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J-GLOBAL ID：202102254334530337   整理番号：21A0828350

アクアポリン5発現マウス肺上皮細胞の統合単一細胞RNA配列解析は新規検証I型細胞表面マーカーとしてGPRC5Aを同定する【JST・京大機械翻訳】

Integrated Single-Cell RNA-Sequencing Analysis of Aquaporin 5-Expressing Mouse Lung Epithelial Cells Identifies GPRC5A as a Novel Validated Type I Cell Surface Marker

著者 (25件)： Horie Masafumi (Hastings Center for Pulmonary Research and Division of Pulmonary, Critical Care and Sleep Medicine, Department of Medicine, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA) ,  Castaldi Alessandra (Hastings Center for Pulmonary Research and Division of Pulmonary, Critical Care and Sleep Medicine, Department of Medicine, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA) ,  Sunohara Mitsuhiro (Hastings Center for Pulmonary Research and Division of Pulmonary, Critical Care and Sleep Medicine, Department of Medicine, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA) ,  Sunohara Mitsuhiro (Department of Respiratory Medicine, Graduate School of Medicine, The University of Tokyo, 7-3-1 Hongo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-0033, Japan) ,  Sunohara Mitsuhiro (Division for Health Service Promotion, The University of Tokyo, 7-3-1 Hongo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-0033, Japan) ,  Wang Hongjun (Hastings Center for Pulmonary Research and Division of Pulmonary, Critical Care and Sleep Medicine, Department of Medicine, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA) ,  Ji Yanbin (Hastings Center for Pulmonary Research and Division of Pulmonary, Critical Care and Sleep Medicine, Department of Medicine, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA) ,  Liu Yixin (Hastings Center for Pulmonary Research and Division of Pulmonary, Critical Care and Sleep Medicine, Department of Medicine, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA) ,  Li Fan (Single-Cell, Sequencing, and CyTOF Core (SC2), Children’s Hospital Los Angeles, Los Angeles, CA 90027, USA) ,  Wilkinson Thomas A. (Single-Cell, Sequencing, and CyTOF Core (SC2), Children’s Hospital Los Angeles, Los Angeles, CA 90027, USA) ,  Hung Long (Single-Cell, Sequencing, and CyTOF Core (SC2), Children’s Hospital Los Angeles, Los Angeles, CA 90027, USA) ,  Shen Hua (Hastings Center for Pulmonary Research and Division of Pulmonary, Critical Care and Sleep Medicine, Department of Medicine, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA) ,  Kage Hidenori (Department of Respiratory Medicine, Graduate School of Medicine, The University of Tokyo, 7-3-1 Hongo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-0033, Japan) ,  Offringa Ite A. (Department of Surgery, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA) ,  Offringa Ite A. (USC Norris Comprehensive Cancer Center, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA) ,  Offringa Ite A. (Department of Biochemistry and Molecular Medicine, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA) ,  Marconett Crystal N. (Department of Surgery, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA) ,  Marconett Crystal N. (USC Norris Comprehensive Cancer Center, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA) ,  Marconett Crystal N. (Department of Biochemistry and Molecular Medicine, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA) ,  Flodby Per (Hastings Center for Pulmonary Research and Division of Pulmonary, Critical Care and Sleep Medicine, Department of Medicine, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA) ,  Zhou Beiyun (Hastings Center for Pulmonary Research and Division of Pulmonary, Critical Care and Sleep Medicine, Department of Medicine, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA) ,  Zhou Beiyun (USC Norris Comprehensive Cancer Center, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA) ,  Borok Zea (Hastings Center for Pulmonary Research and Division of Pulmonary, Critical Care and Sleep Medicine, Department of Medicine, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA) ,  Borok Zea (USC Norris Comprehensive Cancer Center, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA) ,  Borok Zea (Department of Biochemistry and Molecular Medicine, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA)
資料名： Cells (Web)  (Cells (Web))
巻： 9  号： 11  ページ： 2460  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7155A  ISSN： 2073-4409  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 肺胞上皮I型(AT1)細胞の分子および機能的特性化は,十分な数の生細胞を単離する困難さのため,困難である。ここでは,AT1細胞特異的Aqp5-Cre-IRES-DsRed(ACID)の肺からtdTomato+細胞の単一細胞RNA配列決定(scRNA-seq)を行った。R26tdTomatomaレポーターマウス。酵素的消化後,CD31-CD45-E-カドヘリン+tdToma+細胞を蛍光活性化細胞選別(FACS)し,次いでscRNA-seqにかけた。細胞同一性は,細胞型特異的抗体を用いた免疫蛍光により確認した。品質管理後,92細胞を分析した。大部分の細胞は,この集団内で不均一な発現で,従来のAT1細胞マーカー(Aqp5,Pdpn,Hopx,Ager)を発現した。残りの細胞はAT2,クラブ,基底または繊毛細胞マーカーを発現した。公開データセットとの統合は,3つのロバストなAT1細胞及び肺富化遺伝子,Ager,Rtkn2及びGprc5aを同定し,これらは種を通して保存された。GPRC5AはHOPXと共局在し,マウス,ラットおよびヒト肺でAT2または気道細胞で発現しなかった。GPRC5AはAQP5と共局在するが,マウス肺上皮細胞サイトスピンではpro-SPCまたはCC10と共局在しなかった。マウスAT1細胞を濃縮し,scRNA-seqを用いて分子表現型タイピングを行った。推定AT1細胞富化遺伝子のさらなる特性化は,AT1細胞分離に有用な保存されたAT1細胞表面マーカーとしてGPRC5Aを明らかにした。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 蛍光 ,  品質管理 ,  酵素 ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  抗体 ,  消化 ,  ヒト ,  表現型 ,  ラット ,  ロバスト性 ,  CD45抗原
準シソーラス用語： 細胞分離 ,  生細胞 ,  *単一細胞 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： アクアポリン5(AQP5) ,  肺胞上皮1型細胞 ,  scRNA-seq ,  GPRC5A ,  AT1細胞マーカー

