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J-GLOBAL ID：202102246525836191   整理番号：21A1906318

骨肉腫転移のための長鎖非コードRNA関連競合内因性RNAネットワークの開発と解析【JST・京大機械翻訳】

Development and analysis of long non-coding RNA-associated competing endogenous RNA network for osteosarcoma metastasis

著者 (10件)： Fu Yucheng (Department of Orthopedics, Ruijin Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, Shanghai, PR China) ,  Liu Qi (Department of Orthopedics, Ruijin Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, Shanghai, PR China) ,  Bao Qiyuan (Department of Orthopedics, Ruijin Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, Shanghai, PR China) ,  Wen Junxiang (Department of Orthopedics, Ruijin Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, Shanghai, PR China) ,  Liu Zhuochao (Department of Orthopedics, Ruijin Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, Shanghai, PR China) ,  Hu Yuehao (Department of Orthopedics, Ruijin Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, Shanghai, PR China) ,  He Guoyu (Department of Orthopedics, Ruijin Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, Shanghai, PR China) ,  Peng Cheng (Department of Orthopedics, Ruijin Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, Shanghai, PR China) ,  Xu Yiqi (Department of Orthopedics, Ruijin Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, Shanghai, PR China) ,  Zhang Weibin (Department of Orthopedics, Ruijin Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, Shanghai, PR China)
資料名： Hereditas (Web)  (Hereditas (Web))
巻： 158  号： 1  ページ： 1-14  発行年： 2021年 
JST資料番号： U7386A  ISSN： 1601-5223  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 骨肉腫は,しばしば転移を発症する原発性骨悪性新生物である。増加する証拠は,非コードRNA(ncRNA)が骨肉腫の進行と関係することを示した。しかし,骨肉腫転移におけるncRNAの役割は,まだ知られていない。差次的発現(DE)RNAを遺伝子発現Omnibus(GEO)データベースから同定した。DEメッセンジャーRNA(DEmRNA)の蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)をSTRINGデータベースを通して構築した。マイクロRNA(miRNA)の標的mRNAと長いncRNA(lncRNAs)をmiRDB,ターゲットスキャンと遺伝子コードデータベースを通して予測し,次に以前に得られたDERNAと交差検査し,競合する内因性RNA(ceRNA)ネットワークを構築した。全ネットワークをサイトスコープにより可視化し,ハブRNAをサイトスコーププラグインサイトハブによりスクリーニングした。DAVIDおよびMirPathデータベースにより,遺伝子機能および経路解析を行った。ハブRNAの生存分析を,Kaplan-Meier(KM)生存曲線を通して得た。564のDEmRNA,16のDElncRNAと22のDEmiRNAsをスクリーニングした。GO機能およびKEGG経路分析は,DERNAが腫瘍転移と有意に関連することを示した。6つのlncRNA,55のmRNAと20のmiRNAを含むceRNAネットワークを構築し,トップ10のハブRNAを得た。全体として,PI3K/AKTシグナリング経路は最も重要な骨肉腫転移関連経路として同定され,そのハブceRNAモジュールを構築した。生存分析は,ハブceRNAモジュールにおけるRNAが骨肉腫患者の予後と密接に関連することを示した。本研究は骨肉腫転移に関する新しい展望を提供した。さらに重要なことに,ハブceRNAモジュールにおけるRNAは,骨肉腫患者に対する新規治療標的および予後因子として作用する可能性がある。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *ネットワーク ,  *RNA【核酸】 ,  mRNA ,  遺伝子 ,  可視化 ,  腫瘍転移 ,  *骨肉腫 ,  遺伝子発現
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  *非翻訳RNA ,  *内因性 ,  予後因子 ,  治療標的 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 骨肉腫 ,  転移 ,  競合する内因性RNA ,  生物情報解析 ,  長鎖非コードRNA

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (47件)：

• Orphanet journal of rare diseases; Osteosarcoma (osteogenic sarcoma); P Picci; 2; 2007; 6; 10.1186/1750-1172-2-6; citation_id=CR1
• The Orthopedic clinics of North America; Update on Survival in Osteosarcoma; ME Anderson; 47; 1; 2016; 283-292; 10.1016/j.ocl.2015.08.022; citation_id=CR2
• Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research; Toward a drug development path that targets metastatic progression in osteosarcoma; C Khanna, TM Fan, R Gorlick, LJ Helman, ES Kleinerman, PC Adamson; 20; 16; 2014; 4200-4209; 10.1158/1078-0432.CCR-13-2574; citation_id=CR3
• Nat Rev Cancer; Translational biology of osteosarcoma; M Kansara, MW Teng, MJ Smyth, DM Thomas; 14; 11; 2014; 722-735; 10.1038/nrc3838; citation_id=CR4
• Cancer Res; Hypoxia-induced WSB1 promotes the metastatic potential of osteosarcoma cells; J Cao, Y Wang, R Dong, G Lin, N Zhang, J Wang; 75; 22; 2015; 4839-4851; 10.1158/0008-5472.CAN-15-0711; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (7件)： 骨肉腫 ,  長鎖非コードRNA ,  競合 ,  内因性 ,  RNA ,  開発 ,  解析