プロテオミクス解析を知らせるためにより深いORFアノテーションとトランスクリプトミクスを用いた病原体-宿主系のモデリング【JST・京大機械翻訳】

Leblanc Sebastien; Leblanc Sebastien; Brunet Marie A.; Brunet Marie A.

文献

J-GLOBAL ID：202102252479089679 整理番号：21A0211793

プロテオミクス解析を知らせるためにより深いORFアノテーションとトランスクリプトミクスを用いた病原体-宿主系のモデリング【JST・京大機械翻訳】

Modelling of pathogen-host systems using deeper ORF annotations and transcriptomics to inform proteomics analyses

出版者サイト複写サービスで全文入手 {{ this.onShowCLink("http://jdream3.com/copy/?sid=JGLOBAL&noSystem=1&documentNoArray=21A0211793&COPY=1") }}
高度な検索・分析はJDreamⅢで {{ this.onShowJLink("http://jdream3.com/lp/jglobal/index.html?docNo=21A0211793&from=J-GLOBAL&jstjournalNo=W3522A") }}

著者 (4件)： , , ,
資料名：
巻： 18 ページ： 2836-2850 発行年： 2020年
JST資料番号： W3522A ISSN： 2001-0370 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

Zikaウイルスは,劇症発生を引き起こし,Guillain-Barre症候群,微小頭症および胎児脱皮をもたらすフラビウイルスである。他のフラビウイルスと同様に,Zikaウイルスは蚊により伝達され,神経疾患を引き起こす。公衆衛生へのリスクにもかかわらず,抗ウイルス薬やワクチンは現在利用できない。近年,いくつかの研究は,その病原性をより良く理解するために,Zikaウイルス蛋白質と相互作用するヒト宿主蛋白質の同定をセットしている。しかし,これらの研究は標準ヒト蛋白質配列データベースを使用した。そのようなデータベースは,最小オープンリーディングフレーム(ORF)長基準を強制するゲノムアノテーションに依存する。増え続ける研究は,数千の機能性ORFを見落としているそのような注釈の短所を実証してきた。ここでは,現在非注釈蛋白質を含むカスタマイズデータベースの使用により,ウイルスカプシドとNS4A蛋白質の相互作用者として4つの代替蛋白質を同定した。さらに,12の代替蛋白質を,Zika感染単球のプロテオームプロファイリングで同定し,その内の1つは,有意に上方制御された。本研究では,Zikaウイルスによる感染時のウイルス-宿主蛋白質相互作用をより良く調べるためのプロテオミクスデータセットの再解析に対する計算フレームワークを提示した。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

, , , , , , , , , , , , ,
, 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： , , , , ,

ウイルス感染の生理と病原性 , ウイルスの生化学

, , , , , ,

前のページに戻る