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J-GLOBAL ID：202102244460634266   整理番号：21A0084024

シロザメ(Chiloscyllium plagiosum)の肝臓におけるcircRNAの同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of circRNAs in the Liver of Whitespotted Bamboo Shark (Chiloscyllium plagiosum)

著者 (17件)： Zhang Wenjie (College of Life Sciences, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou, China) ,  Zhang Wenjie (Zhejiang Provincial Key Laboratory of Silkworm Bioreactor and Biomedicine, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou, China) ,  Qin Ping (College of Life Sciences, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou, China) ,  Qin Ping (Zhejiang Provincial Key Laboratory of Silkworm Bioreactor and Biomedicine, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou, China) ,  Gong Xiaoxia (College of Life Sciences, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou, China) ,  Gong Xiaoxia (Zhejiang Provincial Key Laboratory of Silkworm Bioreactor and Biomedicine, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou, China) ,  Huang Lei (Hangzhou Hongqiao Sino-Science Gene Technology Co., Ltd., Hangzhou, China) ,  Wang Chan (College of Life Sciences, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou, China) ,  Wang Chan (Zhejiang Provincial Key Laboratory of Silkworm Bioreactor and Biomedicine, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou, China) ,  Chen Guiqian (College of Life Sciences, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou, China) ,  Chen Guiqian (Zhejiang Provincial Key Laboratory of Silkworm Bioreactor and Biomedicine, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou, China) ,  Chen Jianqing (College of Life Sciences, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou, China) ,  Chen Jianqing (Zhejiang Provincial Key Laboratory of Silkworm Bioreactor and Biomedicine, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou, China) ,  Wang Lei (College of Life Sciences, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou, China) ,  Wang Lei (Zhejiang Provincial Key Laboratory of Silkworm Bioreactor and Biomedicine, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou, China) ,  Lv Zhengbing (College of Life Sciences, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou, China) ,  Lv Zhengbing (Zhejiang Provincial Key Laboratory of Silkworm Bioreactor and Biomedicine, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 11  ページ： 596308  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 軟骨魚類科のメンバーである白斑竹類サメ(Chiloscyllium plagiosum)は,極度に大きな肝臓を持ち,強い再生能力と免疫調節を示す。円形RNA(循環RNA)は非コードRNAの重要なクラスである。増加する証拠から,サーコRNAは一種の潜在的調節因子であることが示唆される。最近,研究者は,種々の種から異なる循環RNAを分離し,同定したが,C.plagiosumの循環RNAに関する報告は少ない。本研究では,C.plagiosumの肝臓で合計4,558のcirRNAを同定した。この知見は,循環RNAが染色体に均等に分布しず,環化時にGT-AG規則に従うことを示唆する。代替の逆スプライシングは,予測されたcircRNAの真正性同定によって示されるように,サメの循環RNAに存在する可能性がある。サメ肝臓におけるcircRNAs(<2000bp)と検出されたmiRNAの結合強度を同時に分析し,グルタチオンS-トランスフェラーゼP1遺伝子に対するmRNA-miRNA-circRNAネットワークを構築し,サーコRNAの真正性を同時に検証した。著者らのデータは,海洋動物におけるサーコRNAの豊富な存在への新たな洞察だけでなく,C.plagiosumの肝臓ホメオスタシスにおける同定された循環RNAの機能を特性化するための基礎も提供する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  *RNA【核酸】 ,  mRNA ,  遺伝子 ,  染色体 ,  ホメオスタシス ,  環化反応 ,  軟骨魚類 ,  海洋動物 ,  グルタチオントランスフェラーゼ ,  キャラクタリゼーション ,  付着強さ
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  調節因子 ,  *環状RNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： サーカムRNA ,  バックスプライシング ,  Chiloscyllium plagiosum ,  miRNA ,  肝臓ホメオスタシス

分類 (4件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  魚類  (FH02020K) ,  動物に対する影響  (EE05040R) ,  進化論一般  (EC03010Q)

引用文献 (40件)：

• Ashwal-FlussR.MeyerM.PamudurtiN. R.IvanovA.BartokO.HananM. (2014). circRNA biogenesis competes with pre-mRNA splicing. Mol. Cell 56 55-66. doi: 10.1016/j.molcel.2014.08.019 25242144
• ChenY.LiC.TanC.LiuX. (2016). Circular RNAs: a new frontier in the study of human diseases. J. Med. Genet. 53 359-365. doi: 10.1136/jmedgenet-2016-103758 26945092
• ChenY. G.KimM. V.ChenX.BatistaP. J.AoyamaS.WiluszJ. E. (2017). Sensing Self and Foreign Circular RNAs by Intron Identity. Mol. Cell 67 228.e-238.e. doi: 10.1016/j.molcel.2017.05.022 28625551
• ChengD.ChenY.LuC.QianY.LvZ. (2017). Preliminary profiling of microRNA in the normal and regenerating liver of Chiloscyllium plagiosum. Comp. Biochem. Physiol. D Genom. Proteom. 24 60-67. doi: 10.1016/j.cbd.2017.06.003 28822868
• GeY.ZhangJ.ShiX.LuC.YangL.LiY. (2017). Differential expression and miRNA regulation of the GSTP1 gene in the regenerating liver of Chiloscyllium plagiosum. Fish Physiol. Biochem. 43 791-802. doi: 10.1007/s10695-016-0332-1 28054243

タイトルに関連する用語 (3件)： 肝臓 ,  circRNA ,  同定