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J-GLOBAL ID：202102257082174493   整理番号：21A1150132

トランスクリプトーム配列決定は,大型イエロークローカー(Larimichthys crocea)における精子形成と精巣発達の形質を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome Sequencing Reveals the Traits of Spermatogenesis and Testicular Development in Large Yellow Croaker (Larimichthys crocea)

著者 (8件)： Luo Shengyu (Key Laboratory of Applied Marine Biotechnology by the Ministry of Education, School of Marine Sciences, Ningbo University, Ningbo 315211, China) ,  Gao Xinming (Key Laboratory of Applied Marine Biotechnology by the Ministry of Education, School of Marine Sciences, Ningbo University, Ningbo 315211, China) ,  Ding Jie (Key Laboratory of Applied Marine Biotechnology by the Ministry of Education, School of Marine Sciences, Ningbo University, Ningbo 315211, China) ,  Liu Cheng (Key Laboratory of Applied Marine Biotechnology by the Ministry of Education, School of Marine Sciences, Ningbo University, Ningbo 315211, China) ,  Du Chen (Key Laboratory of Applied Marine Biotechnology by the Ministry of Education, School of Marine Sciences, Ningbo University, Ningbo 315211, China) ,  Hou Congcong (Key Laboratory of Applied Marine Biotechnology by the Ministry of Education, School of Marine Sciences, Ningbo University, Ningbo 315211, China) ,  Zhu Junquan (Key Laboratory of Applied Marine Biotechnology by the Ministry of Education, School of Marine Sciences, Ningbo University, Ningbo 315211, China) ,  Lou Bao (Zhejiang Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou 310021, China)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 10  号： 12  ページ： 958  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Larimichthys croceaは中国の経済的に重要な海洋魚である。今日まで,L.croceaにおける精巣発達と精子形成の根底にある分子機構は完全には解明されていない。本研究では,6人の男性個体から精巣(TES)とプールした多発性組織(PMT)(肝臓,脾臓,心臓,腎臓)間の比較トランスクリプトーム解析を行った。TESとPMTライブラリーから5400万以上のクリーンリードが得られた。L.croceaのドラフトゲノムにマッピング後,トランスクリプトームデータセットから27877の遺伝子を得た。発現分析は,全部で3853の差次的発現遺伝子(DEG)を同定し,これは2194の精巣バイアス遺伝子(TESで高発現)と1659の体細胞バイアス遺伝子(PMTで高発現)を含んだ。さらに,データセットをマルチデータベースによる発破によって注釈付けした。神経活性リガンド受容体相互作用経路,ゴナドトロピン放出ホルモン(GnRH)およびマイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPK)シグナル伝達経路,細胞周期経路およびダイニン,キネシン,ミオシン,アクチン,熱ショック蛋白質(hsp),シナプトネマ複合体蛋白質2(sycp2),二重性-およびmab-3関連転写因子1(dmrt1),精子形成関連遺伝子(spata),DEAD-Box Helicase(ddx),tudorドメイン含有蛋白質(ddd),およびpiwi遺伝子などの機能遺伝子および濃縮経路を分析した。本研究によって同定された候補遺伝子は,L.croceaにおける精巣発達および精子形成の根底にある分子機構へのさらなる研究の基礎を築く。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  心臓 ,  アクチン ,  遺伝子 ,  *精巣 ,  脾臓 ,  ミオシン ,  細胞周期 ,  *精子形成 ,  ダイニン ,  転写因子 ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： キネシン ,  分子機構 ,  候補遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Larimichthys crocea ,  RNA-Seq ,  精巣の発達 ,  精子形成

分類 (5件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝学研究法  (EC01020N) ,  魚類  (FH02020K) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (75件)：

• Fisheries Bureau, Department of Agriculture of China. China Fishery Statistical Yearbook; Fisheries Bureau, Department of Agriculture of China: Beijing, China, 2018.
• Zhou, J. Study on endocrine mechanism of earlier gonadal maturation in cultured large yellow croaker, Pseudosciaena crocea. Master’s Thesis, State Oceanic Administration, Xiamen, China, 2001.
• Zhang, W.; Wan, H.L.; Jiang, H.; Zhao, Y.L.; Zhang, X.W.; Hu, S.N.; Wang, Q. A transcriptome analysis of mitten crab testes (Eriocheir sinensis). Genet. Mol. Biol. 2011, 34, 136-141.
• Waiho, K.; Fazhan, H.; Shahreza, M.S.; Moh, J.H.Z.; Noorbaiduri, S.; Wong, L.L.; Sinnasamy, S.; Ikhwanuddin, M. Transcriptome Analysis and Differential Gene Expression on the Testis of Orange Mud Crab, Scylla olivacea, during Sexual Maturation. PLoS ONE 2017, 12.
• Qiu, G.-F.; Ramachandra, R.K.; Rexroad, C.E.; Yao, J. Molecular characterization and expression profiles of cyclin B1, B2 and Cdc2 kinase during oogenesis and spermatogenesis in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). Anim. Reprod. Sci. 2008, 105, 209-225.

タイトルに関連する用語 (6件)： トランスクリプトーム ,  大型 ,  精子形成 ,  精巣 ,  発達 ,  形質