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J-GLOBAL ID：202102256135636929   整理番号：21A2364249

2つの重要な一年生クローバ種,Trifolium alexandrinumおよびT.resupinatumの完全な葉緑体ゲノム:ゲノム構造,比較解析およびマメ科植物における近縁種との系統発生関係【JST・京大機械翻訳】

The Complete Chloroplast Genome of Two Important Annual Clover Species, Trifolium alexandrinum and T. resupinatum: Genome Structure, Comparative Analyses and Phylogenetic Relationships with Relatives in Leguminosae

著者 (11件)： Xiong Yanli (College of Animal science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China) ,  Xiong Yi (College of Animal science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China) ,  He Jun (State Key Laboratory of Exploration and Utilization of Crop Gene Resources in 10 Southwest China, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Maize in 11 Southwest Region, Ministry of Agriculture, Maize Research Institute of Sichuan 12 Agricultural University, Chengdu 600031, Chi...) ,  Yu Qingqing (College of Animal science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China) ,  Zhao Junming (College of Animal science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China) ,  Lei Xiong (College of Animal science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China) ,  Dong Zhixiao (College of Animal science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China) ,  Yang Jian (College of Animal science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China) ,  Peng Yan (College of Animal science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China) ,  Zhang Xinquan (College of Animal science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China) ,  Ma Xiao (College of Animal science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China)
資料名： Plants (Web)  (Plants (Web))
巻： 9  号： 4  ページ： 478  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7261A  ISSN： 2223-7747  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： IR欠損クレード(IRLC)に属するTrifolium L.はLeguminosaeにおける最大属の1つであり,いくつかの経済的に重要な飼料種を含む。ここでは,2つの重要な年草,Trifolium alexandrinum(Egypian clomer)とT.resupinatum(Persian clomer)の葉緑体(cp)ゲノム配列決定と注釈を示した。大量の一塩基多型(SNP)と挿入/欠失(In/Dels)が,それらの2つの種の間で発見された。更なる13のTrifolium種へのT.alexandrinumとT.resupinatumの全体的なアラインメントは,これらの15種において大量の再配列と反復事象を明らかにした。仮想cpオープンリーディングフレーム(ORF)とRNAポリメラーゼサブユニットとして,cpゲノムにおけるycf1とrpoC2は,広大な反復配列を含み,T.alexandrinumとT.resupinatumの間で高いPi値(0.7008,0.3982)を観察した。したがって,それらはTrifolium種の系統発生分析のための候補遺伝子として考えられた。さらに,Trifolium種を欠くIRの発散時間は84.8505Myaから4.7720Myaの範囲であった。本研究はTrifolium種の進化に関する洞察を提供するであろう。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アラインメント ,  RNAポリメラーゼ ,  *クローバ ,  *葉緑体 ,  *系統発生 ,  *ゲノム ,  サブユニット ,  *シャジクソウ属 ,  反復配列 ,  一塩基多型
準シソーラス用語： オープンリーディングフレーム ,  ゲノム配列 ,  候補遺伝子 ,  クレード ,  *近縁種 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 葉緑体ゲノム ,  Trifolium ,  分岐時間 ,  IR不足 ,  転位 ,  反復イベント

分類 (1件)： 飼料作物,草地  (FC03050J)

引用文献 (65件)：

• Sabudak, T.; Guler, N. Trifolium L.-A review on its phytochemical and pharmacological profile. Phytother. Res. 2009, 23, 439-446.
• Ellison, N.W.; Liston, A.; Steiner, J.J.; Williams, W.M.; Taylor, N.L. Molecular phylogenetics of the clover genus (Trifolium--Leguminosae). Mol. Phylogenet. Evol. 2006, 39, 688-705.
• Badr, A.; El-Shazly, H.H.; Watson, L.E. Origin and ancestry of egyptian clover (Trifolium alexandrinum L.) as revealed by AFLP markers. Genet. Resour. Crop Evol. 2008, 55, 21-31.
• Nazir, M.; Shah, F.H. Studies on persian clover (Trifolium resupinatum). Plant Food Hum. Nutr. 1985, 35, 57-62.
• Douglas, S.E. Chloroplast origins and evolution. In The Molecular Biology of Cyanobacteria; Springer: Dordrecht, the Netherlands, 1994; pp. 91-118.

タイトルに関連する用語 (8件)： クローバ ,  Trifolium ,  葉緑体ゲノム ,  ゲノム構造 ,  解析 ,  マメ科植物 ,  近縁種 ,  系統発生