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J-GLOBAL ID：202102251884917749   整理番号：21A0059411

哺乳類におけるトランスクリプトームとトランスレートームの共進化

Transcriptome and translatome co-evolution in mammals

著者 (18件)： WANG Zhong-Yi (Center for Molecular Biology of Heidelberg Univ. (ZMBH), DKFZ-ZMBH Alliance, Heidelberg, DEU) ,  LEUSHKIN Evgeny (Center for Molecular Biology of Heidelberg Univ. (ZMBH), DKFZ-ZMBH Alliance, Heidelberg, DEU) ,  OVCHINNIKOVA Svetlana (Center for Molecular Biology of Heidelberg Univ. (ZMBH), DKFZ-ZMBH Alliance, Heidelberg, DEU) ,  MOESSINGER Katharina (Center for Molecular Biology of Heidelberg Univ. (ZMBH), DKFZ-ZMBH Alliance, Heidelberg, DEU) ,  BRUENING Thoomke (Center for Molecular Biology of Heidelberg Univ. (ZMBH), DKFZ-ZMBH Alliance, Heidelberg, DEU) ,  CARDOSO-MOREIRA Margarida (Center for Molecular Biology of Heidelberg Univ. (ZMBH), DKFZ-ZMBH Alliance, Heidelberg, DEU) ,  ANDERS Simon (Center for Molecular Biology of Heidelberg Univ. (ZMBH), DKFZ-ZMBH Alliance, Heidelberg, DEU) ,  KAESSMANN Henrik (Center for Molecular Biology of Heidelberg Univ. (ZMBH), DKFZ-ZMBH Alliance, Heidelberg, DEU) ,  LIECHTI Angelica (Center for Integrative Genomics, Univ. Lausanne, Lausanne, CHE) ,  RUMMEL Coralie (Center for Integrative Genomics, Univ. Lausanne, Lausanne, CHE) ,  JANICH Peggy (Center for Integrative Genomics, Univ. Lausanne, Lausanne, CHE) ,  GATFIELD David (Center for Integrative Genomics, Univ. Lausanne, Lausanne, CHE) ,  GRUETZNER Frank (Robinson Res. Inst., School of Biological Sci., Univ. Adelaide, Adelaide, South Australia, AUS) ,  DIAGOURAGA Boubou (Inst. of Human Genetics, Centre National de la Rech. Scientifique, Univ. de Montpellier, Montpellier, FRA) ,  DE MASSY Bernard (Inst. of Human Genetics, Centre National de la Rech. Scientifique, Univ. de Montpellier, Montpellier, FRA) ,  GILL Mark E. (Friedrich Miescher Inst. for Biomedical Res., Basel, CHE) ,  PETERS Antoine H. F. M. (Friedrich Miescher Inst. for Biomedical Res., Basel, CHE) ,  PETERS Antoine H. F. M. (Fac. of Sci., Univ. Basel, Basel, CHE)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 588  号： 7839  ページ： 642-647  発行年： 2020年12月24日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝子発現プログラムによって,共有される表現型や種特異的な表現型が定まるが,それらの進化の特徴についてはトランスクリプトーム層を超えたものはほとんど明らかになっていない。今回我々は,5種の哺乳類(ヒト,アカゲザル,マウス,ハイイロジネズミオポッサム,カモノハシ)と1種の鳥類(セキショクヤケイ)の3器官(脳,肝臓,精巣)において,リボソームプロファイリングと対応するRNA塩基配列解読のデータを用い,トランスレートームとトランスクリプトームの共進化について解析を行った。種内解析の結果から,翻訳調節が異なる器官で広く見られ,特に精巣の精子形成細胞タイプ全体に多く見られることが明らかになった。一方,遺伝子発現における種間の相違は,トランスレートーム層ではトランスクリプトーム層より約20%少なかった。これは,これらの発現層の間に広範な緩衝が存在するためで,特に進化的に古い遺伝子,必須遺伝子,ハウスキーピング遺伝子が保存されていた。翻訳の上方制御は,具体的には,性染色体の進化では全体的な遺伝子量の減少を,精子形成では減数分裂での性染色体不活性化の影響を相殺した。緩衝が全体的に見られるにもかかわらず,一部の遺伝子はトランスレートーム層でより速く進化しており,これは,発現における適応変化を示している可能性がある。こうした遺伝子の割合が最も高いのは,精巣組織であった。質量分析によるプロテオミクスデータを統合したさらなる解析からは,トランスクリプトームとトランスレートームの共進化がプロテオーム層に反映されていることが立証された。まとめると我々の研究は,複数の発現層にわたる共進化パターンと関連する選択圧を明らかにするとともに,哺乳類器官におけるそれらの相互作用を理解するための情報資源となる。Copyright Nature Japan KK 2021

シソーラス用語： RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  減数分裂 ,  精巣 ,  ヌクレオチド配列 ,  ヒト ,  表現型 ,  リボソーム ,  アカゲザル ,  遺伝子発現 ,  ハウスキーピング遺伝子 ,  プロテオミクス ,  *トランスクリプトーム ,  プロテオーム
準シソーラス用語： *共進化 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (3件)： 哺乳類 ,  トランスクリプトーム ,  共進化