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J-GLOBAL ID：202102248568319453   整理番号：21A1650481

トランスクリプトミクスに基づくチュウゴリカミキリの表皮蛋白質遺伝子ファミリーの同定および特徴分析【JST・京大機械翻訳】

Identification and characterization of cuticular protein gene families of Rhaphuma horsfieldi based on transcriptomics

著者 (4件)： Li Genceng (西南林業大学云南省森林災害預警与控制重点実験室,昆明650224) ,  Zhao Yujie (西南林業大学云南省森林災害預警与控制重点実験室,昆明650224) ,  Zhao Ning (西南林業大学云南省森林災害預警与控制重点実験室,昆明650224) ,  Liu Naiyong (西南林業大学云南省森林災害預警与控制重点実験室,昆明650224)
資料名： Huanjing Kunchong Xuebao  (Huanjing Kunchong Xuebao)
巻： 43  号： 1  ページ： 1-14  発行年： 2021年 
JST資料番号： C2927A  ISSN： 1674-0858  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 表皮蛋白質(cuticularprotein,CP)は昆虫の成長発育、外の悪環境などの方面で重要な作用があるが、しかし、チュウハリカミキリのRhaphumahorsfieldiにおけるCP遺伝子の研究はまだ空白である。本研究では、シークエンシングされたトランスクリプトームに基づき、バイオインフォマティクス技術を通じて、カミキリカミキリカミキリから全部で108個のCP遺伝子を同定し、41個のCP-RR1、30個のCP-RR2、8個のCPAP1、7個のCPAP3、3個のCPCFCを含む。14のCPUと5つのTWDL遺伝子のうち、39遺伝子は全長配列を持っている。CP-RR1とCP-RR2ファミリーは,1つの保存されたChitin_bind_4ドメインを有することを,ドメインと保存モチーフ解析は示した。その中でCP-RR1ファミリーは昆虫の古典的R&Rモチーフ(G-X(8)-G-X(6)-Y)に完全に合致したが,CP-RR2ファミリーの保存モチーフ(G-X-Y-X(5)-D-G-X(6)-Y)は変化した。進化分析は,RhorCPsが7つのファミリーに分類されることを示した:CP-RR1,CP-RR2,CPAP1,CPAP3,CPCFC,CPUとTWDL。発現プロファイルの結果,RhorCPs遺伝子の発現プロファイルは多様性があり,一部の遺伝子は検出組織で低い発現を示した。一部の遺伝子は触角と横節に特異的あるいは高発現しており、化学受容機能を有する可能性がある。一部の遺伝子は触角と横節を含まない体に発現し、成虫表皮の発育と形成に関与している可能性がある。研究結果は、後続の管紋虎天牛RhorCPs遺伝子の機能研究に基礎を築き、害虫防除の潜在的な分子標的を選別できる。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  触角 ,  *タンパク質 ,  昆虫類 ,  害虫防除 ,  成虫 ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： 配列解析 ,  バイオインフォマティクス ,  *トランスクリプトーム解析 ,  ドメイン構造 ,  *遺伝子ファミリー ,  分子標的 ,  遺伝子プロファイル , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： トランスクリプトミクス ,  表皮 ,  蛋白質 ,  遺伝子ファミリー ,  同定 ,  特徴分析