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J-GLOBAL ID：202102250656901134   整理番号：21A0682306

南極水域からのカイアシ類Rhincalanus gigasの最初のde novoトランスクリプトーム【JST・京大機械翻訳】

First De Novo Transcriptome of the Copepod Rhincalanus gigas from Antarctic Waters

著者 (5件)： Lauritano Chiara (Marine Biotechnology Department, Stazione Zoologica Anton Dohrn, Villa Comunale, 80121 Napoli, Italy) ,  Roncalli Vittoria (Integrative Marine Ecology Department, Stazione Zoologica Anton Dohrn, Villa Comunale, 80121 Napoli, Italy) ,  Ambrosino Luca (Research Infrastructure for Marine Biological Resources Department, Stazione Zoologica Anton Dohrn, Villa Comunale, 80121 Napoli, Italy) ,  Cieslak Matthew C. (Pacific Biosciences Research Center, University of Hawai’i at Manoa, 1993 East-West Rd., Honolulu, HI 96822, USA) ,  Ianora Adrianna (Marine Biotechnology Department, Stazione Zoologica Anton Dohrn, Villa Comunale, 80121 Napoli, Italy)
資料名： Biology (Web)  (Biology (Web))
巻： 9  号： 11  ページ： 410  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7145A  ISSN： 2079-7737  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 南極水域は,我々の惑星のほとんど未利用の多様化資源である。南極生物に対する分子資源は非常に制限され,主に種遺伝子タイピングに使用される配列によって代表されている。本研究では,南極水の主な動物プランクトン種の1つであるカイアシ類Rhincalanusギガに対する最初のトランスクリプトームを示した。このトランスクリプトームは,真核生物カイアシ類に対する最初の分子資源でもある。トランスクリプトームは高品質で完全性である。グルタチオン代謝経路内の抗凍結蛋白質および遺伝子重複をコードする3つの予測遺伝子の存在が,この過酷な環境に対処する可能な適応として示唆される。R.gigasのトランスクリプトームは,極性の生物学的過程と生態学に関連した分子基盤を研究するための強力な新しい資源である。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 惑星 ,  遺伝子 ,  代謝経路 ,  南極 ,  動物プランクトン ,  真核生物 ,  *カイアシ類 ,  生態学 ,  多様化 ,  完全性 ,  *水域 ,  遺伝子重複 ,  *トランスクリプトーム ,  脂肪族アミン ,  チオール ,  脂肪族カルボン酸 ,  トリペプチド ,  含硫アミノ酸
準シソーラス用語： Rhincalanus , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： カイアシ類 ,  トランスクリプトーム ,  南シェトランド海溝 ,  南極水域

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  プランクトン  (FH02050R)

物質索引 (1件)： グルタチオン

引用文献 (46件)：

• Convey, P.; Peck, L.S. Antarctic environmental change and biological responses. Sci. Adv. 2019, 5, eaaz0888.
• Voronina, N.M. Comparative abundance and distribution of major filter-feeders in the Antarctic pelagic zone. J. Mar. Syst. 1998, 17, 375-390.
• Kang, S.; Ahn, D.-H.; Lee, J.H.; Lee, S.G.; Shin, S.C.; Lee, J.; Min, G.-S.; Lee, H.; Kim, H.-W.; Kim, S.; et al. The genome of the Antarctic-endemic copepod, Tigriopus kingsejongensis. GigaScience 2017, 6.
• Sales, G.; Deagle, B.E.; Calura, E.; Martini, P.; Biscontin, A.; Pittà, C.D.; Kawaguchi, S.; Romualdi, C.; Meyer, B.; Costa, R.; et al. KrillDB: A de novo transcriptome database for the Antarctic krill (Euphausia superba). PLoS ONE 2017, 12, e0171908.
• Johnson, K.M.; Hofmann, G.E. A transcriptome resource for the Antarctic pteropod Limacina helicina antarctica. Mar. Genom. 2016, 28, 25-28.

タイトルに関連する用語 (4件)： 南極 ,  水域 ,  カイアシ類 ,  トランスクリプトーム