文献

J-GLOBAL ID：202102254770219653   整理番号：21A1151010

プロテオミクスおよびトランスクリプトーム解析はPOU1F1およびNR5A1細胞系統に由来する下垂体腫瘍における分子機械の重要な成分としてスプライセオソームを同定する【JST・京大機械翻訳】

Proteomic and Transcriptomic Analysis Identify Spliceosome as a Significant Component of the Molecular Machinery in the Pituitary Tumors Derived from POU1F1- and NR5A1-Cell Lineages

著者 (23件)： Taniguchi-Ponciano Keiko (Unidad de Investigacion Medica en Enfermedades Endocrinas, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Av. Cuauhtemoc 330, Col. Doctores, Mexico D.F. 06720, Mexico) ,  Pena-Martinez Eduardo (Unidad de Investigacion Medica en Enfermedades Endocrinas, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Av. Cuauhtemoc 330, Col. Doctores, Mexico D.F. 06720, Mexico) ,  Silva-Roman Gloria (Unidad de Investigacion Medica en Enfermedades Endocrinas, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Av. Cuauhtemoc 330, Col. Doctores, Mexico D.F. 06720, Mexico) ,  Vela-Patino Sandra (Unidad de Investigacion Medica en Enfermedades Endocrinas, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Av. Cuauhtemoc 330, Col. Doctores, Mexico D.F. 06720, Mexico) ,  Guzman-Ortiz Ana Laura (Laboratorio de Investigacion en Inmunologia y Proteomica, Hospital Infantil de Mexico “Federico Gomez”, Mexico City 06720, Mexico) ,  Quezada Hector (Laboratorio de Investigacion en Inmunologia y Proteomica, Hospital Infantil de Mexico “Federico Gomez”, Mexico City 06720, Mexico) ,  Gomez-Apo Erick (Area de Neuropatologia, Servicio de Anatomia Patologica, Hospital General de Mexico “Dr. Eduardo Liceaga”, Ciudad de Mexico 06720, Mexico) ,  Chavez-Macias Laura (Area de Neuropatologia, Servicio de Anatomia Patologica, Hospital General de Mexico “Dr. Eduardo Liceaga”, Ciudad de Mexico 06720, Mexico) ,  Chavez-Macias Laura (Facultad de Medicina, Universidad Nacional Autonoma de Mexico, Mexico City 04510, Mexico) ,  Mercado-Medrez Sophia (Unidad de Investigacion Medica en Enfermedades Endocrinas, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Av. Cuauhtemoc 330, Col. Doctores, Mexico D.F. 06720, Mexico) ,  Vargas-Ortega Guadalupe (Servicio de Endocrinologia, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de Mexico 06720, Mexico) ,  Espinosa-de-los-Monteros Ana Laura (Servicio de Endocrinologia, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de Mexico 06720, Mexico) ,  Gonzales-Virla Baldomero (Servicio de Endocrinologia, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de Mexico 06720, Mexico) ,  Ferreira-Hermosillo Aldo (Unidad de Investigacion Medica en Enfermedades Endocrinas, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Av. Cuauhtemoc 330, Col. Doctores, Mexico D.F. 06720, Mexico) ,  Ferreira-Hermosillo Aldo (Servicio de Endocrinologia, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de Mexico 06720, Mexico) ,  Espinosa-Cardenas Etual (Servicio de Endocrinologia, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de Mexico 06720, Mexico) ,  Ramirez-Renteria Claudia (Unidad de Investigacion Medica en Enfermedades Endocrinas, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Av. Cuauhtemoc 330, Col. Doctores, Mexico D.F. 06720, Mexico) ,  Ramirez-Renteria Claudia (Servicio de Endocrinologia, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de Mexico 06720, Mexico) ,  Sosa Ernesto (Servicio de Endocrinologia, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de Mexico 06720, Mexico) ,  Lopez-Felix Blas (Servicio de Neurocirugia, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de Mexico 06720, Mexico) ,  Guinto Gerardo (Servicio de Neurocirugia, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de Mexico 06720, Mexico) ,  Marrero-Rodriguez Daniel (Catedra CONACyT-Laboratorio de Endocrinologia Experimental, Unidad de Investigacion Medica en Enfermedades Endocrinas, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Av. Cuauhtemoc 330, Col. Doctores, Mexico D.F. 06720, Mexico) ,  Mercado Moises (Unidad de Investigacion Medica en Enfermedades Endocrinas, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Av. Cuauhtemoc 330, Col. Doctores, Mexico D.F. 06720, Mexico)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 11  号： 12  ページ： 1422  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:下垂体腺腫(PA)は中枢神経系における第2の最も一般的な腫瘍であり,変異遺伝子の低い数を有する。スプライシングはコードRNAの95%で生じる。PAにおけるスプライセオソームとmRNAイソ型に関する情報は少なく,従って,PAにおけるスプライセオソーム成分とmRNAイソ型を同定するために,プロテオミクスとトランスクリプトミクス分析を実施した。【方法】:プロテオミクスプロファイル分析を,四重極飛行時間型質量分析計によるナノHPLCと質量分析によって行った。mRNAアイソフォームとトランスクリプトームプロフィールは,マイクロアレイ技術によって行われた。蛋白質及びmRNA情報を用いて,スプライシング関連事象を同定するために遺伝子オントロジー及びエキソンレベル解析を行った。結果:約2000の蛋白質は下垂体腫瘍で同定された。SRSF1,U2AF1およびRBM42などのスプリセオソーム蛋白質は,PAにおいて見出された。これらの結果をmRNAレベルで検証し,PAにおけるスプライスソーム遺伝子の上方制御を示した。スプリセオソーム関連遺伝子はPA腫瘍サブタイプを分離し,分類する。PAは,腫瘍特異的であるCDK18とTHY1 mRNAイソ型の変化を示した。結論:スプリセオソーム成分はPA分子機械の重要な構成要素であり,分子マーカーおよび治療標的として使用できる。スプライシング関連遺伝子とmRNAイソ型プロファイルは腫瘍サブタイプを特徴付ける。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 質量分析 ,  RNA【核酸】 ,  mRNA ,  遺伝子 ,  *腫瘍 ,  タンパク質 ,  中枢神経系 ,  アップレギュレーション ,  *スプライセオソーム ,  *プロテオミクス ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： *トランスクリプトーム解析 ,  治療標的 ,  遺伝子オントロジー ,  マイクロアレイ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 下垂体腺腫 ,  選択的スプライシング ,  分子マーカー ,  mRNAイソ型

