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J-GLOBAL ID：202102245120987009   整理番号：21A0312481

間葉系幹細胞の骨形成分化初期クロマチン開放領域の動的変化【JST・京大機械翻訳】

Dynamic changes of chromatin accessibility in early osteogenic differen?tiation of human mesenchymal stem cells

著者 (5件)： Liu Jianyun (九江学院基礎医学院,江西九江332000) ,  Zhang Jie (九江学院基礎医学院,江西九江332000) ,  Ma Baicheng (九江学院基礎医学院,江西九江332000) ,  Wu Ping (九江学院基礎医学院,江西九江332000) ,  Xiong Jianjun (九江学院基礎医学院,江西九江332000)
資料名： Zhongguo Bingli Shengli Zazhi  (Zhongguo Bingli Shengli Zazhi)
巻： 36  号： 11  ページ： 2037-2042  発行年： 2020年 
JST資料番号： W1465A  ISSN： 1000-4718  CODEN： ZBSZEB  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:全ゲノムレベルで骨髄間葉系幹細胞(MSCs)の骨形成分化早期のクロマチン開放領域の動態変化を観察する。方法:初代培養ヒト骨髄MSCsから第6世代まで、骨形成誘導剤はそれぞれ0、3、5と7日間刺激した。各グループの細胞を収集し、ATAC-seq技術(ハイスループットシークエンシングに基づくトランスポザーゼはクロマチン分析に接近できる)を用いて、クロマチンの開放領域を検出し、各グループ間のクロマチンの開放区域の数、開放領域のDNAモチーフ及び隣接遺伝子機能に対してバイオインフォマティクス分析を行った。結果;MSCsの骨形成分化の早期に異なる時点において、細胞のクロマチンの開放区域の数量は著しい動的変化が現れた;各群の機能的領域のpeak分布は主に転写開始点付近に集中した。motif分析では、各群の細胞間が転写調節に関与する活性化DNAが微細な変化を示した。新規クロマチン開放領域の生物学的過程は,種々のGTPアーゼ活性の調節,細胞外基質構成,Wntシグナル伝達経路などに集中した。一方,新しい遺伝子濃縮経路は主にRap1シグナル伝達経路,接着斑,接着結合などに集中した。結論:骨髄MSCsの骨形成分化早期に、各時期のクロマチン開放区域に顕著な特徴的変化が生じた。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： DNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  *クロマチン ,  *骨形成 ,  骨髄 ,  ヒト ,  GTPアーゼ ,  初代培養 ,  細胞外マトリックス ,  トランスポザーゼ ,  *間葉系幹細胞
準シソーラス用語： 転写開始部位 ,  バイオインフォマティクス ,  骨髄間葉系幹細胞 ,  転写調節 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (5件)： 間葉系幹細胞 ,  骨形成分化 ,  初期 ,  クロマチン ,  動的変化