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J-GLOBAL ID：202102240995985790   整理番号：21A1150068

Welsh PoniesおよびMorgan馬におけるウマメタボリックシンドローム表現型のゲノムワイド関連解析【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Association Analyses of Equine Metabolic Syndrome Phenotypes in Welsh Ponies and Morgan Horses

著者 (6件)： Norton Elaine (Veterinary Population Medicine Department, University of Minnesota, St. Paul, MN 55108, USA) ,  Schultz Nichol (Veterinary Population Medicine Department, University of Minnesota, St. Paul, MN 55108, USA) ,  Geor Ray (College of Sciences, Massey University, Palmerston North 4442, New Zealand) ,  McFarlane Dianne (Department of Physiological Sciences, Oklahoma State University, Stillwater, OK 74078, USA) ,  Mickelson James (Veterinary Biomedical Sciences Department, University of Minnesota; St. Paul, MN 55108, USA) ,  McCue Molly (Veterinary Population Medicine Department, University of Minnesota, St. Paul, MN 55108, USA)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 10  号： 11  ページ： 893  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ウマ代謝症候群(EMS)は,遺伝的研究がほとんど報告されていない複雑な形質である。本研究の目的は,品種間の共有およびユニークな遺伝子座を同定するためのメタアナリシスと組み合わせた2つのハイリスク品種における関連遺伝子座を同定するために,品種ゲノムワイド関連分析(GWA)の中で遂行することであった。12のEMS形質のGWAは,それぞれ,264のWelsh poniesと286のMorganウマにおける303と142の関連ゲノム領域を同定した。Meta分析は,65GWA領域が品種間で共有されていることを示した。領域境界は,固定サイズまたは連鎖不平衡の破綻に基づいて定義され,それらが,単一GWAコホート(中程度の優先度)で識別された,または,ゲノム全体の有意性(低い優先度)に達するSNPのない形質を横断した,すなわち,Welsh poniesにおける1853の候補遺伝子を含む,56の高い,26の培地,および7つの低い優先領域をもたらす,という特徴で共有された。そして,Morgansにおける1167の候補遺伝子を含む39の高い,8つの培地,および9つの低優先領域があった。優先領域は,炎症,グルコース代謝または脂質代謝に関連する経路に機能的に豊富な蛋白質コード遺伝子を含んでいた。これらのデータは,EMSが品種特異的リスク対立遺伝子を有する多遺伝子形質であり,また品種を横断したものと同様であることを示した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  炎症 ,  *表現型 ,  脂質代謝 ,  *ゲノム ,  品種 ,  対立遺伝子 ,  母集団 ,  優先度 ,  *ゲノムワイド関連解析
準シソーラス用語： 遺伝学研究 ,  連鎖不平衡 ,  グルコース代謝 ,  候補遺伝子 ,  ハイリスク , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： EMS ,  インスリン調節不全 ,  脂肪代謝 ,  遺伝学 ,  遺伝的危険因子 ,  ウマ ,  ゲノムワイド関連解析

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (64件)：

• Durham, A.E.; Frank, N. ECEIM consensus statement on equine metabolic syndrome. J. Vet. Intern. Med. 2019, 33, 335-349.
• Orsini, J.A.; Parsons, C.S.; Capewell, L.; Smith, G. Prognostic indicators of poor outcome in horses with laminitis at a tertiary care hospital. Can. Vet. J. 2010, 51, 623-628.
• Treiber, K.H.; Kronfeld, D.S.; Hess, T.M.; Byrd, B.M.; Splan, R.K.; Staniar, W.B. Evaluation of genetic and metabolic predispositions and nutritional risk factors for pasture-associated laminitis in ponies. J. Am. Vet. Med. Assoc. 2006, 228, 1538-1545.
• Shi, H.; Kichaev, G.; Pasaniuc, B. Contrasting the Genetic Architecture of 30 Complex Traits from Summary Association Data. Am. J. Hum. Genet. 2016, 99, 139-153.
• Norton, E.M.; Schultz, N.E.; Rendahl, A.K.; McFarlane, D.; Geor, R.J.; Mickelson, J.R.; McCue, M.E. Heritability of metabolic traits associated with equine metabolic syndrome in Welsh ponies and Morgan horses. Equine Vet. J. 2019, 51, 475-480.

タイトルに関連する用語 (2件)： 表現型 ,  ゲノムワイド関連解析