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J-GLOBAL ID：202102248769750374   整理番号：21A2842238

Cydiaポモネラグラニュロウイルスの耐性破壊市販分離株の遺伝子組成を同定するための次世代シークエンシングの利用【JST・京大機械翻訳】

Using Next Generation Sequencing to Identify and Quantify the Genetic Composition of Resistance-Breaking Commercial Isolates of Cydia pomonella Granulovirus

著者 (7件)： Alletti Gianpiero Gueli ,  Sauer Annette J. ,  Weihrauch Birgit ,  Fritsch Eva ,  Undorf-Spahn Karin ,  Wennmann Jorg T. ,  Jehle Johannes A.
資料名： Viruses (Web)  (Viruses (Web))
巻： 9  号： 9  ページ： 250  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7293A  ISSN： 1999-4915  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： タラリングガ(CM)幼虫の生物学的防除剤としてCydia pomonella granulvirus(CpGV)分離株の使用は,世界中で有機および統合pome果実生産において重要である。市販の分離株CpGV-0006,CpGV-R5およびCpGV-V15を,ヨーロッパにおけるCpGV耐性CM集団の制御のために選択した。感染実験では,CpGV-0006およびCpGV-R5はI型耐性を切断し,III型耐性も低かったが,CpGV-V15はI型およびIII型耐性は稀であった。Illumina配列決定読取における単一ヌクレオチド多型(SNP)の分布に基づいて,CpGVゲノムグループAの既知の遺伝的多様性を示す5つのCpGV分離株の全ゲノム配列に対するヌクレオチド組成の比較による次世代シークエンシング(NGS)ツールにより3つの分離株の遺伝的背景を調べ,2つの分離株CpGV-0006とCpGV-R5は,CpGVゲノムグループEのおよそ2分の3とゲノムグループAの1/3から成る高度に類似したゲノムグループ組成を有することを見出した。対照的に,CpGV-V15はCpGVゲノムグループBとE.の等しい部分からなり,これらの分離株の同定された遺伝的組成に従い,異なる耐性タイプに対する有効性を説明でき,耐性CM集団における耐性管理戦略の成功に関する予測を行うことができる。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝 ,  *遺伝子 ,  ヌクレオチド ,  幼虫 ,  ゲノム ,  ヨーロッパ ,  生物農薬 ,  有効性 ,  一塩基多型
準シソーラス用語： *Cydia ,  コドリンガ ,  ゲノム配列 ,  *分離株 ,  果実生産 ,  *次世代シークエンシング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (9件)： コドリンガ ,  グラニュロウイルス ,  バキュロウイルス科 ,  抵抗 ,  抵抗試験 ,  抵抗管理 ,  ゲノム多様性 ,  ゲノム組成 ,  一塩基多型(SNP)

分類 (4件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  ウイルスによる植物病害  (FC04054G) ,  神経の基礎医学  (GN01020W) ,  ウイルスの形態学,分類学  (EG04020U)

引用文献 (56件)：

• Herniou, E.A.; Arif, B.M.; Bonning, B.C.; Theilmann, D.A.; Blissard, G.W.; Becnel, J.J.; Jehle, J.A.; Harrison, R.L. Baculoviridae. In Virus Taxonomy; Elsevier: Oxford, UK, 2012; Volume 9, pp. 163-173.
• Tanada, Y. A granulosis virus of the codling moth, Carpocapsa pomonella (Linnaeus) (Olethreutidae, Lepidoptera). J. Invertebr. Pathol. 1964, 6, 378-380.
• Tanada, Y.; Leutenegger, R. Histopathology of a Granulosis-Virus Disease of the Codling Moth, Carpocapsa pomonella. J. Invertebr. Pathol. 1968, 10, 39-47.
• Gebhardt, M.M.; Eberle, K.E.; Radtke, P.; Jehle, J.A. Baculovirus resistance in codling moth is virus isolate-dependent and the consequence of a mutation in viral gene pe38. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2014, 111, 15711-15716.
• Wormleaton, S.L.; Winstanley, D. Phylogenetic analysis of conserved genes within the ecdysteroid UDP-glucosyltransferase gene region of the slow-killing Adoxophyes orana granulovirus. J. Gen. Virol. 2001, 82, 2295-2305.

タイトルに関連する用語 (7件)： 耐性 ,  破壊 ,  分離株 ,  遺伝子 ,  組成 ,  同定 ,  次世代シークエンシング