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J-GLOBAL ID：202102250312461000   整理番号：21A2849322

低分子RNAトランスクリプトームのディープシークエンシングは肝細胞癌における新規非コードRNAを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Deep sequencing of small RNA transcriptome reveals novel non-coding RNAs in hepatocellular carcinoma

著者 (16件)： Law Priscilla T.-Y. (Department of Anatomical and Cellular Pathology, The Chinese University of Hong Kong, Shatin, N.T., Hong Kong) ,  Law Priscilla T.-Y. (State Key Laboratory in Oncology in South China, The Chinese University of Hong Kong, Shatin, N.T., Hong Kong) ,  Qin Hao (School of Life Sciences, The Chinese University of Hong Kong, Shatin, N.T., Hong Kong) ,  Ching Arthur K.-K. (Department of Anatomical and Cellular Pathology, The Chinese University of Hong Kong, Shatin, N.T., Hong Kong) ,  Ching Arthur K.-K. (State Key Laboratory in Oncology in South China, The Chinese University of Hong Kong, Shatin, N.T., Hong Kong) ,  Lai Keng Po (Department of Anatomical and Cellular Pathology, The Chinese University of Hong Kong, Shatin, N.T., Hong Kong) ,  Lai Keng Po (State Key Laboratory in Oncology in South China, The Chinese University of Hong Kong, Shatin, N.T., Hong Kong) ,  Co Ngai Na (Department of Anatomical and Cellular Pathology, The Chinese University of Hong Kong, Shatin, N.T., Hong Kong) ,  Co Ngai Na (State Key Laboratory in Oncology in South China, The Chinese University of Hong Kong, Shatin, N.T., Hong Kong) ,  He Mian (Department of Anatomical and Cellular Pathology, The Chinese University of Hong Kong, Shatin, N.T., Hong Kong) ,  He Mian (State Key Laboratory in Oncology in South China, The Chinese University of Hong Kong, Shatin, N.T., Hong Kong) ,  Lung Raymond W.-M. (Department of Anatomical and Cellular Pathology, The Chinese University of Hong Kong, Shatin, N.T., Hong Kong) ,  Chan Anthony W.-H. (Department of Anatomical and Cellular Pathology, The Chinese University of Hong Kong, Shatin, N.T., Hong Kong) ,  Chan Ting-Fung (School of Life Sciences, The Chinese University of Hong Kong, Shatin, N.T., Hong Kong) ,  Wong Nathalie (Department of Anatomical and Cellular Pathology, The Chinese University of Hong Kong, Shatin, N.T., Hong Kong) ,  Wong Nathalie (State Key Laboratory in Oncology in South China, The Chinese University of Hong Kong, Shatin, N.T., Hong Kong)
資料名： Journal of Hepatology  (Journal of Hepatology)
巻： 58  号： 6  ページ： 1165-1173  発行年： 2013年 
JST資料番号： A0278C  ISSN： 0168-8278  CODEN： JOHEEC  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 小さな非コードRNA(ncRNA)は腫瘍形成において重要な役割を果たすことがますます認識されている。深い配列決定の出現により,多くのヒト悪性腫瘍においてmiRNomeをプロファイル化する努力が払われてきた。しかし,肝細胞癌(HCC),特に非マイクロRNA転写物におけるncRNAに関する情報はまだ不足している。2つのHCC細胞株(HKCI-4とHKCI-8)の小RNAトランスクリプトームと不死化肝細胞系統(MIHA)を,Illumina massly 並列配列を用いて検査した。調節したncRNAは,定量的逆転写-ポリメラーゼ連鎖反応により,対HCC腫瘍と非腫瘍肝臓(n=73)で検証された。臨床病理学的相関とin vitro機能研究をさらに実施した。バイオインフォマティクスと生物学的分析は,ncRNAの存在を示し,肝臓腫瘍形成における新しいPIWI相互作用RNA(piRNA),piR-Hep1の関与が,対応する隣接非腫瘍肝臓と比較してHCC腫瘍の46.6%でアップレギュレートされることを見出した。piR-Hep1のサイレンシングは,活性AKTリン酸化レベルの同時減少を伴って,細胞生存率,運動性および侵襲性を阻害した。miRNAの分析において,HCCにおけるmiR-1323の豊富な発現および肝硬変背景から生じる腫瘍におけるその明確な関連を初めて示した。さらに,肝硬変HCCにおけるmiR-1323過剰発現は,患者の無病および全生存不良と相関した(p<0.009)。本研究は,癌におけるncRNomeの解剖における次世代シークエンシングの価値を示した。トランスクリプトームの包括的な定義は,実質的にすべてのタイプのncRNAを明らかにし,肝臓発癌物質事象への新しい洞察を提供する。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *RNA【核酸】 ,  肝硬変 ,  腫瘍 ,  ヒト ,  *肝細胞癌 ,  PCR法 ,  腫瘤形成 ,  *肝細胞 ,  *トランスクリプトーム ,  遺伝子サイレンシング
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  *非翻訳RNA ,  悪性腫瘍 ,  バイオインフォマティクス ,  過剰発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 肝細胞癌 ,  小RNA配列決定 ,  PIWI相互作用RNA ,  マイクロRNA ,  バイオマーカー

分類 (3件)： 消化器の腫よう  (GH04000D) ,  発癌機序・因子  (GE02020C) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： 低分子RNA ,  トランスクリプトーム ,  ディープシークエンシング ,  肝細胞癌 ,  非コードRNA