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J-GLOBAL ID：202102244298669779   整理番号：21A0281409

転写リボスイッチは細菌遺伝子発現制御のための時間スケールを統合する【JST・京大機械翻訳】

Transcriptional Riboswitches Integrate Timescales for Bacterial Gene Expression Control

著者 (4件)： Scull Catherine E. (Department of Chemistry, Single Molecule Analysis Group and Center for RNA Biomedicine, University of Michigan, Ann Arbor, MI, United States) ,  Dandpat Shiba S. (Department of Chemistry, Single Molecule Analysis Group and Center for RNA Biomedicine, University of Michigan, Ann Arbor, MI, United States) ,  Romero Rosa A. (Department of Chemistry, Single Molecule Analysis Group and Center for RNA Biomedicine, University of Michigan, Ann Arbor, MI, United States) ,  Walter Nils G. (Department of Chemistry, Single Molecule Analysis Group and Center for RNA Biomedicine, University of Michigan, Ann Arbor, MI, United States)
資料名： Frontiers in Molecular Biosciences (Web)  (Frontiers in Molecular Biosciences (Web))
巻： 7  ページ： 607158  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7081A  ISSN： 2296-889X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 転写リボスイッチは,細菌mRNAの5′非翻訳領域(UTR)で典型的に見られるRNAアプタマーを含み,同族リガンドへの結合で代替二次構造を形成する。リボスイッチの二次構造の変化は,転写伸長と終結を制御する隣接発現プラットフォームの摂動をもたらし,下流遺伝子発現「オン」または「オフ」を転換する。リボスイッチリガンドは典型的には小さな代謝産物,二価カチオン,アニオン,シグナル伝達分子または他のRNAであり,大きなシグナル伝達カスケードの一部である。リガンド結合,RNA折畳み,RNA転写,および遺伝子発現の相互接続性は,複数の時間スケールにわたって細胞過程と環境条件を統合するリボスイッチを起す。生存の細菌機会を決定する環境手がかりに対する成功的応答のために,マイクロ秒から数分までの時間スケールの協調結合が達成されなければならない。本レビューは,リボスイッチが時間を通してそのような重要な遺伝子発現制御にどのように影響するかの理解における最近の進歩に焦点を当てる。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *細菌 ,  RNA【核酸】 ,  mRNA ,  代謝産物 ,  二次構造 ,  アニオン ,  *遺伝子発現
準シソーラス用語： 5′非翻訳領域 ,  *遺伝子発現調節 ,  環境条件 ,  リガンド結合 ,  RNAアプタマー ,  *リボスイッチ ,  RNA折畳み , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： RNAポリメラーゼ ,  RNA折畳み ,  遺伝子発現のリボスイッチ制御 ,  転写 ,  構造動力学

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  生物学的機能  (EB04020F)

引用文献 (93件)：

• Al-HashimiH. M.WalterN. G. (2008). RNA dynamics: it is about time. Curr. Opin. Struct. Biol. 18, 321-329. doi: 10.1016/j.sbi.2008.04.00418547802
• BlountK. F.BreakerR. R. (2006). Riboswitches as antibacterial drug targets. Nat. Biotechnol. 24, 1558-1564. doi: 10.1038/nbt126817160062
• BreakerR. R. (2012). Riboswitches and the RNA world. Cold Spring Harb. Perspect. Biol. 4:a003566. doi: 10.1101/cshperspect.a00356621106649
• BrzyzekG.SwiezewskiS. (2015). Mutual interdependence of splicing and transcription elongation. Transcription 6, 37-39. doi: 10.1080/21541264.2015.104014625890997
• CarthewR. W.SontheimerE. J. (2009). Origins and mechanisms of miRNAs and siRNAs. Cell 136, 642-655. doi: 10.1016/j.cell.2009.01.03519239886

タイトルに関連する用語 (6件)： 転写 ,  リボスイッチ ,  細菌 ,  遺伝子発現制御 ,  時間スケール ,  統合