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J-GLOBAL ID：202102249559122609   整理番号：21A1990054

トランスクリプトーム解析はBombyx moriの20-ヒドロキシエクジソン調節オートファジーにおける長鎖非コードRNAの潜在的機能を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome analysis reveals potential function of long non-coding RNAs in 20-hydroxyecdysone regulated autophagy in Bombyx mori

著者 (16件)： Qiao Huili (China-UK-NYNU-RRes Joint Laboratory of insect biology, Henan Key Laboratory of Insect Biology in Funiu Mountain, Nanyang Normal University, Nanyang, Henan, China) ,  Wang Jingya (China-UK-NYNU-RRes Joint Laboratory of insect biology, Henan Key Laboratory of Insect Biology in Funiu Mountain, Nanyang Normal University, Nanyang, Henan, China) ,  Wang Jingya (School of Life Science, Zhengzhou University, Zhengzhou, Henan, China) ,  Wang Yuanzhuo (China-UK-NYNU-RRes Joint Laboratory of insect biology, Henan Key Laboratory of Insect Biology in Funiu Mountain, Nanyang Normal University, Nanyang, Henan, China) ,  Yang Juanjuan (China-UK-NYNU-RRes Joint Laboratory of insect biology, Henan Key Laboratory of Insect Biology in Funiu Mountain, Nanyang Normal University, Nanyang, Henan, China) ,  Wei Bofan (China-UK-NYNU-RRes Joint Laboratory of insect biology, Henan Key Laboratory of Insect Biology in Funiu Mountain, Nanyang Normal University, Nanyang, Henan, China) ,  Li Miaomiao (China-UK-NYNU-RRes Joint Laboratory of insect biology, Henan Key Laboratory of Insect Biology in Funiu Mountain, Nanyang Normal University, Nanyang, Henan, China) ,  Li Miaomiao (School of Life Science, Zhengzhou University, Zhengzhou, Henan, China) ,  Wang Bo (China-UK-NYNU-RRes Joint Laboratory of insect biology, Henan Key Laboratory of Insect Biology in Funiu Mountain, Nanyang Normal University, Nanyang, Henan, China) ,  Li Xiaozhe (China-UK-NYNU-RRes Joint Laboratory of insect biology, Henan Key Laboratory of Insect Biology in Funiu Mountain, Nanyang Normal University, Nanyang, Henan, China) ,  Cao Yang (State Key Laboratory of Silkworm Genome Biology / Biological Science Research Center, Southwest University, Chongqing, China) ,  Cao Yang (Guangdong Laboratory for Lingnan Modern Agriculture/Guangdong Provincial Key Laboratory of Agro-animal Genomics and Molecular Breeding, College of Animal Science, South China Agricultural University, Guangzhou, China) ,  Tian Ling (Guangdong Laboratory for Lingnan Modern Agriculture/Guangdong Provincial Key Laboratory of Agro-animal Genomics and Molecular Breeding, College of Animal Science, South China Agricultural University, Guangzhou, China) ,  Li Dandan (China-UK-NYNU-RRes Joint Laboratory of insect biology, Henan Key Laboratory of Insect Biology in Funiu Mountain, Nanyang Normal University, Nanyang, Henan, China) ,  Yao Lunguang (China-UK-NYNU-RRes Joint Laboratory of insect biology, Henan Key Laboratory of Insect Biology in Funiu Mountain, Nanyang Normal University, Nanyang, Henan, China) ,  Kan Yunchao (China-UK-NYNU-RRes Joint Laboratory of insect biology, Henan Key Laboratory of Insect Biology in Funiu Mountain, Nanyang Normal University, Nanyang, Henan, China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 22  号： 1  ページ： 1-16  発行年： 2021年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 20-ヒドロキシエクジソン(20E)は昆虫脱皮と変態において重要な役割を果たす。20E誘導オートファジーは,異なる昆虫の幼虫-蛹遷移の間に検出された。Bombyx moriにおいて,オートファジーは幼虫脂肪体において20Eにより誘導される。長い非コードRNA(lncRNAs)は,昆虫を含む多くの生物における様々な生物学的過程において機能する。多くのlncRNAは哺乳類におけるオートファジー発生の可能性があることが報告されているが,昆虫では研究されていない。20Eで注射した2および6時間後のB.moriの脂肪体からのRNAライブラリーを構築し,配列決定し,lncRNAおよびmRNAの包括的な分析を行った。905のlincRNAと130のアンチセンスlncRNAを含む合計1035のlncRNAを同定した。mRNAと比較して,lncRNAはより長い転写物長とより少ないエキソンを持っていた。注射後6時間で64lncRNAと比較して,132lncRNAsは注入後2時間で差次的に発現した。30の差次的に発現したlncRNAは注入後2および6時間で一般的であり,20E応答と関連すると仮定した。標的遺伝子分析は,6493lncRNA-mRNAシスペアと42,797lncRNA-mRNAトランスペアを予想した。LNC_000560の発現プロファイルは,その潜在的標的遺伝子,Atg4Bと高度に一致し,LNC_000560のRNAiは,LNC_000560とAtg4Bの発現を有意に低下させた。これらの結果は,LNC_000560がAtg4Bを調節することにより脂肪体の20E誘導オートファジーに潜在的に関与することを示した。本研究は,B.moriの脂肪体における20E誘導オートファジーと関連するlncRNAのゲノムワイド同定と機能的特性化を提供する。LNC_000560とその潜在的標的遺伝子は,B.moriにおける20調節オートファジーに関連すると同定された。これらの結果は,この昆虫モデルにおけるオートファジーおよび他の生物学的過程におけるlncRNAの調節機構をさらに研究することに役立つであろう。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： mRNA ,  哺乳類 ,  幼虫 ,  脱皮 ,  *カイコガ ,  キャラクタリゼーション ,  脂肪体 ,  RNA干渉 ,  *トランスクリプトーム ,  *オートファジー ,  *非翻訳RNA ,  *トランスクリプトーム解析 ,  標的遺伝子 ,  昆虫綱 ,  脊椎動物 ,  *ガ ,  *カイコガ科 ,  *無脊椎動物 ,  遺伝 ,  節足動物 ,  ステロール ,  エノン ,  脂環式アルコール ,  脂環式ケトン ,  ヒドロキシケトン ,  ポリオール
準シソーラス用語： 昆虫類 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： LncRNA ,  トランスクリプトーム ,  20-ヒドロキシエクジソン ,  オートファジー関連遺伝子 ,  カイコ

