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J-GLOBAL ID：202102246920072884   整理番号：21A2949405

カルストスプリングにおける16S rRNA遺伝子に基づくメタバーコードのための異なる膜フィルターの試験【JST・京大機械翻訳】

Testing Different Membrane Filters for 16S rRNA Gene-Based Metabarcoding in Karstic Springs

著者 (17件)： Moldovan Oana Teodora (Emil Racovitza Institute of Speleology, Cluj Department, Clinicilor 5, 400006 Cluj-Napoca, Romania) ,  Baricz Andreea (Department of Molecular Biology and Biotechnology, Babes-Bolyai University, 400000 Cluj-Napoca, Romania) ,  Baricz Andreea (Centre for Systems Biology, Biodiversity and Bioresources, Babes-Bolyai University, 400000 Cluj-Napoca, Romania) ,  Baricz Andreea (National Institute of Research and Development for Biological Sciences, Institute of Biological Research, 400015 Cluj-Napoca, Romania) ,  Szekeres Edina (Department of Molecular Biology and Biotechnology, Babes-Bolyai University, 400000 Cluj-Napoca, Romania) ,  Szekeres Edina (Centre for Systems Biology, Biodiversity and Bioresources, Babes-Bolyai University, 400000 Cluj-Napoca, Romania) ,  Szekeres Edina (National Institute of Research and Development for Biological Sciences, Institute of Biological Research, 400015 Cluj-Napoca, Romania) ,  Kenesz Marius (Emil Racovitza Institute of Speleology, Cluj Department, Clinicilor 5, 400006 Cluj-Napoca, Romania) ,  Hoaghia Marial Alexandra (National Institute for Research and Development of Optoelectronics Bucharest INOE 2000, Research Institute for Analytical Instrumentation Subsidiary, 400293 Cluj-Napoca, Romania) ,  Levei Erika Andrea (National Institute for Research and Development of Optoelectronics Bucharest INOE 2000, Research Institute for Analytical Instrumentation Subsidiary, 400293 Cluj-Napoca, Romania) ,  Mirea Ionut Cornel (Emil Racovitza Institute of Speleology, Calea 13 Septembrie 13, 050711 Bucuresti, Romania) ,  Nastase-Bucur Ruxandra (Emil Racovitza Institute of Speleology, Cluj Department, Clinicilor 5, 400006 Cluj-Napoca, Romania) ,  Brad Traian (Emil Racovitza Institute of Speleology, Cluj Department, Clinicilor 5, 400006 Cluj-Napoca, Romania) ,  Chiciudean Iulia (Department of Molecular Biology and Biotechnology, Babes-Bolyai University, 400000 Cluj-Napoca, Romania) ,  Chiciudean Iulia (Centre for Systems Biology, Biodiversity and Bioresources, Babes-Bolyai University, 400000 Cluj-Napoca, Romania) ,  Banciu Horia Leonard (Department of Molecular Biology and Biotechnology, Babes-Bolyai University, 400000 Cluj-Napoca, Romania) ,  Banciu Horia Leonard (Centre for Systems Biology, Biodiversity and Bioresources, Babes-Bolyai University, 400000 Cluj-Napoca, Romania)
資料名： Water (Web)  (Water (Web))
巻： 12  号： 12  ページ： 3400  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7295A  ISSN： 2073-4441  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 導入:カルスト泉は,人間と家畜の淡水源として農村コミュニティによって世界中で使用されている。Romaniaでは,人口の1/3は公共水供給に直接アクセスしない。本研究は,農村住民による飲料水として使用されるカルスト湧泉の季節的環境および微生物学的モニタリングのための簡単で,迅速で安価な方法を開発するための国全体のプロジェクトの一部である。16S rRNA遺伝子ベースのメタバーコードを用いたさらなる微生物多様性推定のために環境DNAを効率的に捕獲するために,ワークフローを監視するための重要なステップは水質の評価と適切な膜フィルタの選択からなる。方法:異なる組成と細孔径の幾つかの市販膜フィルターを,ルーマニアの3つのカルスト泉からサンプリングした水で試験し,続いて水化学と全コミュニティ16S rRNA遺伝子ベースのメタバーコーディング分析を行った。結果:異なるタイプの適用膜フィルターは,全体および病原性細菌の多様性および豊度において様々な回復を提供することを見出した。結論:異なるフィルタによる実験の結果は,混合セルロースエステル,酢酸セルロース,および0.20と0.22mの硝酸塩膜が,カルスト湧泉のアンプリコンベースのメタバーコーディングモニタリングのために最良であることを示した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 水質 ,  給水 ,  家畜 ,  硝酸塩 ,  *遺伝子 ,  *カルスト地形 ,  湧泉 ,  農村 ,  飲用水 ,  *バーコード ,  *rRNA遺伝子
準シソーラス用語： *16S rRNA ,  アンプリコン ,  微生物多様性 ,  バーコーディング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 湧水 ,  カルスト ,  16S rRNA遺伝子 ,  膜フィルタ ,  メタバーコーディング ,  病原性細菌

分類 (3件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  微生物形態学・分類学  (EG03030Y) ,  微生物検査法  (EG02020G)

引用文献 (31件)：

• Rodell, M.; Famiglietti, J.S.; Wiese, D.N.; Reager, J.T.; Beaudoing, H.K.; Landerer, F.W.; Lo, M.-H. Emerging trends in global freshwater availability. Nature 2018, 557, 651-659.
• Zektser, I.S.; Everett, L.G. (Eds.) Groundwater Resources of the World and Their Use; UNESCO: Paris, France, 2004; Available online: http://unesdoc.unesco.org/images/0013/001344/134433e.pdf (accessed on 3 December 2020).
• Siebert, S.; Burke, J.; Faures, J.M.; Frenken, K.; Hoogeveen, J.; Döll, P.; Portmann, F.T. Groundwater use for irrigation-A global inventory. Hydrol. Earth Syst. Sci. 2010, 14, 1863-1880.
• Taylor, R.G.; Scanlon, B.; Döll, P.; Rodell, M.; Van Beek, R.; Wada, Y.; Longuevergne, L.; LeBlanc, M.; Famiglietti, J.; Edmunds, M.; et al. Ground water and climate change. Nat. Clim. Chang. 2013, 3, 322-329.
• Eurostat. Available online: https://ec.europa.eu/eurostat/web/products-datasets/-/env_wat_pop%20last (accessed on 7 June 2020).

タイトルに関連する用語 (6件)： カルスト ,  スプリング ,  rRNA遺伝子 ,  バーコード ,  膜フィルター ,  試験