サーバレスバイオインフォマティクスサイバーインフラストラクチャーパイプラインに向けて【JST・京大機械翻訳】

Yao Shunyu David; Gulzar Muhammad Ali; Zhang Liqing; Butt Ali R.

文献

J-GLOBAL ID：202102245679416015 整理番号：21A2233807

サーバレスバイオインフォマティクスサイバーインフラストラクチャーパイプラインに向けて【JST・京大機械翻訳】

Towards a Serverless Bioinformatics Cyberinfrastructure Pipeline

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資料名：
号： HiPS ’21 ページ： 33-40 発行年： 2020年
JST資料番号： D0698C 資料種別：会議録 (C)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

機能-サービス(FaaS)およびサーバレスコンピューティングモデルは,クラウドにおける大規模アプリケーションをサポートするための強力な抽象化を提供する。この文脈における主要なハードルは,FaaS実装に対して既にコンテナ化されたものであっても,アプリケーションを変換することは自明でないことである。本論文では,FaaSへの容易かつ効率的な応用変換をサポートするための第一段階を取り上げた。Pythonで書かれたアプリケーションを,AWS Lamdaのようなトッププラットフォームを自動的に展開できる一連の関数に変換する系統的方式を提案した。抗生物質耐性細菌とSARS-CoV-2のようなウイルスの同定のための廃水分析を提供する,バイオインフォマティクスサイバー構造パイプライン,CIWARSをターゲットにした。FaaSベースのCIWARSを可能にする経験に基づいて,FaaSモデルへの他の類似の応用の転換を助ける方法論を開発した。著者らの評価は,著者らのアプローチがCIWARSをFaaSに正しく変換することができ,新しいFaaSベースのCIWARSは,代表的な作業負荷に対して2%未満のオーバヘッドしか無視できる(≦2%)ことを示した。Please refer to this article’s citation page on the publisher website for specific rights information. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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計算機システム開発 , 計算機網

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