ナイルティラピアにおける生殖腺発達中のヒストンリジンデメチラーゼ(KDM)遺伝子のゲノムワイド同定,進化および発現【JST・京大機械翻訳】

Qin Zuliang; Li Zhiqiang; Yang Shuangyi; Wang Feilong; Gao Tian; Tao Wenjing; Zhou Linyan; Wang Deshou; Sun Lina

文献

J-GLOBAL ID：202102250838302991 整理番号：21A3313889

ナイルティラピアにおける生殖腺発達中のヒストンリジンデメチラーゼ(KDM)遺伝子のゲノムワイド同定,進化および発現【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide identification, evolution of histone lysine demethylases (KDM) genes and their expression during gonadal development in Nile tilapia

出版者サイト複写サービスで全文入手 {{ this.onShowCLink("http://jdream3.com/copy/?sid=JGLOBAL&noSystem=1&documentNoArray=21A3313889&COPY=1") }}
高度な検索・分析はJDreamⅢで {{ this.onShowJLink("http://jdream3.com/lp/jglobal/index.html?docNo=21A3313889&from=J-GLOBAL&jstjournalNo=A0956B") }}

著者 (9件)： , , , , , , , ,
資料名：
巻： 257 ページ： Null 発行年： 2022年
JST資料番号： A0956B ISSN： 1096-4959 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ヒストンリジンデメチラーゼ(KDM)はヒストン脱メチル化に関与し,遺伝子発現調節に関与する。以前の研究は,ヒストンリジン脱メチル化が脊椎動物の生殖腺発生に重要な役割を果たすことを示した。KDMファミリーは,8つのサブファミリー,すなわち,kdm1,kdm2,kdm3,kdm4,kdm5,kdm6,kdm7およびJmjCのみのサブファミリーから成る。本研究では,23の代表的種における13から63KDM遺伝子をゲノムアセンブリの利用可能なバージョンに基づいて同定した。これらの遺伝子の系統学的関係,ドメイン構造,およびシンテニーを包括的に分析し,結果はKDM遺伝子がおそらく初期分岐後生動物に由来し,複数の全ゲノム重複,特に3ラウンド全ゲノム重複(3R-WGD)および硬骨魚類の倍数体化で脊椎動物において有意に拡大したことを示唆した。kdm2,kdm3,kdm4,kdm5,kdm6およびkdm7のサブファミリーは1R-2R事象で重複し,kdm2a,kdm4a,kdm5bおよびkdm6bの複製は3R-WGDから生じた。トランスクリプトームデータに基づいて,KDM遺伝子は卵巣と精巣で優勢に発現していた。KDM遺伝子の80%以上が性的二形性発現を示し,卵巣で主に発現する15の遺伝子と精巣で主に発現した12の遺伝子があった。重要なことに,トランスクリプトームデータ,qRT-PCRおよび性反転時の蛍光in situハイブリダイゼーションから,kdm1bおよび2つのJmjCのみのサブファミリーメンバーhspbap1およびriox1のような精巣より卵巣においてより高い発現を有する遺伝子はダウンレギュレートされ,一方,卵巣より精巣においてより高い発現を有するkdm3c,kdm5bb,kdm6ba,kdm6bbおよびkdm7bのような他の遺伝子は,卵精巣においてアップレギュレートされ,これらの遺伝子が生殖腺発達および性反転において決定的役割を果たすことを示した。本研究は,硬骨魚類における性分化および生殖腺発生における重要な役割を理解するためのKDM遺伝子の進化および基本的手がかりへの新しい洞察を提供する。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

, , , , , , , , , , , , , , ,
, , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： , , , ,

遺伝子発現 , 魚類

, , , , , , ,

前のページに戻る