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J-GLOBAL ID：202102250058715987   整理番号：21A1150929

韓国,Ulleung島のFagus multinervisに特に重点を置いた東アジアミツバチのプラストーム特性化と系統ゲノミクス【JST・京大機械翻訳】

Plastome Characterization and Phylogenomics of East Asian Beeches with a Special Emphasis on Fagus multinervis on Ulleung Island, Korea

著者 (5件)： Yang JiYoung (Research Institute for Dok-do and Ulleung-do Island, Department of Biology, School of Life Sciences, Kyungpook National University, 80 Daehak-ro, Buk-gu, Gyeongsangbuk-do, Daegu 41566, Korea) ,  Takayama Koji (Department of Botany, Graduate School of Science, Kyoto University, Oiwake-cho, Kitashirakawa, Sakyo-ku, Kyoto 606-8502, Japan) ,  Youn Jin-Suk (Research Institute for Dok-do and Ulleung-do Island, Department of Biology, School of Life Sciences, Kyungpook National University, 80 Daehak-ro, Buk-gu, Gyeongsangbuk-do, Daegu 41566, Korea) ,  Pak Jae-Hong (Research Institute for Dok-do and Ulleung-do Island, Department of Biology, School of Life Sciences, Kyungpook National University, 80 Daehak-ro, Buk-gu, Gyeongsangbuk-do, Daegu 41566, Korea) ,  Kim Seung-Chul (Department of Biological Sciences, Sungkyunkwan University, 2066 Seobu-ro, Gyeonggi-do, Suwon 16419, Korea)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 11  号： 11  ページ： 1338  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Fagus属(Fagaceae)のBeech樹木は,北半球に偏在性で分布している。それらは混合広葉樹常緑落葉樹林の重要な成分であり,木材の経済的に重要な資源である。しかし,それらの生態学的および経済的重要性にもかかわらず,東アジアにおけるFagus種間の全体的なプラストーム進化については殆ど知られていない。特に,韓国のUlleung島に固有のブナ種であるF.multinervisの分類学的位置と状態は,今日でも不明である。したがって,本研究では,東アジアのFagus種の4つの新しく完成したプラストーム(F.crenataとF.multinervisの各々1つの系統とF.japonicaの2つの系統)を特性化した。さらに,これらの4つのプラストームをF.sylvatica(European ブナ)プラストームと比較した系統ゲノム解析を行った。4つのプラストームは高度に保存され,それらのサイズは158,163から158,348塩基対(bp)の範囲であった。全GC含有量は37.1%であり,配列類似性は99.8%から99.99%の範囲であった。Codon使用パターンは種間で類似し,77の共通蛋白質コード遺伝子のうち7つは陽性選択であった。さらに,著者らはFagus plastomes(ccsA/ndhD,ndhD/psaC,ndhF/rpl32,trnS-GCU/trnG-UCC,ycf1)の5つの高度可変ホットスポット領域を同定した。系統発生分析は,Fagusの単系統および亜属Fagusおよび単系統Englerianaの初期分岐を明らかにした。最後に,系統発生結果は,その近縁種F.englerianaとF.japonicaからのF.multinervisの分類学的識別を支持した。しかし,Ulleung島のF.multinervisの姉妹種と地理的起源は決定できなかった。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 木材 ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  系統発生 ,  ブナ科 ,  *ミツバチ ,  北半球 ,  生態学 ,  落葉樹林 ,  ホットスポット ,  広葉樹 ,  *ブナ属
準シソーラス用語： *ゲノミクス ,  分類学 ,  近縁種 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： プラストーム ,  東部アジアブナ ,  Fagus multinervis ,  Ulleung島 ,  ブナ科

分類 (2件)： 植物生態学  (EE02000E) ,  森林植物学  (FF02020E)

引用文献 (77件)：

• Denk, T. Phylogeny of Fagus L. (Fagaceae) based on morphological data. Plant. Syst. Evol. 2003, 240, 55-81.
• Denk, T.; Grimm, G.W.; Hemleben, V. Patterns of molecular and morphological differentiation in Fagus (Fagaceae): Phylogenetic implications. Amer. J. Bot. 2005, 92, 1006-1016.
• Zhou, G.; Li, X. Species composition and structure of Chinese beech forests. Nat. Hist. Res. 1994, 3, 21-26.
• Peters, R. Beech Forests; Kluwer Academic Publishers: Dordrecht, The Netherlands, 1997.
• Shen, C.-F. A monograph of the genus Fagus Tourn. ex L. (Fagaceae). Ph.D. Thesis, The City University of New York, New York, NY, USA, 1992.

タイトルに関連する用語 (7件)： 韓国 ,  Fagus ,  東アジア ,  ミツバチ ,  特性化 ,  系統 ,  ゲノミクス