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J-GLOBAL ID：202102241652725182   整理番号：21A2240857

in silicoサブトラクティブプロテオミクスアプローチを用いたHelicobacter pyloriにおける潜在的薬物標的の同定および薬物再利用によるそれらの阻害の可能性【JST・京大機械翻訳】

Identification of Potential Drug Targets in Helicobacter pylori Using In Silico Subtractive Proteomics Approaches and Their Possible Inhibition through Drug Repurposing

著者 (5件)： Ibrahim Kareem A. (Department of Microbiology & Immunology, Faculty of Pharmacy, Egyptian Russian University, Cairo 11829, Egypt) ,  Helmy Omneya M. (Department of Microbiology & Immunology, Faculty of Pharmacy, Cairo University, Cairo 11562, Egypt) ,  Kashef Mona T. (Department of Microbiology & Immunology, Faculty of Pharmacy, Cairo University, Cairo 11562, Egypt) ,  Elkhamissy Tharwat R. (Department of Microbiology & Immunology, Faculty of Pharmacy, Egyptian Russian University, Cairo 11829, Egypt) ,  Ramadan Mohammed A. (Department of Microbiology & Immunology, Faculty of Pharmacy, Cairo University, Cairo 11562, Egypt)
資料名： Pathogens (Web)  (Pathogens (Web))
巻： 9  号： 9  ページ： 747  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7256A  ISSN： 2076-0817  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： クラス1発癌物質,Helicobacter pyloriは,抗菌開発のための世界保健機構の高い優先病原体の1つである。著者らは,BIOCYCデータベースにおけるチョークポイント反応,遺伝子およびゲノムの京都エンシクロペディア,および必須遺伝子(DEG)のデータベースを用いて検索された蛋白質プールを用いた3つのサブトラクティブプロテオミクスアプローチを用いて,推定薬物標的および薬物再精製によるそれらの阻害を見出した。サブトラクティブチャンネルは,ヒトプロテオーム,必須分析,サブ細胞局在予測,保存,腸フローラへの類似性の欠如,薬物性,および広域スペクトル活性を含む非相同を含んでいた。3つの選択したリガンドの最小発育阻止濃度(MIC)を測定し,抗ヘリコバクター活性を確認した。17の蛋白質標的を検索した。それらは,運動性,細胞壁生合成,環境および遺伝情報の処理,および二次代謝産物,アミノ酸,ビタミンおよび補因子の合成および代謝に関与する。他の2つのアプローチによって同定されたすべての薬物標的を検索するので,DEG蛋白質プールアプローチは優れていた。結合配位子(n=42)はほとんど非抗生物質化合物であった。クエン酸,ジピコリン酸およびピロリン酸は,1.52.5mg/mLのMICでH.pyloriを阻害した。結論として,著者らはH.pyloriにおける潜在的薬物標的を同定し,それらの結合リガンドを,可能な抗ヘリコバクター薬として,新しい抗微生物化合物の開発に必要な時間と努力を節約した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  生合成 ,  アミノ酸 ,  抗生物質 ,  抗微生物作用 ,  タンパク質 ,  ヒト ,  病原体 ,  最小発育阻止濃度 ,  *Helicobacter ,  ハウスキーピング遺伝子 ,  補因子 ,  *Helicobacter pylori ,  プロテオーム ,  窒素複素環化合物 ,  ジカルボン酸

著者キーワード (9件)： Helicobacter pylori ,  in silico ,  サブトラクティブプロテオミクス ,  薬物標的 ,  再利用 ,  チョークポイント ,  必須遺伝子のデータベース ,  KEGG ,  バイオCYC

分類 (2件)： 抗細菌薬の基礎研究  (GW17020S) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

物質索引 (1件)： ジピコリン酸

引用文献 (84件)：

• Duck, W.M.; Sobel, J.; Pruckler, J.M.; Song, Q.; Swerdlow, D.; Friedman, C.; Sulka, A.; Swaminathan, B.; Taylor, T.; Hoekstra, M.; et al. Antimicrobial Resistance Incidence and Risk Factors among Helicobacter pylori-Infected Persons, United States. Emerg. Infect. Dis. 2004, 10, 1088-1094.
• Guevara, B.; Cogdill, A.G. Helicobacter pylori: A Review of Current Diagnostic and Management Strategies. Dig. Dis. Sci. 2020, 65, 1917-1931.
• IARC Working Group on the Evaluation of Carcinogenic Risks to Humans. Schistosomes, Liver Flukes and Helicobacter Pylori; International Agency for Research on Cancer: Lyon, France, 1994; Volume 61.
• Bray, F.; Ferlay, J.; Soerjomataram, I.; Siegel, R.L.; Torre, L.A.; Jemal, A. Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA A Cancer J. Clin. 2018, 68, 394-424.
• Verma, A.; Dubey, J.; Hegde, R.R.; Rastogi, V.; Pandit, J.K. Helicobacter pylori: Past, current and future treatment strategies with gastroretentive drug delivery systems. J. Drug Target. 2016, 24, 897-915.

タイトルに関連する用語 (7件)： Helicobacter ,  薬物標的 ,  同定 ,  薬物 ,  再利用 ,  阻害 ,  可能性