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J-GLOBAL ID：202102256944659356   整理番号：21A1095027

環状RNAhsa_circ_0003568は,miR-140-3pおよびmiR-502-5pによって,骨肉腫におけるCDK6およびNFYAの調節を媒介する。【JST・京大機械翻訳】

The effect of circRNA hsa_circ_0003568 regulating target genes CDK6 and NFYA in osteosarcoma through miR-140-3p and miR-502-5p

著者 (6件)： Li Kanglu (广西医科大学,广西 南寧 530021) ,  Huang Hanji (广西医科大学,广西 南寧 530021) ,  Yan Guohua (广西医科大学,广西 南寧 530021) ,  Tan Manli (广西医科大学,广西 南寧 530021) ,  Huang Daji (广西百色市人民医院,右江民族医学院附属西南医院,广西 百色 533000) ,  Zhu Bo (广西医科大学,广西 南寧 530021)
資料名： You Jiang Minzu Yixue Yuan Xuebao  (You Jiang Minzu Yixue Yuan Xuebao)
巻： 42  号： 6  ページ： 710-715  発行年： 2020年 
JST資料番号： C3576A  ISSN： 1001-5817  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】骨肉腫(OS)における環状RNAhsa_circ_0003568の発現を調査し,バイオインフォマティクス法を用いてcircRNA-miRNA-mRNAのネットワーク構築を行い,その可能な機構と臨床的重要性を分析する。【方法】リアルタイム蛍光定量的ポリメラーゼ連鎖反応(RT-qPCR)を用いて,OS細胞株および正常骨芽細胞におけるhsa_circ_0003568の発現を検出した。その後,circRNA-miRNAとmiRNA-mRNAに基づいてcircRNA-miR-NA-mRNAネットワークを構築した。複数のcircRNAソフトウェアデータベースを用いてhsa_circ_0003568を標的としたmiRNAを分析し、さらにmiRNAデータソフトによりその標的遺伝子を予測し、少なくとも4個以上のソフトウェアで支持された標的miRNAと標的遺伝子を選択した。GEPIAデータベースソフトウェアにより、標的遺伝子を生存分析し、顕著な予後差異の標的遺伝子をスクリーニングし、hsa_circ_0003568の潜在的な臨床意義を分析した。【結果】RT-qPCRの結果,hsa_circ_0003568は,正常対照群と比較して,OS細胞株で有意に増加した(P<0.05)。配列解析により、hsa_circ_0003568のループ連結点はIST1前駆体RNAの第5と6エクソンに位置することが分かった。バイオインフォマティクス分析の結果は以下のことを示した。hsa_circ_0003568は,2つのmiRNA(miR-140-3pとmiR-502-5p)を同時に標的にし,hsa_circ_0003568,およびhsa_circ_0003568を,それぞれ構築して,2つのmiRNA(miR-140-3p,およびmiR-502-5p)を標的とした。miR-140-3p/miR-502-5pと13の標的遺伝子のcircRNA-miRNA-mRNAネットワークは,また,GEPIAデータベース分析でCDK6とNFYAの2つの標的遺伝子が発見され,OS患者の生存予後と有意に相関していた(P<0。05),NFYAはmiR-140-3pとmiR-502-5pの潜在的な標的遺伝子である。【結語】hsa_circ_0003568の過剰発現は,miR-140-3pおよびmiR-502-5p制御遺伝子CDK6およびNFYAを介して,OSの発生および進行に関与する可能性がある。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 蛍光 ,  データベース ,  ネットワーク ,  mRNA ,  ソフトウェア ,  *骨肉腫 ,  予後 ,  骨芽細胞 ,  定量的PCR法
準シソーラス用語： 細胞株 ,  マイクロRNA ,  バイオインフォマティクス ,  標的遺伝子 ,  過剰発現 ,  *環状RNA , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (4件)： 発癌機序・因子  (GE02020C) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  消化器の腫よう  (GH04000D)

タイトルに関連する用語 (3件)： 骨肉腫 ,  Cdk6 ,  調節