分類 (1件)： 細胞生理一般  (EF02010S)

物質索引 (1件)： 20-ヒドロキシエクジソン

引用文献 (75件)：

• Klionsky DJ, Abdelmohsen K, Abe A, Abedin MJ, Abeliovich H, Acevedo Arozena A, et al. Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy (3rd edition). Autophagy. 2016;12(1), 1-222.
• Annu Rev Genet; Regulation mechanisms and signaling pathways of autophagy; C He, DJ Klionsky; 43; 2009; 67-93; 10.1146/annurev-genet-102808-114910; citation_id=CR2
• Science; Autophagy in health and disease: a double-edged sword; T Shintani, DJ Klionsky; 306; 5698; 2004; 990-5; 10.1126/science.1099993; citation_id=CR3
• Cell; Biological Functions of Autophagy Genes: A Disease Perspective; B Levine, G Kroemer; 176; 1-2; 2019; 11-42; 10.1016/j.cell.2018.09.048; citation_id=CR4
• Annu Rev Cell Dev Biol; The role of Atg proteins in autophagosome formation; N Mizushima, T Yoshimori, Y Ohsumi; 27; 2011; 107-32; 10.1146/annurev-cellbio-092910-154005; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (5件)： トランスクリプトーム解析 ,  20-ヒドロキシエクジソン ,  調節 ,  オートファジー ,  長鎖非コードRNA