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J-GLOBAL ID：202102254304443229   整理番号：21A0720307

Deinococcus radioduransの熱ストレス耐性に関与する新規非コードRNA dsr11【JST・京大機械翻訳】

A Novel Noncoding RNA dsr11 Involved in Heat Stress Tolerance in Deinococcus radiodurans

著者 (11件)： Xue Dong (Biotechnology Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China) ,  Xue Dong (Microbial Processes and Interactions (MiPI), TERRA Teaching and Research Centre, Gembloux Agro-Bio Tech, University of Liege, 5030 Gembloux, Belgium) ,  Chen Yun (Biotechnology Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China) ,  Li Jiang (Biotechnology Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China) ,  Han Jiahui (Biotechnology Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China) ,  Zhou Zhengfu (Biotechnology Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China) ,  Zhang Wei (Biotechnology Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China) ,  Chen Ming (Biotechnology Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China) ,  Lin Min (Biotechnology Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China) ,  Ongena Marc (Microbial Processes and Interactions (MiPI), TERRA Teaching and Research Centre, Gembloux Agro-Bio Tech, University of Liege, 5030 Gembloux, Belgium) ,  Wang Jin (Biotechnology Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China)
資料名： Biomolecules (Web)  (Biomolecules (Web))
巻： 10  号： 1  ページ： 22  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7148A  ISSN： 2218-273X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Deinococcus radioduransは,様々な環境ストレス条件下で生存を可能にするためのマスターフルな戦略を進化させる極めて抵抗性の細菌である。熱ストレスは,蛋白質の変性,膜破壊および酸化ストレスを引き起こす主要な環境ストレス因子である。以前の研究は,蛋白質レベルの変化を分析することによって,熱ストレス応答の機構を調査した。しかし,様々な環境ストレス応答において細菌において重要な調節機能を担うことが知られている小さな非コードRNA(ncRNA)の役割についてはほとんど知られていない。D.radioduransのncRNA dsr11は,以前にRNA-seqとノーザンブロットによって同定された。本研究では,dsr11の転写レベルがqRT-PCR分析により熱ストレス下で4.2倍アップレギュレートされることを示した。耐熱性アッセイは,dsr11の欠失が高温条件下で生存率を有意に阻害することを示した。D.radioduransトランスクリプトームに対するdsr11の影響を評価するため,157遺伝子をRNA-seq実験によってノックアウト変異体で差次的に発現した。RNA-seqとin silico分析を組み合わせて,trmE(tRNA修飾GTPアーゼ)とdr_0651(アルギナーゼ)がdsr11の直接標的であるらしいことを見出した。更なるマイクロスケール熱泳動結果はdsr11がtrmEとdr_0651のmRNAに直接結合できることを示した。結果はdsr11がtrmEとdr_0651 mRNAへの結合によりD.radioduransの熱ストレスに対する耐性を増強することを示した。全体として,これらの結果はncRNA調節の理解を拡張し,D.radioduransにおける熱ストレス応答への新しい洞察を提供する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： mRNA ,  tRNA ,  アルギナーゼ ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  生存率 ,  *Deinococcus ,  *暑熱ストレス ,  酸化ストレス ,  ノーザンブロット法 ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： *Deinococcus radiodurans ,  ストレス応答 ,  環境ストレス ,  RNA-seq , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Deinococcus radiodurans ,  非コードRNA ,  dsr11 ,  熱ストレス ,  trmE ,  dr0651

分類 (1件)： 植物生理学一般  (EH02010Y)

引用文献 (45件)：

• Daly, M.J. A new perspective on radiation resistance based on Deinococcus radiodurans. Nat. Rev. Microbiol. 2009, 7, 237.
• Omelchenko, M.V.; Wolf, Y.I.; Gaidamakova, E.K.; Matrosova, V.Y.; Vasilenko, A.; Zhai, M.; Daly, M.J.; Koonin, E.V.; Makarova, K.S. Comparative genomics of Thermus thermophilus and Deinococcus radiodurans: Divergent routes of adaptation to thermophily and radiation resistance. BMC Evol. Biol. 2005, 5, 57.
• Hua, X.; Hua, Y. Improved complete genome sequence of the extremely radioresistant bacterium Deinococcus radiodurans R1 obtained using PacBio singlemolecule sequencing. Genome Announc. 2016, 4, e00886-16.
• Meyer, L.; Coste, G.; Sommer, S.; Oberto, J.; Confalonieri, F.; Servant, P.; Pasternak, C. DdrI, a cAMP receptor protein family member, acts as a major regulator for adaptation of Deinococcus radiodurans to various stresses. J. Bacteriol. 2018, 200, e00129-18.
• Slade, D.; Radman, M. Oxidative stress resistance in Deinococcus radiodurans. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2011, 75, 133-191.

タイトルに関連する用語 (3件)： Deinococcus ,  ストレス耐性 ,  非コードRNA