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J-GLOBAL ID：202102244929868091   整理番号：21A1125757

8つの族集団におけるHLA-DRB1*およびDQB1*対立遺伝子およびハプロタイプ多様性:南インドにおける疾病の世界的親和性および遺伝的基礎【JST・京大機械翻訳】

HLA-DRB1* and DQB1* allele and haplotype diversity in eight tribal populations: Global affinities and genetic basis of diseases in South India

著者 (10件)： Rangasamy Nandakumar (PG & Research Department of Zoology, Periyar EVR College, Tiruchirappalli 620023, Tamil Nadu, India) ,  Chinniah Rathika (Department of Immunology, Madurai Kamaraj University, Madurai 625021, India) ,  Ravi Padma-Malini (Department of Immunology, Madurai Kamaraj University, Madurai 625021, India) ,  Vijayan Murali (Department of Internal Medicine, Texas Tech University Health Sciences Center, Lubbock, Texas 79430, USA) ,  Sivanadham Ramgopal (Department of Immunology, Madurai Kamaraj University, Madurai 625021, India) ,  K.V. Darsa (Department of Environmental Studies, Madurai Kamaraj University, Madurai 625021, Tamil Nadu, India) ,  Pandi Sasiharan (Department of Immunology, Madurai Kamaraj University, Madurai 625021, India) ,  Sevak Vandit (Department of Immunology, Madurai Kamaraj University, Madurai 625021, India) ,  Krishnan Prabhakaran (PG & Research Department of Zoology, Periyar EVR College, Tiruchirappalli 620023, Tamil Nadu, India) ,  Karuppiah Balakrishnan (Department of Immunology, Madurai Kamaraj University, Madurai 625021, India)
資料名： Infection, Genetics and Evolution  (Infection, Genetics and Evolution)
巻： 89  ページ： Null  発行年： 2021年 
JST資料番号： A1228A  ISSN： 1567-1348  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： HLAクラスII DRB1*とDQB1*対立遺伝子/ハプロタイプの分布を,南インド,Western Ghatsに生息する8つのDravidian tribal群の438個体において研究した。HLAタイピングは,PCR-SSP方法によって実行した。5-遺伝子座のAncestral拡張型ハプロタイプ(AEH)を同定するために,HLA-A,-Bおよび-C遺伝子座の対立遺伝子を,優勢な2-遺伝子座ハプロタイプを有するDNAsのためにタイプ化した。分析は,対立遺伝子HLA-DRB1*15が,最も優勢な対立遺伝子(Lowest/最高範囲:Urali,14.81/Malasar,48.94)であり,続いて対立遺伝子DRB1*10(Katunaykan,1.85/Paliyan,48.21),DRB1*14(Paliyan4.46/Katunaykan,40.74),DRB1*12(Mannan,1.64/Katunaykan,20.37)およびDRB1*03(Mannan,1.64/Urali,29.63)であることを明らかにした。最も頻度の高いDQB1*対立遺伝子はDQB1*02(Paliyan3.57/Urali,23.15),DQB1*05(Katunyakan,27.77/Paliyan84.82)およびDQB1*06(Malasar,8.51/Kuruman,33.51)であった。観察された最も優勢な2遺伝子座ハプロタイプは,DRB1*15-DQB1*05,DRB1*10-DQB1*05,DRB1*15-DQB1*06およびDRB1*04-DQB1*05であった。南インドトリベスのHLA免疫遺伝学の現在の研究は,グローバルに共有された2および5遺伝子座ハプロタイプの存在を明らかにした。これらのハプロタイプの多くは,インド南部の多くの疾患に関与している。A*68-B*35-C*02-DRB1*15:01-DQB1*05:01,A*24-B*57-C*06-DRB1*04:01-DQB1*05:01及びA*24-B*35-C*02-DRB1*15:01-DQB1*05:02のようなインド人集団でこれまで報告されていない祖先拡張ハプロタイプ(AEHs)の存在を観察した。”著者らは,A*68-B*35-C*02-DRB1*15:01-DQB1*05:01及びA*24-B*35-C*02-DRB1*15:01-DQB1*05:02であった。系統樹に基づく系統発生分析は,Malasar tribesのUrali,古-MediterrananおよびIndo-European親和性の白人親和性を明らかにした。グローバルに共有された感受性および保護ハプロタイプの存在は,南インドトリベスのモザイク免疫遺伝学的織物を反復した。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝 ,  感受性 ,  インド ,  系統樹 ,  モザイク性 ,  *対立遺伝子 ,  *親和性 ,  *ハプロタイプ ,  HLA-A ,  免疫遺伝学 ,  HLAタイピング ,  系統解析 ,  南インド ,  HLAクラスII抗原 ,  ヨーロッパ大陸系集団
準シソーラス用語： 白人 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： HLA ,  ハプロタイプ ,  トリベ ,  集団 ,  南インド

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (10件)： 集団 ,  対立遺伝子 ,  ハプロタイプ ,  多様性 ,  南インド ,  疾病 ,  世界 ,  親和性 ,  遺伝 ,  基礎