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J-GLOBAL ID：202102250413592777   整理番号：21A0020894

RNA構造動力学はトランスクリプトーム運命と機能を制御することにより初期胚発生を調節する【JST・京大機械翻訳】

RNA structural dynamics regulate early embryogenesis through controlling transcriptome fate and function

著者 (25件)： Shi Boyang (CAS Key Laboratory of Genomic and Precision Medicine, Collaborative Innovation Center of Genetics and Development, College of Future Technology, Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Shi Boyang (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Zhang Jinsong (MOE Key Laboratory of Bioinformatics, Center for Synthetic and Systems Biology, Beijing Advanced Innovation Center for Structural Biology, Tsinghua-Peking Joint Center for Life Sciences, School of Life Sciences, Tsinghua University, Beijing, China) ,  Heng Jian (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Heng Jian (State Key Laboratory of Membrane Biology, Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Gong Jing (MOE Key Laboratory of Bioinformatics, Center for Synthetic and Systems Biology, Beijing Advanced Innovation Center for Structural Biology, Tsinghua-Peking Joint Center for Life Sciences, School of Life Sciences, Tsinghua University, Beijing, China) ,  Zhang Ting (CAS Key Laboratory of Genomic and Precision Medicine, Collaborative Innovation Center of Genetics and Development, College of Future Technology, Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Zhang Ting (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Li Pan (MOE Key Laboratory of Bioinformatics, Center for Synthetic and Systems Biology, Beijing Advanced Innovation Center for Structural Biology, Tsinghua-Peking Joint Center for Life Sciences, School of Life Sciences, Tsinghua University, Beijing, China) ,  Sun Bao-Fa (CAS Key Laboratory of Genomic and Precision Medicine, Collaborative Innovation Center of Genetics and Development, College of Future Technology, Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Sun Bao-Fa (Institute of Stem Cell and Regeneration, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Yang Ying (CAS Key Laboratory of Genomic and Precision Medicine, Collaborative Innovation Center of Genetics and Development, College of Future Technology, Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Yang Ying (Institute of Stem Cell and Regeneration, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Zhang Ning (State Key Laboratory of Environmental Chemistry and Ecotoxicology, Research Center for Eco-Environmental Sciences, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Zhao Yong-Liang (CAS Key Laboratory of Genomic and Precision Medicine, Collaborative Innovation Center of Genetics and Development, College of Future Technology, Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Zhao Yong-Liang (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Zhao Yong-Liang (Institute of Stem Cell and Regeneration, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Wang Hai-Lin (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Wang Hai-Lin (State Key Laboratory of Environmental Chemistry and Ecotoxicology, Research Center for Eco-Environmental Sciences, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Liu Feng (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Liu Feng (State Key Laboratory of Membrane Biology, Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Zhang Qiangfeng Cliff (MOE Key Laboratory of Bioinformatics, Center for Synthetic and Systems Biology, Beijing Advanced Innovation Center for Structural Biology, Tsinghua-Peking Joint Center for Life Sciences, School of Life Sciences, Tsinghua University, Beijing, China) ,  Yang Yun-Gui (CAS Key Laboratory of Genomic and Precision Medicine, Collaborative Innovation Center of Genetics and Development, College of Future Technology, Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Yang Yun-Gui (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Yang Yun-Gui (Institute of Stem Cell and Regeneration, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China)
資料名： Genome Biology (Web)  (Genome Biology (Web))
巻： 21  号： 1  ページ： 1-27  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7384A  ISSN： 1474-760X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 脊椎動物の初期胚発生は,最初に母性RNAと蛋白質のセットにより指向されるが,このプログラムを制御する機構は,大部分が未知のままである。RNA構造に関する最近のトランスクリプトームワイド研究は,RNAプロセシングと機能におけるその普及と重要な役割を明らかにしたが,RNA構造が母性トランスクリプトームの運命をどのように調節するかは,まだ決定されていない。ここでは,ゼブラフィッシュ初期胚発生の間のicSHAPEによる4つのヌクレオチドに基づくmRNA構造の大域的マップを確立した。驚くべきことに,著者らはRNA構造可変領域が3′UTRに富んでおり,母系から接合体への移行(MZT)に重要なシス調節要素を含むことを観察した。RNA結合蛋白質Elavl1aはシスエレメントへの結合により母性mRNAを安定化することを見出した。逆に,RNA構造形成は,Elavl1aの結合を抑制し,その母性標的の減衰をもたらす。著者らの研究は,RNA構造可変領域がmRNA3′UTRsに富み,ゼブラフィッシュ初期胚発生の間にシス調節要素を含むことを見出した。Elavl1aはRNA構造依存的様式で母性RNA安定性を調節することを明らかにした。全体として,我々の知見は脊椎動物初期胚発生におけるRNA構造に基づく調節の広範な基本的役割を明らかにする。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *RNA【核酸】 ,  mRNA ,  調節遺伝子 ,  脊椎動物 ,  タンパク質 ,  ヌクレオチド ,  接合子 ,  ゼブラフィッシュ ,  *トランスクリプトーム ,  RNA結合タンパク質
準シソーラス用語： 3′非翻訳領域 ,  RNA安定性 ,  *初期胚発生 ,  シスエレメント ,  *RNA構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： RNA構造 ,  ゼブラフィッシュ初期胚発生 ,  構造ベースのレギュロン ,  Elavl1a

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (69件)：

• Development.; The maternal-to-zygotic transition: a play in two acts; W Tadros, HD Lipshitz; 136; 2009; 3033-3042; citation_id=CR1
• Annu Rev Cell Dev Biol; Zygotic genome activation during the maternal-to-zygotic transition; MT Lee, AR Bonneau, AJ Giraldez; 30; 2014; 581-613; citation_id=CR2
• Curr Top Dev Biol; The maternal-to-zygotic transition during vertebrate development: a model for reprogramming; V Yartseva, AJ Giraldez; 113; 2015; 191-232; citation_id=CR3
• Curr Opin Genet Dev; Early zebrafish development: it's in the maternal genes; EW Abrams, MC Mullins; 19; 2009; 396-403; citation_id=CR4
• Mol Cell; Terminal uridylyltransferases execute programmed clearance of maternal transcriptome in vertebrate embryos; H Chang, J Yeo, JG Kim, H Kim, J Lim, M Lee, HH Kim, J Ohk, HY Jeon, H Lee; 70; 2018; 72-82.e77; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (5件)： RNA構造 ,  動力学 ,  トランスクリプトーム ,  初期胚発生 ,  調節