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J-GLOBAL ID：202102258296494287   整理番号：21A2363547

トランスクリプトーム解析によるBrachypodium distachyon(L.)Beauv.における塩ストレス応答遺伝子のスクリーニング【JST・京大機械翻訳】

Screening of Salt Stress Responsive Genes in Brachypodium distachyon (L.) Beauv. by Transcriptome Analysis

著者 (6件)： Guo Xiuxiu ,  Wang Qingjun ,  Liu Yuan ,  Zhang Xuejie ,  Zhang Luoyan ,  Fan Shoujin
資料名： Plants (Web)  (Plants (Web))
巻： 9  号： 11  ページ： 1522  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7261A  ISSN： 2223-7747  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 最も一般的な非生物的ストレスの1つとして,塩ストレスは作物収量を著しく損なう。Brachypodium distachyon(L.)Beauv.は,コムギおよび他の草本を研究するためのモデル種である。本研究では,異なる濃度のNaClで24時間処理したB.distachyonの生理学的応答を測定した。したがって,200mMのNaClで24時間処理したB.distachyonの対照と実生をトランスクリプトーム分析のために選択した。トランスクリプトーム差異分析は,合計4116の差次的発現遺伝子(DEG)が認識され,3120の上方制御と996の下方制御されたものを含むことを示した。GO濃縮アッセイは,活性酸素除去システム,浸透圧調節物質代謝,およびアブシジン酸(ABA)誘導気孔閉鎖に関連する遺伝子のいくつかのサブセットが塩ストレス下で有意にアップレギュレートされることを示した。MapMan分析は,アップレギュレートされた遺伝子がワックス代謝経路で劇的に濃縮されていることを明らかにした。MYB,bHLH,およびAP2/ERFのような転写因子(TF)ファミリーメンバーの発現は塩ストレス下で増加し,塩ストレスに対する植物の応答を調節する。まとめると,これらの知見は,塩ストレスに対する牧草作物の応答の根底にある機構への貴重な洞察を提供する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 牧草 ,  農作物 ,  塩化ナトリウム ,  *遺伝子 ,  コムギ ,  ワックス ,  代謝経路 ,  実生 ,  作物収量 ,  *スクリーニング ,  転写因子 ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： *塩分ストレス ,  非生物的ストレス ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Brachypodium distachyon ,  塩ストレス ,  生理反応 ,  トランスクリプトーム解析 ,  ワックス生合成

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (101件)：

• Wang, R.; Wang, X.; Liu, K.; Zhang, X.; Zhang, L.; Fan, S. Comparative transcriptome analysis of halophyte Zoysia macrostachya in response to salinity stress. Plants 2020, 9, 458.
• Wang, N.; Qian, Z.; Luo, M.; Fan, S.; Zhang, X.; Zhang, L. Identification of salt stress responding genes using transcriptome analysis in green alga Chlamydomonas reinhardtii. Int. J. Mol. Sci. 2018, 19, 3359.
• Zhang, X.; Yao, Y.; Li, X.; Zhang, L.; Fan, S. Transcriptomic analysis identifes novel genes and pathways for salt stress responses in Suaeda salsa leaves. Sci. Rep. 2020, 10, 4236.
• Flowers, T.J.; Colmer, T.D. Salinity tolerance in halophytes. New Phytol. 2008, 179, 945-963.
• Yuan, F.; Lyu, M.-J.A.; Leng, B.; Zhu, X.; Wang, B. The transcriptome of NaCl-treated Limonium bicolor leaves reveals the genes controlling salt secretion of salt gland. Plant Mol. Biol. 2016, 91, 241-256.

タイトルに関連する用語 (5件)： トランスクリプトーム解析 ,  Brachypodium ,  塩 ,  ストレス応答遺伝子 ,  スクリーニング