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J-GLOBAL ID：202102259710164525   整理番号：21A2344443

HCV RNA依存性RNAポリメラーゼにおけるアロステリック結合部位の構造動力学への洞察【JST・京大機械翻訳】

Insights into structural dynamics of allosteric binding sites in HCV RNA-dependent RNA polymerase

著者 (5件)： Mittal Lovika (Drug Discovery Research Center (DDRC), Translational Health Science and Technology Institute (THSTI), Faridabad, India) ,  Kumari Anita (Drug Discovery Research Center (DDRC), Translational Health Science and Technology Institute (THSTI), Faridabad, India) ,  Suri Charu (Drug Discovery Research Center (DDRC), Translational Health Science and Technology Institute (THSTI), Faridabad, India) ,  Bhattacharya Sankar (Vaccine and Infectious Disease Research Center (VIDRC), Translational Health Science and Technology Institute (THSTI), Faridabad, India) ,  Asthana Shailendra (Drug Discovery Research Center (DDRC), Translational Health Science and Technology Institute (THSTI), Faridabad, India)
資料名： Journal of Biomolecular Structure and Dynamics  (Journal of Biomolecular Structure and Dynamics)
巻： 38  号： 6  ページ： 1612-1625  発行年： 2020年 
JST資料番号： W5935A  ISSN： 0739-1102  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 慢性感染を解決するウイルスRNA依存性RNAポリメラーゼ(RdRp)の阻害は,C型肝炎ウイルス(HCV)に対する有用な治療戦略である。RdRpの非ヌクレオシド阻害剤(NNI)は,酵素上のアロステリック部位と密接に結合する小分子であり,それによりポリメラーゼ活性を阻害する。多数の結晶構造(176)を,異なるアロステリック部位でのHCV RdRpとNNIの間の阻害と耐性の機構と共に構造活性相関を確立するために研究した。構造と関連動力学は,蛋白質の機能を理解するための青写真である。NNI結合におけるRdRpの可能な局所および大域的特性を抽出するために,リガンドベースのファーマコフォアおよび分子動力学シミュレーションを行い,既知の活性により構造-動的特徴を得た。これらの結果から,NNI結合は酵素活性に重要な原子レベルで顕著な変動を誘導し,最小の全体的構造変化を有することを示唆した。異なる部位でのNNIの相互作用の残基ごとのマッピングは,重要なアミノ酸と水分子の幾つかの保存された相互作用パターンを示した。ここでは,NNIの遺伝子型特異的合理的設計に有用な,蛋白質サブドメインの動力学と分子レベルでの機能の間の相関を理解するために,構造洞察を検討した。Ramaswamy H.Sarmaによって共用した。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 結晶構造 ,  シミュレーション ,  相互作用 ,  アミノ酸 ,  *RNAポリメラーゼ ,  酵素活性度 ,  タンパク質 ,  ヌクレオシド ,  *結合部位 ,  *RNAレプリカーゼ ,  小分子 ,  C型肝炎ウイルス
準シソーラス用語： アロステリック部位 ,  ファーマコホア ,  残基 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： アロステリック部位 ,  遺伝子型 ,  リガンドに基づく薬理作用団 ,  突然変異 ,  分子動力学(MD)シミュレーション ,  非ヌクレオシド阻害剤(NNI)

分類 (2件)： ウイルスの生化学  (EG04030F) ,  酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (5件)： HCV ,  RNA依存性RNAポリメラーゼ ,  結合部位 ,  構造動力学 ,  洞察