分類 (5件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  核酸一般  (EB04010U) ,  肺  (EJ05020K) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  細胞構成体の機能  (EF03060C)

引用文献 (48件)：

• Adamson, I.Y.; Bowden, D.H. The type 2 cell as progenitor of alveolar epithelial regeneration. A cytodynamic study in mice after exposure to oxygen. Lab. Investig. 1974, 30, 35-42.
• Evans, M.J.; Cabral, L.J.; Stephens, R.J.; Freeman, G. Transformation of alveolar type 2 cells to type 1 cells following exposure to NO2. Exp. Mol. Pathol. 1975, 22, 142-150.
• Desai, T.J.; Brownfield, D.G.; Krasnow, M.A. Alveolar progenitor and stem cells in lung development, renewal and cancer. Nature 2014, 507, 190-194.
• Barkauskas, C.E.; Cronce, M.J.; Rackley, C.R.; Bowie, E.J.; Keene, D.R.; Stripp, B.R.; Randell, S.H.; Noble, P.W.; Hogan, B.L. Type 2 alveolar cells are stem cells in adult lung. J. Clin. Investig. 2013, 123, 3025-3036.
• Borok, Z.; Liebler, J.M.; Lubman, R.L.; Foster, M.J.; Zhou, B.; Li, X.; Zabski, S.M.; Kim, K.J.; Crandall, E.D. Na transport proteins are expressed by rat alveolar epithelial type I cells. Am. J. Physiol. Lung Cell Mol. Physiol. 2002, 282, L599-L608.

タイトルに関連する用語 (10件)： アクアポリン5 ,  発現 ,  マウス ,  肺上皮細胞 ,  統合 ,  単一細胞 ,  RNA配列解析 ,  検証 ,  細胞表面マーカー ,  同定