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J-GLOBAL ID：202102245884683679   整理番号：21A0017889

RNA-Seqおよび二次代謝産物解析は,ニードル膀胱さび病(Chrysomyxa rhododendri)感染に対するドイツトウヒ(Picea abies)における推定防御-トランスクリプトームを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

RNA-Seq and secondary metabolite analyses reveal a putative defence-transcriptome in Norway spruce ( Picea abies ) against needle bladder rust ( Chrysomyxa rhododendri ) infection

著者 (9件)： Trujillo-Moya Carlos (Federal Research and Training Centre for Forests, Landscape and Natural Hazards (BFW)-Department of Forest Genetics, Vienna, Austria) ,  Ganthaler Andrea (Department of Botany, University of Innsbruck, Innsbruck, Austria) ,  Stoggl Wolfgang (Department of Botany, University of Innsbruck, Innsbruck, Austria) ,  Kranner Ilse (Department of Botany, University of Innsbruck, Innsbruck, Austria) ,  Schueler Silvio (Federal Research and Training Centre for Forests, Landscape and Natural Hazards (BFW)- Department of Forest Growth & Silviculture, Vienna, Austria) ,  Ertl Reinhard (VetCore Facility for Research, University of Veterinary Medicine, Vienna, Austria) ,  Schlosser Sarah (VetCore Facility for Research, University of Veterinary Medicine, Vienna, Austria) ,  George Jan-Peter (Federal Research and Training Centre for Forests, Landscape and Natural Hazards (BFW)-Department of Forest Genetics, Vienna, Austria) ,  Mayr Stefan (Department of Botany, University of Innsbruck, Innsbruck, Austria)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 21  号： 1  ページ： 1-21  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 亜高山森林におけるノルウェートウヒ樹木は,しばしば針さび病菌Chrysomyxa virididendriによる感染に直面し,それは有意な成長低下を引き起こし,若木の死亡率を増加させた。しかし,樹木が分子防御応答および/またはそれぞれの遺伝子発現を活性化することにより真菌攻撃に能動的に応答するかどうかは不明である。ここでは,対照と感染樹木のトランスクリプトーム(RNA-Seq分析)とフェノールプロファイル(UHPLC-MS)を39日間にわたって比較した感染実験の結果を報告する。感染および感染していないラミート間の遺伝子発現は,感染の21日後に有意に異なり,既に知られているが,病原体に対するトウヒ分子防御に関与する新しい候補遺伝子も明らかにした。RNA-Seqと生化学データの併用は,C.virididendriによる感染に対するノルウェートウヒ応答が局所で制限され,寄生後9と21日の間に主に活性化され,フェノール経路の活性化に関連する過感受性応答(HR)による菌類の潜在的分離を含むことを示唆する。同定された重要な調節遺伝子は,耐性クローンをよりよく特徴づけ,耐性機構を解明するために,感受性の異なるトウヒ品種における更なる特異的分析のための固体基盤である。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *RNA【核酸】 ,  フェノール類 ,  真菌類 ,  品種 ,  病原体 ,  *トウヒ ,  クローン ,  苗木 ,  遺伝子発現 ,  *二次代謝産物 ,  *Picea abies ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： 候補遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： 針葉樹 ,  森林樹木 ,  真菌感染症 ,  宿主-病原体相互作用 ,  フェノール化合物 ,  PR蛋白質 ,  RNA配列決定 ,  トランスクリプトーム

分類 (2件)： 菌類による植物病害  (FC04052Y) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (1件)： フェノール

引用文献 (96件)：

• Austral Plant Pathol; Cytospora species (Ascomycota, Diaporthales, Valsaceae): introduced and native pathogens of trees in South Africa; GC Adams, J Roux, MJ Wingfield; 35; 2006; 521-548; 10.1071/AP06058; citation_id=CR1
• Induced plant defenses against pathogens and herbivores; 1999; CR2; AA Agrawal, S Tuzun, E Bent; citation_publisher=APS Press
• BMC Plant Biol; Induced transcriptional profiling of phenylpropanoid pathway genes increased flavonoid and lignin content in Arabidopsis leaves in response to microbial products; MB Ali, DH McNear; 14; 2014; 1; 10.1186/1471-2229-14-1; citation_id=CR3
• PLoS One; A metabolic profiling strategy for the dissection of plant defense against fungal pathogens; KA Aliferis, D Faubert, S Jabaji; 9; 11; 2014; 10.1371/journal.pone.0111930; citation_id=CR4
• Trees.; Controlled inoculation of Norway spruce (Picea abies) with Sirococcus conigenus: PCR-based quantification of the pathogen in host tissue and infection-related increase of phenolic metabolites; G Bahnweg, R Schubert, RD Kehr, G Müller-Starck, W Heller, C Langebartels; 14; 2000; 435-441; 10.1007/s004680000058; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (14件)： RNA-seq ,  二次代謝産物 ,  解析 ,  ニードル ,  膀胱 ,  さび病 ,  感染 ,  ドイツ ,  トウヒ ,  Picea ,  Abies ,  推定 ,  防御 ,  トランスクリプトーム