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J-GLOBAL ID：202102246435509536   整理番号：21A1840505

ナンキンマメAT-hookファミリー遺伝子のバイオインフォマティクス分析【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics Analysis of AT-hook Genes Family in Peanut (Arachis hypogaea L.)

著者 (5件)： Hu Dongxiu (江西農業大学作物生理生態与遺伝育種教育部重点実験室,江西南昌 330045;广東省農業科学院作物研究所/国家油料作物改良中心南方分中心/广東省農作物遺伝改良重点実験室,广東广州 510640) ,  Liu Hao (广東省農業科学院作物研究所/国家油料作物改良中心南方分中心/广東省農作物遺伝改良重点実験室,广東广州 510640) ,  Liang Xuanqiang (广東省農業科学院作物研究所/国家油料作物改良中心南方分中心/广東省農作物遺伝改良重点実験室,广東广州 510640) ,  Wu Ziming (江西農業大学作物生理生態与遺伝育種教育部重点実験室,江西南昌 330045) ,  Fang Jiahai (江西農業大学作物生理生態与遺伝育種教育部重点実験室,江西南昌 330045)
資料名： Redai Zuowu Xuebao  (Redai Zuowu Xuebao)
巻： 42  号： 3  ページ： 649-659  発行年： 2021年 
JST資料番号： C2969A  ISSN： 1000-2561  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： AT-hookタンパク質は植物生長発育、器官構築、ストレスとホルモン信号応答に重要な役割を果たしているだけでなく、クロマチンリモデリングの転写因子と補助因子として、遺伝子の転写活性を調節する。ナンキンマメのAT-hook遺伝子ファミリーの構造特徴を全面的に理解するため、バイオインフォマティクス技術を用い、ナンキンマメゲノムデータベースに対して、AT-hook遺伝子ファミリーメンバーの理化学性質、遺伝子構造、保存ドメインと系統発生関係及び12個の組織における特異性を分析した。その結果、ナンキンマメゲノムデータベースに64個のAT-hook遺伝子が得られ、染色体の定位により、これらの遺伝子は染色体上に不均一分布を示した。系統樹解析は,ナンキンマメのAT-hook遺伝子が8つのサブグループに分類でき,多くの遺伝子が5′-UTRと3′-UTRを含むことを示したが,ナンキンマメAT-hook遺伝子は6つの保存ドメインを含んでいた。ほとんどのAT-hookタンパク質はRGRPとPPCのモチーフを含む。発現サーモグラムは,AT-hook遺伝子が,arahy.BT3IUC,arahy.QUTE6V,arahy.8MM6DT,arahy.RIX96Uおよびarahyのような特定の発現パターンを示した。T2XHT6は根で高度に発現していたが,arahy.EW3BSRとarahy.CSXK13は,それぞれ雌ずいと葉で高豊度で均一に転写された。本研究の結果は、ナンキンマメゲノムにおけるAT-hook遺伝子の潜在的な分子機能を更に解明するために理論的参考を提供した。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  染色体 ,  タンパク質 ,  *ナンキンマメ ,  ホルモン ,  植物成長 ,  系統発生 ,  ゲノム ,  めしべ ,  転写因子
準シソーラス用語： クロマチンリモデリング ,  *バイオインフォマティクス ,  系統解析 ,  ドメイン構造 ,  遺伝子ファミリー , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (4件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  発生,成長,分化  (EH02030U)

タイトルに関連する用語 (5件)： ナンキンマメ ,  ファミリー ,  遺伝子 ,  バイオインフォマティクス ,  分析