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J-GLOBAL ID：202102255744943712   整理番号：21A0092130

Mycobacterium bovis BCG-1(ロシア)ワクチン種子ロットにおける全ゲノム配列変異への最初の洞察とBCG誘発有害事象の子供からのそれらの子孫臨床分離株【JST・京大機械翻訳】

First insight into the whole-genome sequence variations in Mycobacterium bovis BCG-1 (Russia) vaccine seed lots and their progeny clinical isolates from children with BCG-induced adverse events

著者 (14件)： Narvskaya Olga (Laboratory of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics, St. Petersburg Pasteur Institute, St. Petersburg, Russia) ,  Narvskaya Olga (St. Petersburg Research Institute of Phthisiopulmonology, St. Petersburg, Russia) ,  Starkova Daria (Laboratory of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics, St. Petersburg Pasteur Institute, St. Petersburg, Russia) ,  Levi Diana (Scientific Center for Expert Evaluation of Medical Products, Moscow, Russia) ,  Alexandrova Natalia (Scientific Center for Expert Evaluation of Medical Products, Moscow, Russia) ,  Molchanov Vladimir (Laboratory of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics, St. Petersburg Pasteur Institute, St. Petersburg, Russia) ,  Molchanov Vladimir (Present address: Van Andel Institute, Grand Rapids, USA) ,  Chernyaeva Ekaterina (Saint Petersburg State University, St. Petersburg, Russia) ,  Vyazovaya Anna (Laboratory of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics, St. Petersburg Pasteur Institute, St. Petersburg, Russia) ,  Mushkin Alexander (St. Petersburg Research Institute of Phthisiopulmonology, St. Petersburg, Russia) ,  Zhuravlev Viacheslav (St. Petersburg Research Institute of Phthisiopulmonology, St. Petersburg, Russia) ,  Solovieva Natalia (St. Petersburg Research Institute of Phthisiopulmonology, St. Petersburg, Russia) ,  Vishnevskiy Boris (St. Petersburg Research Institute of Phthisiopulmonology, St. Petersburg, Russia) ,  Mokrousov Igor (Laboratory of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics, St. Petersburg Pasteur Institute, St. Petersburg, Russia)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 21  号： 1  ページ： 1-12  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 重症小児結核を予防するために使用された唯一の認可された生きたBacille Calmette-Guerin(BCG)ワクチンは,BCG誘発有害事象の可変的防御有効性と率を有する遺伝的に多様な菌株から成る。全ゲノム配列決定(WGS)は,BCG株のゲノム安定性および異なる国のBCGワクチンの有効性に対する種子および市販ロットにおける自然不均一性の影響の評価を可能にした。この研究は,BCG誘導疾患(主に骨膜炎)を有する免疫能のある子供から利用可能な子孫分離株と比較し,BCG-1(Russia)種子ロットにおける遺伝子および蛋白質機能に対する配列変異およびそれらの推定効果を評価することを目的とした。WGSデータに基づいて,異なる期間におけるロシアにおけるワクチン製造に使用される種子ロット361,367,および368の間のリンクを分析し,それらの9つの子孫分離株をBCG誘発疾患を有する免疫適格小児から回収した。参照ゲノム(GenBank:CP013741)に関連する遺伝子の変異体の完全なカタログは,4つの同義と8つの非同義単一ヌクレオチド多型と3つのフレームシフト欠失を含んだ。種子ロット361は,代謝および細胞壁過程に関与するppsC,eccD5,およびeccA5を含むいくつかの遺伝子において,そのような多型のより高い割合を有する6つの子孫分離株のうちの2つを有する変異体を共有し,マイコバクテリアにおける病原性と報告された。1つの分離株は,その親種子ロット361の変異体を14年以内に配列プロファイルのさらなる変化の獲得なしに保存した。バックグラウンドゲノム情報は,凍結乾燥種子ロットから子孫臨床分離株まで開始するBCG多様性を追跡する初めてを可能にした。種子ロット361のいくつかの遺伝子の配列変異は,ワクチンのゲノム安定性と生存率を変化させず,ヒト生物における生存の間,分離株に蓄積した。BCG誘導疾患の発症との関連における観察された変化の影響は,免疫状態および宿主遺伝学と平行して評価されるべきである。BCG種子ロットおよびそれらの子孫臨床分離株の比較ゲノム研究は,宿主生物におけるBCGの長期生存中の有効性および有害事象の分子基盤をより良く理解するための有益なアプローチである。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝 ,  遺伝子 ,  細胞壁 ,  ヒト ,  *ワクチン ,  *ゲノム ,  病原性 ,  子供 ,  生存率 ,  *ウシ型結核菌 ,  一塩基多型
準シソーラス用語： *ゲノム配列 ,  *分離株 ,  *有害事象 ,  *臨床分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： BCG ,  M.bovis BCG-1(ロシア) ,  種子ロット ,  臨床分離菌 ,  骨炎 ,  全ゲノム配列決定

分類 (3件)： 免疫療法薬・血液製剤の基礎研究  (GW22010D) ,  微生物の生化学  (EG03020N) ,  免疫療法薬・血液製剤の臨床への応用  (GW22020O)

引用文献 (51件)：

• World Health Organization. Weekly Epidemiological Record. 2018;93(08):73-96. https://www.who.int/wer/2018/wer9308/en/. Accessed 13 Aug 2020.
• Lancet.; Effect of BCG vaccination on childhood tuberculous meningitis and miliary tuberculosis worldwide: a meta-analysis and assessment of cost-effectiveness; BB Trunz, P Fine, C Dye; 367; 2006; 1173-1180; 10.1016/S0140-6736(06)68507-3; citation_id=CR2
• Lancet Infect Dis; BCG - Different strains, different vaccines?; MA Behr; 2; 2002; 86-92; 10.1016/S1473-3099(02)00182-2; citation_id=CR3
• BMC Genomics; Novel genome polymorphisms in BCG vaccine strains and impact on efficacy; AS Leung, V Tran, Z Wu, X Yu, DC Alexander, GF Gao; 9; 2008; 413; 10.1186/1471-2164-9-413; citation_id=CR4
• Vaccine.; The in vitro evolution of BCG vaccines; S Mostowy, AG Tsolaki, PM Small, MA Behr; 21; 2003; 4270-4274; 10.1016/S0264-410X(03)00484-5; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (13件)： Mycobacterium ,  ロシア ,  ワクチン ,  種子 ,  ロット ,  ゲノム ,  配列変異 ,  洞察 ,  BCG ,  誘発 ,  有害事象 ,  子供 ,  臨床分離株