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J-GLOBAL ID：202102250052159358   整理番号：21A0280933

生グラム陽性細菌上に集合した補体系MACのin vivo架橋MS【JST・京大機械翻訳】

In vivo Cross-Linking MS of the Complement System MAC Assembled on Live Gram-Positive Bacteria

著者 (7件)： Khakzad Hamed (Equipe Signalisation Calcique et Infections Microbiennes, Ecole Normale Superieure Paris-Saclay, Gif-sur-Yvette, France) ,  Khakzad Hamed (Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale U1282, Gif-sur-Yvette, France) ,  Happonen Lotta (Faculty of Medicine, Department of Clinical Sciences, Division of Infection Medicine, Lund University, Lund, Sweden) ,  Tran Van Nhieu Guy (Equipe Signalisation Calcique et Infections Microbiennes, Ecole Normale Superieure Paris-Saclay, Gif-sur-Yvette, France) ,  Tran Van Nhieu Guy (Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale U1282, Gif-sur-Yvette, France) ,  Malmstrom Johan (Faculty of Medicine, Department of Clinical Sciences, Division of Infection Medicine, Lund University, Lund, Sweden) ,  Malmstrom Lars (Faculty of Medicine, Department of Clinical Sciences, Division of Infection Medicine, Lund University, Lund, Sweden)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 11  ページ： 612475  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 蛋白質-蛋白質相互作用は多くの生物学的過程において中心であるが,特に複雑な試料において特性化することは困難である。質量分析(MS)とコンピュータモデリングを組み合わせた蛋白質架橋は,蛋白質相互作用研究における実行可能なツールとして認識を増やしている。ここでは,コンピュータ高分子モデリングと組み合わせたin vivo架橋MSを用いた多成分ヒト補体系膜攻撃複合体(MAC)の構造への洞察を与えた。細菌表面に関連した天然MACを濃縮するために,生きたStreptococcus pyogenesを用いて,ヒト血漿への化学的架橋に続く親和性手順を開発した。この高度に複雑なサンプルにおいて,著者らは,異なるMAC成分間の100の架橋リジン-リジン対を同定し,その天然環境において集合したMACの4次モデルを提示することができた。著者らのアプローチの妥当性を実証するため,このMACモデルは既存のX線結晶学および電子クライオ-顕微鏡モデルによって支持された。このアプローチは天然環境を模倣する天然環境における蛋白質-蛋白質相互作用の研究を可能にする。電子クライオグラフィ実験におけるデータ解釈の援助と精製における高い可能性を議論した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 質量分析 ,  血漿 ,  *細菌 ,  自然環境 ,  *補体 ,  タンパク質 ,  ヒト ,  複合体 ,  連鎖球菌属 ,  親和性 ,  溶血性連鎖球菌 ,  コンピュータ ,  X線結晶学
準シソーラス用語： 蛋白質間相互作用 ,  分子モデリング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 膜攻撃複合体 ,  架橋質量分析 ,  Streptococcus pyogenes ,  グラム陽性菌 ,  in vivo架橋

分類 (3件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  質量分析  (CC03013N)

引用文献 (27件)：

• AebersoldR.MannM. (2003). Mass spectrometry-based proteomics. Nature 422 198-207.
• AkessonP.SjöholmA. G.BjörckL. (1996). Protein SIC, a novel extracellular protein of streptococcus pyogenes interfering with complement function. J. Biol. Chem. 271 1081-1088. doi: 10.1074/jbc.271.2.1081 8557634
• BerendsE. T. M.DekkersJ. F.NijlandR.KuipersA.SoppeJ. A.StrijpJ. A. G. v. (2013). Distinct localization of the complement C5b-9 complex on gram-positive bacteria. Cell. Microbiol. 15 1955-1968. doi: 10.1111/cmi.12170 23869880
• ChambersM. C. (2012). A cross-platform toolkit for mass spectrometry and proteomics. Nat. Biotechnol. 30 918-920.
• ChowdhuryS.HapponenL.KhakzadH.MalmströmL.MalmströmJ. (2020). Structural proteomics, electron cryo-microscopy and structural modeling approaches in bacteria-human protein interactions. Med. Microbiol. Immunol. 209 265-275. doi: 10.1007/s00430-020-00663-5 32072248

タイトルに関連する用語 (5件)： グラム陽性細菌 ,  集合 ,  補体系 ,  MAC ,  架橋