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J-GLOBAL ID：202102254972769123   整理番号：21A2364818

果樹作物の干ばつおよび塩分応答に関連した排他的および共通のトランスクリプトーム特徴への洞察の獲得【JST・京大機械翻訳】

Gaining Insight into Exclusive and Common Transcriptomic Features Linked to Drought and Salinity Responses across Fruit Tree Crops

著者 (7件)： Benny Jubina (Department of Agricultural, Food and Forest Sciences, University of Palermo, Viale delle Scienze-Ed. 4, 90128 Palermo, Italy) ,  Marchese Annalisa (Department of Agricultural, Food and Forest Sciences, University of Palermo, Viale delle Scienze-Ed. 4, 90128 Palermo, Italy) ,  Giovino Antonio (Council for Agricultural Research and Economics (CREA), Research Centre for Plant Protection and Certification (CREA-DC), 90011 Bagheria, Italy) ,  Marra Francesco Paolo (Department of Architecture (DARCH), University of Palermo, Viale delle Scienze-Ed. 8, 90128 Palermo, Italy) ,  Perrone Anna (Department of Biological, Chemical and Pharmaceutical Sciences and Technologies (STEBICEF), University of Palermo, Viale delle Scienze, 90128 Palermo, Italy) ,  Caruso Tiziano (Department of Agricultural, Food and Forest Sciences, University of Palermo, Viale delle Scienze-Ed. 4, 90128 Palermo, Italy) ,  Martinelli Federico (Department of Biology, University of Florence, Sesto Fiorentino, 50019 Florence, Italy)
資料名： Plants (Web)  (Plants (Web))
巻： 9  号： 9  ページ： 1059  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7261A  ISSN： 2223-7747  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究は,異なる果実樹木種間で保存される乾燥と塩分耐性/耐性に関与する根組織で発現する主要遺伝子を同定,マッピングすることを目的とした。26のRNA-Seqサンプルを,5つの植物種(Olea europaea,Vitis riparia Michx,Prunus mahaleb,Prunus persica,Phoenix dactylifera)の6つの発表された研究で分析した。このメタ分析は,3つの塩分研究で一般的に調節される750の遺伝子を同定した生物情報学パイプラインと,3つの干ばつ研究の間で通常調節される683の遺伝子を使用して,これらの環境ストレスに対する耐性/応答におけるそれらの保存された役割を暗示した。塩分と干ばつの両者で共通した遺伝子について比較を行い,そのうち39は発現(23はアップレギュレートされ,16はダウンレギュレートされた)の同じ傾向で一般に調節される82の遺伝子をもたらした。遺伝子セット濃縮および経路分析は,防御応答の調節,薬物膜貫通輸送および金属イオン結合をコードする経路が,これら2つの非生物的ストレス応答に対する一般的な重要な分子応答であることを示した。さらに,ホルモン分子クロストークは,干ばつおよび塩分に対する植物応答の微調整において必須の役割を果たす。干ばつと塩分は,異なる分子ホルモンフィンガープリントを誘導した。脱水ストレスは,アブシジン酸,ジベレリン,ブラシノステロイドおよびエチレン活性化シグナリング経路に応答する複数の遺伝子を特異的に増強した。塩ストレスは,オーキシン-,ジベレリン-(ジベレリン2オキシダーゼ8)およびアブシジン酸関連経路(アルデヒドオキシダーゼ4,アブシジン酸応答性要素結合蛋白質3)におけるシグナル伝達蛋白質における主要酵素をコードする遺伝子をほとんど抑制した。非生物的ストレス関連遺伝子を染色体にマッピングし,これらの複雑な量的形質の改善に利用できる分子マーカーを同定した。このメタ分析は,生物工学的に持続可能な方法で,異なる果実樹木作物にわたって,乾燥と塩分耐性および/または耐性が強化された品種を開発するための潜在的標的として役立つ遺伝子を同定した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *農作物 ,  RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  オーキシン ,  ジベレリン ,  タンパク質 ,  ホルモン ,  *干ばつ ,  *塩分 ,  品種 ,  細胞情報伝達 ,  *トランスクリプトーム ,  アルケン
準シソーラス用語： 塩分ストレス ,  非生物的ストレス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 非生物的ストレス ,  トランスクリプトミクス ,  果実作物 ,  メタ分析 ,  RNA-seq ,  根 ,  差次的発現遺伝子

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物生理学一般  (EH02010Y)

物質索引 (1件)： エチレン

引用文献 (63件)：

• Lynch, J.P. Rightsizing root phenotypes for drought resistance. J. Exp. Bot. 2018, 69, 3279-3292.
• Cuellar-Ortiz, S.M.; Arrieta-Montiel, M.D.L.P.; Acosta-Gallegos, J.; Covarrubias, A.A. Relationship between carbohydrate partitioning and drought resistance in common bean. Plant Cell Environ. 2008, 31, 1399-1409.
• Benny, J.; Pisciotta, A.; Caruso, T.; Martinelli, F. Identification of key genes and its chromosome regions linked to drought responses in leaves across different crops through meta-analysis of RNA-Seq data. BMC Plant Biol. 2019, 19, 194.
• Zhu, J.K. Plant salt tolerance. Trends Plant Sci. 2001, 6, 66-71.
• Flowers, T.J.; Colmer, T.D. Plant salt tolerance: Adaptations in halophytes. Ann. Bot. 2015, 115, 327-331.

タイトルに関連する用語 (8件)： 果樹 ,  作物 ,  干ばつ ,  塩分 ,  応答 ,  トランスクリプトーム ,  洞察 ,  獲得