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J-GLOBAL ID：202102248622075765   整理番号：21A2364131

古細菌のミトコンドリアゲノムの進化傾向:GCBiasは水から土地への移行にどのように影響するか?【JST・京大機械翻訳】

Evolutionary Trends in the Mitochondrial Genome of Archaeplastida: How Does the GC Bias Affect the Transition from Water to Land?

著者 (8件)： Pedrola-Monfort Joan (Cavanilles Institute of Biodiversity and Evolutionary Biology, University of Valencia, 46980 Paterna, Spain) ,  Lazaro-Gimeno David (Cavanilles Institute of Biodiversity and Evolutionary Biology, University of Valencia, 46980 Paterna, Spain) ,  Boluda Carlos G. (Cavanilles Institute of Biodiversity and Evolutionary Biology, University of Valencia, 46980 Paterna, Spain) ,  Boluda Carlos G. (Unite de Phylogenie et Genetique Moleculaires, Conservatoire et Jardin Botaniques, Chambesy, 1292 Geneva, Switzerland) ,  Pedrola Laia (Cavanilles Institute of Biodiversity and Evolutionary Biology, University of Valencia, 46980 Paterna, Spain) ,  Garmendia Alfonso (Mediterranean Agroforestry Institute, Department of Agroforest Ecosystems, Polytechnic University of Valencia, 46022 Valencia, Spain) ,  Soler Carla (Biomaterials, Institute of Materials Science, University of Valencia, 46980 Paterna, Spain) ,  Soriano Jose M. (Biomaterials, Institute of Materials Science, University of Valencia, 46980 Paterna, Spain)
資料名： Plants (Web)  (Plants (Web))
巻： 9  号： 3  ページ： 358  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7261A  ISSN： 2223-7747  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 光合成生物の進化生物学における最も興味深いミステリーの中で,ミトコンドリアと核ゲノムサイズの劇的な増加と,特に水から土地への移行の間の3つの遺伝的区画の同時進化との劇的な増加の結果である。Archaeplastidaのミトコンドリアゲノムにおける進化傾向を明らかにするため,37の完全なゲノムから配列を分析した。したがって,著者らは,各サブユニットに対して100種のStreptophytaのミトコンドリア,色素体および核リボソームDNA分子マーカーを利用した。配列進化の階層的モデルを,ベース組成の不均一性をテストするために適合させた。最高尤度アプローチに当てはめた非均質および非定常モデルを用い,先祖のGuanine-Cytosin(GC)含量および平衡GC頻度(GC*)を再構成するために,最良結果の系統発生を用いた。ミトコンドリアゲノム長はArchaeplastida進化の反復配列と強く関連していた。しかし,長さは,異なる系統が多様な進化パターンを示すので,他の研究した変数とは関連しないようであった。対照的に,StreptophytaはGC含量,非コードDNA,および反復配列の間に強力な正の関係を示したが,Chlorophytaの進化はゲノム長と遺伝子数の間の強い正の直線関係を反映した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： DNA【核酸】 ,  遺伝 ,  遺伝子 ,  光合成 ,  色素体 ,  *ミトコンドリア ,  系統発生 ,  *土地 ,  *ゲノム ,  サブユニット ,  緑藻類 ,  *古細菌 ,  反復配列
準シソーラス用語： 尤度 ,  *ミトコンドリアゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 古細菌 ,  GCバイアス ,  平衡GC周波数 ,  GCコンテンツコンコミタンス ,  ミトコンドリアゲノムパターン

分類 (2件)： 進化論一般  (EC03010Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (58件)：

• Melton, J.T., III; Leliaert, F.; Tronholm, A.; Lopez-Bautista, J.M. The complete chloroplast and mitochondrial genomes of the green macroalga Ulva sp. UNA00071828 (Ulvophyceae, Chlorophyta). PLoS ONE 2015, 10, e0121020.
• Green, B.R. Chloroplast genomes of photosynthetic eukaryotes. Plant J. 2011, 66, 34-44.
• Wang, S.; Li, L.; Li, H.; Sahu, S.K.; Wang, H.; Xu, Y.; Xian, W.; Song, B.; Liang, H.; Cheng, S.; et al. Genomes of early-diverging streptophyte algae shed light on plant terrestrialization. Nat. Plants 2020, 6, 95-106.
• Kim, E.; Graham, L.E. EEF2 analysis challenges the monophyly of Archaeplastida and Chromalveolata. PLoS ONE 2008, 3, e2621.
• Chan, C.X.; Gross, J.; Yoon, H.S.; Bhattacharya, D. Plastid origin and evolution: New models provide insights into old problems. Plant Physiol. 2011, 155, 1552-1560.

タイトルに関連する用語 (7件)： 古細菌 ,  ミトコンドリアゲノム ,  進化 ,  傾向 ,  水 ,  土地 ,  移行