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J-GLOBAL ID：202102254971502886   整理番号：21A2364336

メインランドAster spathulifoliusと他のAster種の完全な葉緑体ゲノムの比較分析【JST・京大機械翻訳】

Comparative Analysis of the Complete Chloroplast Genome of Mainland Aster spathulifolius and Other Aster Species

著者 (4件)： Tyagi Swati (Genomics Division, National Institute of Agricultural Sciences, Rural Development Administration, Jeonju 54874, Korea) ,  Jung Jae-A (Floriculture Research Division, National Institute of Horticultural and Herbal Science, Rural Development Administration, Wanju 55365, Korea) ,  Kim Jung Sun (Genomics Division, National Institute of Agricultural Sciences, Rural Development Administration, Jeonju 54874, Korea) ,  Won So Youn (Genomics Division, National Institute of Agricultural Sciences, Rural Development Administration, Jeonju 54874, Korea)
資料名： Plants (Web)  (Plants (Web))
巻： 9  号： 5  ページ： 568  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7261A  ISSN： 2223-7747  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 一般的な観賞植物と薬用植物であるAster spathulfoliusは韓国と日本に広く分布しており,本土と島タイプに遺伝的に分類されている。ここでは,本土A.spathulfoliusの全葉緑体ゲノムを配列決定し,島型および他のAster種のそれらと比較した。A.spathulfoliusの葉緑体ゲノムは,152,732bpであり,保存された四分体構造を持ち,37.28%のグアニン-シトシン(GC)含有量を持ち,114の非冗長遺伝子を含む。2つのA.spathulfolius系統と他のAster種の間の葉緑体ゲノムの比較は,それらの配列,GC含有量,遺伝子含有量および順序,およびエキソン-イントロン構造がよく保存されていることを明らかにした。しかし,それらの長さ,反復配列,および逆反復の収縮と拡大において差異が観察された。変動は主に単一コピー領域と非コード領域にあり,検出された単純配列反復と共に,これらの植物を区別するための分子マーカーの開発に使用できる。すべてのAster種は単系統群に分類されたが,本土A.spathulfoliusの葉緑体ゲノムは島A.spathulfoliusよりも他のAster種と類似していた。accDとndhF遺伝子は,他の関連分類群と比較して,Aster系統内で陽性選択下で検出された。本研究で示した本土A.spathulfoliusの完全な葉緑体ゲノムは,Aster属およびキク科における遺伝的多様性,進化および系統発生関係の種同定および解析に役立つであろう。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 冗長性 ,  *遺伝 ,  遺伝子 ,  薬用植物 ,  系統発生 ,  キク科 ,  観賞植物 ,  反復配列 ,  イントロン
準シソーラス用語： 非翻訳領域 ,  種判別 ,  分子マーカー ,  *葉緑体ゲノム ,  分類群 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： アスター ,  キク科 ,  葉緑体ゲノム ,  系統発生解析 ,  コドン使用 ,  イントロン損失

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (66件)：

• Cho, I.J.; Choung, S.Y.; Hwang, Y.C.; Ahn, K.J.; Chung, H.Y.; Jeong, I.K. Aster spathulifolius Maxim extract reduces body weight and fat mass in obese humans. Nutr. Res. 2016, 36, 671-678.
• Kim, S.J.; Choung, S.Y. Inhibitory effects of Aster spathulifolius extract on adipogenesis and lipid accumulation in 3T3-L1 preadipocytes. J. Pharm. Pharmacol. 2016, 68, 107-118.
• Choi, K.S.; Park, S. The complete chloroplast genome sequence of Aster spathulifolius (Asteraceae); genomic features and relationship with Asteraceae. Gene 2015, 572, 214-221.
• Maki, M.; Morita, H. Genetic diversity in island and mainland populations of Aster spathulifolius (Asteraceae). Int. J. Plant Sci. 1998, 159, 148-152.
• Nguyen, H.T.T.; Choi, K.S.; Park, S. Genetic diversity and differentiation of a narrowly distributed and endemic species, Aster spathulifolius maxim (Asteraceae), revealed with inter simple sequence repeat markers. J. Korean Soc. Appl. Biol. Chem. 2013, 56, 255-262.

タイトルに関連する用語 (5件)： メイン ,  ランド ,  ASTER ,  葉緑体ゲノム ,  比較分析