University, Greenville, NC 27858, USA)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 10  号： 6  ページ： 473  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 分泌可能なクラスIII植物ペルオキシダーゼとして知られるクラスIIIペルオキシダーゼ(PODs)は植物特異的酵素であり,植物成長と発生だけでなく生物的および非生物的ストレスに対する応答にも重要な役割を果たす。本研究では,アポプラストに分泌されると予測される180のPODを有するGhPODsと命名した198の非冗長POD遺伝子を同定した。これらのPOD遺伝子は,それらの系統発生関係に基づいて10のサブグループに分けられた。遺伝子構造,系統発生関係,および遺伝子発現プロファイルの解析を含むPOD遺伝子の系統的生物情報学的解析を行った。GhPODsは,高地ワタサブゲノムAとD染色体の両方に不均一に分布している。さらに,これらの遺伝子は15の分節と12のタンデム重複事象を受け,分節とタンデム重複の両方が高地ワタにおけるPOD遺伝子ファミリーの拡張に寄与することを示した。Ka/Ks分析は,重複GhPODsが重複事象中に限られた機能的発散を伴って負の選択を経験したことを示唆した。ハイスループットRNA-seqデータは,最も高度に発現した遺伝子が根,茎,葉,および繊維発生において有意な役割を果たすかもしれないことを示した。KまたはP欠乏条件下で,PODはワタ根と葉で異なる発現パターンを示した。本研究は,高地ワタにおけるPOD遺伝子ファミリーのさらなる機能解析に有用な情報を提供する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 冗長性 ,  遺伝子 ,  植物成長 ,  系統発生 ,  *ゲノム ,  直列接続 ,  *ペルオキシダーゼ ,  機能分析 ,  *四倍体 ,  高地
準シソーラス用語： ハイスループット ,  アポプラスト ,  非生物的ストレス ,  遺伝子ファミリー ,  遺伝子発現パターン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 綿 ,  クラスIIIペルオキシダーゼ ,  POD ,  遺伝子重複 ,  栄養素欠乏

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  酵素生理  (EH02020J) ,  繊維料作物  (FC03077U)

引用文献 (34件)：

• Passardi, F.; Theiler, G.; Zamocky, M.; Cosio, C.; Rouhier, N.; Teixera, F.; Margis-Pinheiro, M.; Ioannidis, V.; Penel, C.; Falquet, L.; et al. PeroxiBase: The peroxidase database. Phytochemistry 2007, 68, 1605-1611.
• Moural, T.W.; Lewis, K.M.; Barnaba, C.; Zhu, F.; Palmer, N.A.; Sarath, G.; Scully, E.D.; Jones, J.P.; Sattler, S.E.; Kang, C. Characterization of class III peroxidases from switchgrass. Plant Physiol. 2017, 173, 417-433.
• Ren, L.L.; Liu, Y.J.; Liu, H.J.; Qian, T.T.; Qi, L.W.; Wang, X.R.; Zeng, Q.Y. Subcellular relocalization and positive selection play key roles in the retention of duplicate genes of Populus class III peroxidase family. Plant Cell 2014, 26, 2404-2419.
• Passardi, F.; Longet, D.; Penel, C.; Dunand, C. The class III peroxidase multigenic family in rice and its evolution in land plants. Phytochemistry 2004, 65, 1879-1893.
• Tognolli, M.; Penel, C.; Greppin, H.; Simon, P. Analysis and expression of the class III peroxidase large gene family in Arabidopsis thaliana. Gene 2002, 288, 129-138.

タイトルに関連する用語 (9件)： ワタ ,  Gossypium ,  クラス ,  ペルオキシダーゼ ,  ゲノム ,  同定 ,  解析 ,  欠乏 ,  応答