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J-GLOBAL ID：202102250720030355   整理番号：21A2364073

miRNA成熟経路に関与する蛋白質の分子進化と多様化【JST・京大機械翻訳】

Molecular Evolution and Diversification of Proteins Involved in miRNA Maturation Pathway

著者 (10件)： Moturu Taraka Ramji (Mendel Centre for Plant Genomics and Proteomics, Central European Institute of Technology (CEITEC), Masaryk University, Kamenice, 62500 Brno, Czech Republic) ,  Moturu Taraka Ramji (National Centre for Biomolecular Research, Faculty of Science, Masaryk University, Kamenice, 62500 Brno, Czech Republic) ,  Sinha Sansrity (Department of Biomolecular Sciences, Weizmann Institute of Sciences, Rehovot 7610001, Israel) ,  Salava Hymavathi (Repository of Tomato Genomics Resources, Department of Plant Sciences, University of Hyderabad, Hyderabad 500046, India) ,  Thula Sravankumar (Mendel Centre for Plant Genomics and Proteomics, Central European Institute of Technology (CEITEC), Masaryk University, Kamenice, 62500 Brno, Czech Republic) ,  Nodzynski Tomasz (Mendel Centre for Plant Genomics and Proteomics, Central European Institute of Technology (CEITEC), Masaryk University, Kamenice, 62500 Brno, Czech Republic) ,  Varekova Radka Svobodova (National Centre for Biomolecular Research, Faculty of Science, Masaryk University, Kamenice, 62500 Brno, Czech Republic) ,  Varekova Radka Svobodova (Centre for Structural Biology, Central European Institute of Technology (CEITEC), Masaryk University, Kamenice, 62500 Brno, Czech Republic) ,  Friml Jiri (Institute of Science and Technology (IST Austria), 3400 Klosterneuburg, Austria) ,  Simon Sibu (Mendel Centre for Plant Genomics and Proteomics, Central European Institute of Technology (CEITEC), Masaryk University, Kamenice, 62500 Brno, Czech Republic)
資料名： Plants (Web)  (Plants (Web))
巻： 9  号： 3  ページ： 299  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7261A  ISSN： 2223-7747  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： RNAポリメラーゼIIにより転写される低分子RNA(smRNA,1925ヌクレオチド長)は真核生物における多数の過程に関与する遺伝子の発現を調節する。miRNA生合成と生物発生経路に関与する蛋白質は植物と動物系統で異なる。生物発生経路を構成する主要な蛋白質,すなわち,Dicers(DCL/DCR)とArgonautes(AGO)は広く研究されている。しかし,2つの系統で異なる経路のアクセサリー蛋白質(DAWDLE(DDL),SERRATE(SE),およびTOUGH(TGH))は,ほとんど特性化されていない。真核生物にわたるこれらの蛋白質の分子進化と発散に関する初めての詳細な報告を示した。DDLは真核生物と原核生物に存在するが,SEとTGHは真核生物に特異的なようである。3つの蛋白質における特異的ドメインおよび/またはドメイン特異的配列分岐の付加/欠失は,2つの系統にわたるこれらの蛋白質の観察された機能的相違点を示し,それは2つの系統にわたるmiRNA長の差と相関する。著者らのデータは,これらの蛋白質の構造機能関係の現在の理解を強化し,さらなる機能的特性化のための基礎として使用できる3つの蛋白質における以前の未調査の重要な残基を明らかにする。樹冠真核生物系統におけるmiRNAの数に関するここに示したデータは,動物および植物系統におけるmiRNAコード遺伝子の数の拡大の概念と一致し,生物の複雑性と相関する。ここで検討した3つの蛋白質の多様化(または存在/不在)と機能的に相関するこの違いが,植物および動物系統におけるmiRNAシグナル伝達は,不明である。ここで研究した3つの蛋白質および植物および動物系統におけるmiRNA遺伝子の進化に関する以前に利用可能なデータを基に,miRNAはおそらく祖先の真核生物に一度進化し,真核生物において独立して多様化していると信じている。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 生合成 ,  遺伝子 ,  *タンパク質 ,  ヌクレオチド ,  系統発生 ,  *分子進化 ,  真核生物 ,  原核生物 ,  細胞情報伝達 ,  RNAポリメラーゼII
準シソーラス用語： *マイクロRNA ,  ドメイン構造 ,  低分子RNA ,  蛋白質構造 ,  残基 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： 低分子RNA(smRNAs) ,  ドル(DDL) ,  タフ(TGH) ,  Serrate(SE/ARS2) ,  アルゴノート(AGO) ,  ダイサー様(DCR/DCL) ,  進化 ,  系統発生

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

引用文献 (75件)：

• Chapman, E.J.; Carrington, J.C. Specialization and evolution of endogenous small RNA pathways. Nat. Rev. Genet. 2007, 8, 884.
• Ramachandran, V.; Chen, X. Small RNA metabolism in Arabidopsis. Trends Plant Sci. 2008, 13, 368-374.
• Vaucheret, H. Post-transcriptional small RNA pathways in plants: Mechanisms and regulations. Genes Dev. 2006, 20, 759-771.
• Vazquez, F.; Legrand, S.; Windels, D. The biosynthetic pathways and biological scopes of plant small RNAs. Trends Plant Sci. 2010, 15, 337-345.
• Voinnet, O. Origin, biogenesis, and activity of plant microRNAs. Cell 2009, 136, 669-687.

タイトルに関連する用語 (6件)： miRNA ,  成熟 ,  経路 ,  蛋白質 ,  分子進化 ,  多様化