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J-GLOBAL ID：202102248094874018   整理番号：21A0050520

肺腺癌における差次的発現蛋白質を,非標識プロテオミクス技術によって研究した。【JST・京大機械翻訳】

Profiling differentially expressed proteins in lung adenocarcinoma by label-free proteomics

著者 (3件)： Qiu Mantang (北京大学人民医院胸外科 100044) ,  Zu Guili (北京大学人民医院影像科 100044) ,  Jiang Guanchao (北京大学人民医院胸外科 100044)
資料名： Zhonghua Shiyan Waike Zazhi  (Zhonghua Shiyan Waike Zazhi)
巻： 37  号： 11  ページ： 2107-2109  発行年： 2020年 
JST資料番号： C2337A  ISSN： 1001-9030  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:非標識プロテオミクス技術による肺腺癌における蛋白質発現を研究する。方法:北京大学人民病院の5例の未治療の肺腺癌患者を選び、腫瘍組織と対がん組織の総蛋白を抽出し、高速液体クロマトグラフィー-質量分析併用技術により質量分析を行った。質量スペクトルのオリジナルデータは,Maxquantソフトウェアを使用して,非標識定量分析を行った。MaxquantによるライブラリファイルはPerseusソフトウェアを用いて解析した.肺腺癌の腫瘍組織と対の癌の隣接組織に対してペアのt検定を行い、差次的発現蛋白を選別し、そして差次的蛋白に対して遺伝子オントロジー(GO)と京都遺伝子とゲノム百科全書(KEGG)の通路の濃縮分析を行い、P<0.05は統計学的な差があった。【結果】11295のポリペプチドをデータベースによって得て,それぞれ908の蛋白質に対応し,そのうちの312の蛋白質は肺腺癌において有意差があり,110の蛋白質発現は上方制御され,212の蛋白質発現は下方制御された。肺癌におけるアップレギュレーション倍数が最も高いのはフェリチンで,ダウンレギュレーション倍数が最も高いのはCOL6A3であった。GO分析は,肺腺癌で差次的に発現する蛋白質が主に濃縮される分子機能をRNAbindingと示唆した。KEGG経路解析は,スプライスの経路が,差次的発現蛋白質で著しく濃縮されることを確認した。結論:非標識プロテオミクス技術により,肺腺癌における312の有意差発現蛋白質を見出した。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 質量分析 ,  データベース ,  定量分析 ,  ポリペプチド ,  遺伝子 ,  *タンパク質 ,  ソフトウェア ,  肺腫瘍 ,  *プロテオミクス
準シソーラス用語： *肺腺癌 ,  t検定 ,  蛋白質発現 ,  腫瘍組織 ,  KEGG ,  *差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  消化器の腫よう  (GH04000D)

タイトルに関連する用語 (6件)： 肺腺癌 ,  差次的発現 ,  蛋白質 ,  標識 ,  プロテオミクス ,  研究