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

引用文献 (27件)：

• Piekiełko-Witkowska, A.; Kedzierska, H.; Poplawski, P.; Wójcicka, A.; Rybicka, B.; Maksymowicz, M.; Grajkowska, W.A.; Matyja, E.; Mandat, T.; Bonicki, W.; et al. Alternative splicing of iodothyronine deiodinases in pituitary adenomas. Regulation by oncoprotein SF2/ASF. Biochim. Biophys. Acta 2013, 1832, 763-772.
• Nishioka, H.; Inoshita, N. New WHO classification of pituitary adenomas (4th edition): Assessment of pituitary transcription factors and the prognostic histological factors. Brain Tumor Pathol. 2018, 35, 57-61.
• Newey, P.J.; Nesbit, M.A.; Rimmer, A.J.; Head, R.A.; Gorvin, C.M.; Attar, M.; Gregory, L.; Wass, J.A.H.; Buck, D.; Karavitaki, N.; et al. Whole-Exome Sequencing Studies of Nonfunctioning Pituitary Adenomas. J. Clin. Endocrinol. Metab. 2013, 98, E796-E800.
• Dvinge, H.; Kim, E.; Abdel-Wahab, O.; Bradley, H.D.R.K. RNA splicing factors as oncoproteins and tumour suppressors. Nat. Rev. Cancer 2016, 16, 413-430.
• Baralle, F.E.; Giudice, J. Alternative splicing as a regulator of development and tissue identity. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2017, 18, 437-451.

タイトルに関連する用語 (7件)： プロテオミクス ,  トランスクリプトーム解析 ,  細胞系統 ,  下垂体腫瘍 ,  分子機械 ,  スプライセオソーム ,  同定