文献

J-GLOBAL ID：202102244937109681   整理番号：21A0291235

マウスからのEDL,psoasおよびヒラメ筋のトランスクリプトームの比較分析【JST・京大機械翻訳】

Comparative analysis of the transcriptomes of EDL, psoas, and soleus muscles from mice

著者 (6件)： Hettige Pabodha (Department of Chemistry, University of Massachusetts Lowell, Lowell, USA) ,  Hettige Pabodha (UMass Movement Center, University of Massachusetts Lowell, Lowell, USA) ,  Tahir Uzma (Department of Biological Sciences, Northern Arizona University, Flagstaff, USA) ,  Nishikawa Kiisa C. (Department of Biological Sciences, Northern Arizona University, Flagstaff, USA) ,  Gage Matthew J. (Department of Chemistry, University of Massachusetts Lowell, Lowell, USA) ,  Gage Matthew J. (UMass Movement Center, University of Massachusetts Lowell, Lowell, USA)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 21  号： 1  ページ： 1-16  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 個々の骨格筋は,それらの分子組成に基づく特定の作業を行うように進化した。一般的に,筋線維は,ミオシン重鎖イソ型プロファイルに基づいて,速い収縮または遅い収縮として特徴付けられる。本アプローチは,SDS-PAGEが繊維タイプをマッピングするための一次ツールであったとき,筋肉研究の早期日に意味した。しかしながら,次世代シークエンシングツールは単一試料における全筋肉トランスクリプトームの分析を可能にし,特異的蛋白質の異なるイソ型を区別することを含む繊維タイプ間の差異のより正確な特性化を可能にする。ハイスループットRNA配列決定を用いて,マウス由来の伸筋指伸筋(EDL),psoasおよびヒラメの差次的遺伝子発現パターンを比較することにより,このアプローチの力を実証した。EDLとpsoasは,典型的にミオシン発現パターンに基づく高速収縮筋として分類されるが,ヒラメ筋は遅い収縮筋と考えられている。トランスクリプトミクス変動性の大部分は,高速収縮と低速収縮特性化と整列する。しかしながら,psoasとEDLは,細胞外マトリックス,筋原線維,転写,翻訳,横紋筋適応,ミトコンドリア分布,および代謝をコードする遺伝子に関連するユニークな発現パターンを示す。さらに,ミオシン軽鎖,トロポニン,トロポミオシンイソ型,およびZディスクの構成成分をコードするいくつかの遺伝子をコードする遺伝子において,psoasとEDLの間の有意な発現差異が観察された。この観察は骨格筋の複雑な分子的性質を明らかにし,骨格筋特性化のためのツールとしてトランスクリプトミクス情報を利用する重要性を示す。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  横紋筋 ,  骨格筋 ,  伸筋 ,  ミオシン ,  ミトコンドリア ,  トロポミオシン ,  トロポニン ,  *ひらめ筋 ,  *ヒラメ ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： ミオシン重鎖 ,  トランスクリプトーム解析 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： RNA配列決定 ,  高速単収縮筋 ,  遅筋収縮筋 ,  トランスクリプトーム ,  筋肉の特殊化 ,  差次的遺伝子発現

分類 (1件)： 筋肉  (EJ10020G)

引用文献 (73件)：

• Compr Physiol; Mechanisms modulating skeletal muscle phenotype; B Blaauw, S Schiaffino, C Reggiani; 3; 2013; 1645-1687; 10.1002/cphy.c130009; citation_id=CR1
• Prog Biophys Mol Biol; Human skeletal muscle fibres: molecular and functional diversity; R Bottinelli, C Reggiani; 73; 2000; 195-262; 10.1016/S0079-6107(00)00006-7; citation_id=CR2
• Elife.; Transcriptional profiling reveals extraordinary diversity among skeletal muscle tissues; EE Terry, X Zhang, C Hoffmann, LD Hughes, SA Lewis, J Li; 7; 2018; 1; 10.7554/eLife.34613; citation_id=CR3
• Nature.; Changes in the cross-striations of muscle during contraction and stretch and their structural interpretation; H Huxley, J Hanson; 173; 1954; 973-976; 10.1038/173973a0; citation_id=CR4
• Nature.; Structural changes in muscle during contraction: interference microscopy of living muscle fibres; AF Huxley, R Niedergerke; 173; 1954; 971-973; 10.1038/173971a0; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (4件)： マウス ,  ヒラメ筋 ,  トランスクリプトーム ,  比較分析