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J-GLOBAL ID:202102245465167421   整理番号:21A0682603

早期および後期軽度認知障害における差次的発現とmiRNA-遺伝子相互作用【JST・京大機械翻訳】

Differential Expression and miRNA-Gene Interactions in Early and Late Mild Cognitive Impairment
著者 (8件):
資料名:
巻:号:ページ: 251  発行年: 2020年 
JST資料番号: U7145A  ISSN: 2079-7737  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: スイス (CHE)  言語: 英語 (EN)
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軽度認知障害(MCI)とアルツハイマー病(AD)は,それらの分子構造が解明されていない複雑な疾患である。APOE,アミロイドベータ前駆体蛋白質(APP)およびプレセニリン-1(PSEN1)は,MCIおよびADの両方と関連する良く知られた遺伝子である。最近,マイクロRNA(miRNA)のような後成的変化および調節不全調節要素が神経変性と関連することが報告されている。本研究では,マイクロアレイおよびRNA-Seqデータに基づいて,遺伝子およびmiRNAに対する差次的発現分析(DEA)を行った。健康な個人,早期と後期の軽度認知障害(EMCIとLMCI)の全体的な遺伝子プロファイルとADを,ADNIコホートから得た。健常人とAD患者のmiRNA全体プロファイルを,公開RNA-Seqデータから抽出した。ADNI Cohortデータに関するlimmaパッケージで行ったDEAは,EMCI患者とLMCI患者の間で8つの差次的発現(DE)遺伝子(AGER,LINC00483,MMP19,CATSPER1,ARFGAP1,GPER1,PHLPP2,TRPM2)(false発見率(FDR)p値<0.05)を強調した。以前の分子研究は,これらの遺伝子と認知症および神経関連経路との関連を示した。5つの調節不全miRNAを,RNA-SeqデータおよびエッジR(FDR p値<0.002)で実施したDEAによって同定した。ADにおける全ての報告されたmiRNAは前述の遺伝子と相互作用する。著者らの統合的トランスクリプトーム解析は,認知および神経変性過程に関与するかもしれないmiRNA遺伝子相互作用のセットを同定することができた。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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神経系の診断 
引用文献 (52件):
  • Bertram, L. Alzheimer’s disease genetics current status and future perspectives. Int. Rev. Neurobiol. 2009, 84, 167-184.
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